Hafta XII PCR Temelli Genetik Analiz Yaklamlar DNA

Hafta XII PCR Temelli Genetik Analiz Yaklaşımları DNA FRAGMENT ANALİZİ Prof. Dr. Hilâl Özdağ

DNA FRAGMENT ANALİZİ Ø STR/SSR/Microsatellit Analizi Ø Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) Ø Restriction Fragment Length Polymorphism (RFLP) Ø Loss of Heterozygosity (LOH) Ø MI (Microsatellite Instability) Ø SNP Genotipleme

DNA FRAGMENT ANALİZİ Ø Boy tayini Ø Agaroz jel elektroforezi Ø Agaroz Ø Nu. Sieve Ø Metaphor Ø Poliakrilamid jel elektrofezi Ø Kapiller elektroforez Ø Genetik analizör (Otomatik DNA Dizi Analiz Sistemi) Ø Qiagen Egene Ø Agilent Bioanalyzer

DNA FRAGMENT ANALİZİ Ø Boy tayini Ø Agaroz jel elektroforezi Ø Agaroz Ø Nu. Sieve Ø Metaphor Johnson N et al, BMC Med Gen. , 2004, 5 http: //www. med. yale. edu/genetics/ward/tavi/p 15. html

DNA FRAGMENT ANALİZİ Ø Boy tayini Ø Agaroz jel elektroforezi/PAGE http: //www. med. yale. edu/genetics/ward/tavi/p 15. html

DNA FRAGMENT ANALİZİ Ø Boy tayini Ø PAGE ANALYTICAL BIOCHEMISTRY 253, 130– 132 (1997) http: //www. med. yale. edu/genetics/ward/tavi/p 15. html

DNA FRAGMENT ANALİZİ Kapiller Elektroforez Genetik Analizör

DNA FRAGMENT ANALİZİ Kapiller Elektroforez Genetik Analizör STR/Microsatellite Analysis RFLP/AFLP/TRFLP

DNA FRAGMENT ANALİZİ 10 pleks

DNA FRAGMENT ANALİZİ Fragment boylarının tespiti

DNA FRAGMENT ANALİZİ Elektroferogramların karşılaştırılması

DNA FRAGMENT ANALİZİ LOH Heterozigot PCR

DNA FRAGMENT ANALİZİ LOH

DNA FRAGMENT ANALİZİ QIAxcel/EGene Ø 0. 5 kb’den küçük fragmentler için 3 -5 bç’ine dek ayırım sağlar. Ø Hazır kapiller kartuşlarının içindeki polimerin içinde çok düşük konsantrasyonda Et. Br bulunmaktadır. Ø %2 agaroz Aynı anda 96 örneğe kadar analizi gerçekleştirmek mümkündür. Ø Sistemde RNA analizi yapmak da mümkündür.

DNA FRAGMENT ANALİZİ Agilent/Bioanalyzer

DNA FRAGMENT ANALİZİ Agilent/Bioanalyzer