Grundlggande mikrobiologi l Torbjrn Kjerstadius Klinisk mikrobiologi Centralsjukhuset

Grundläggande mikrobiologi l Torbjörn Kjerstadius Klinisk mikrobiologi Centralsjukhuset Karlstad

Smittämnet och värden l Värden - barriärer - immunförsvar - psykisk och fysisk balans l Smittämnet - virulens - mängd - andra faktorer

Smittvägar 1 l Direkt person- till personsmitta – luftburen, t ex vattkoppor, mässling – kontaktsmitta, t ex brottarherpes – sexuellt överförd smitta, t ex klamydia

Smittvägar 2 l Indirekt smitta från en människa till en annan – Indirekt kontakt genom föremål, ytor etc, t ex S aureus, influensa etc – Vatten- och livsmedelsburen smitta, t ex salmonella, hepatit A – Blodsmitta, t ex hepatit B, HIV – Vektorburna smittor, t ex malaria

Smittvägar 3 l Omgivningssmitta (från miljön) – t ex legionärssjuka, stelkramp – Vektorburna smittor från miljökällor och djur, t ex borrelios Källa: Ekdahl K och Giesecke J (red), Smittskyddsboken, Studentlitteratur 2003

Hur förhindra smittspridning?

Diagnostiska metoder 1 l Odling (bakterier, svamp) - Fasta medier - Flytande medier De flesta patogena bakterier och svampar är möjliga att odla. Tidskrävande 2 dygn - veckor. Billig.

Diagnostiska metoder 2 l Direktpåvisning - Direktmikroskopi, vanligen efter färgning (gram-, metylenblå-, acridinorange-, blankofor-färgning) Kräver minst 104 bakterier/m. L. Snabb. - Immunfluorescens med monoklonala antikroppar (t ex Legionella, influensa). Snabb. Relativt dyr. Arbetskrävande.

Diagnostiska metoder 3 l Serologi - Påvisa antigen (dvs smittämnet eller del av smittämnet, t ex HBs. Ag) - Påvisa antikroppar mot smittämnet (Ig. G, Ig. M, Ig. A)

Diagnostiska metoder 4 l Påvisa smittämnets arvsmassa (DNA, RNA) - PCR-teknik Mycket känslig. Relativt snabb. Dyr. Risk för kontamination. - Andra ”DNA/RNA-tekniker” (hybridisering, LCR)

Grundläggande bakteriologi, Indelning Gramfärgning (positiv - blå, negativ - röd) l Utseende (kock, stav, spiroket etc) l Växtsätt (klasar, kedjor, par osv) l Växtkrav (aerob, anaerob, mikroaerofil osv) l Speciella krav på näring (cystein etc) l

Grampositiva kocker l Aeroba Stafylokocker S aureus Koagulasnegativa (KNS): S epidermidis S saprofyticus S lugdunensis l Enterokocker E faecalis E faecium l Anaeroba Peptostreptokocker Peptokocker Streptokocker Betahemolytiska gr A (S pyogenes) grupp C grupp G gr B (S agalactie) Alfahemolytiska ”viridans” pneumokocker Ej hemolytiska

Gramnegativa kocker l Aeroba Neisseria meningitidis gonorrhoeae ”svalgneisseria” l Moraxella catarrhalis l Anaeroba Veillonella spp

l l Grampositiva stavar Aeroba Bacillus anthracis cereus spp Corynebacterium diphteriae spp (”difteroida stavar”) Erysipelothrix rhusiopatiae Arcanobacterium haemolyticum Listeria monocytogenes Lactobacillus spp Anaeroba Clostridium perfringens difficile tetanii

l Gramnegativa stavar Aeroba Enterobacteriaceae Övriga Escherichia coli Pseudomonas aeruginosa Klebsiella pneumoniae Haemophilus influenzae oxytoca parainfluenzae Enterobacter aerogenes Legionella pneumophila cloacae Francisella tularense Proteus mirabilis Pasteurella multocida vulgaris Bordetella pertussis Morganella morganii parapertussis Salmonella Typhi Mikroaerofila Paratyphi Campylobacter spp enterica ssp Helicobacter pylori Shigella spp Yersinia enterocolitica Anaeroba pestis Bacteroides fragilis spp Fusobacterium spp

Ej i gramfärgningsschemat tuberculosis leprae l Chlamydia trachomatis pneumoniae psittaci l Mycoplasma pneumoniae l Treponema pallidum l Borrelia burgdorferi recurrentis l Nocardia spp l Mycobacterium

VIRUS, INDELNING Arvsmassa (RNA eller DNA) l Storlek l Utseende (geometriskt arrangemang) l Förekomst/ej förekomst av hölje l

RNA-virus 1 l Picornavirus Enterovirus (Hepatit A, polio, Coxsackie, Echo) Rhinovirus l Calicivirus Norovirus, Sapovirus l l Reovirus Togavirus Rotavirus Rubella l Flavivirus l Retrovirus Gula febern, Dengue, TBE Hepatit C HIV 1 och 2 HTLV 1 och 2 l Hepatit E-virus

RNA-virus 2 l Ortomyxovirus Influensa A, B, C Paramyxovirus Parotit, Morbilli Parainfluensa, RS-virus l Rhabdovirus Rabiesvirus l Filovirus Marburg-, Ebolavirus l Bunyavirus Hantavirus, Sandmyggefeber l Arenavirus Lassavirus m fl l l Coronavirus ÖLI/gastroenteritvirus

DNA-virus l Parvovirus B 19 l Papovavirus Vårtvirus l Adenovirus ÖLI, konjunktivit, GE, meningit l Hepadnavirus Hepatit B l Herpesvirus Herpes simplex 1 & 2 (HSV) Humana herpesvirus (HHV) Varicella-zostervirus (VZV) Cytomegalovirus (CMV) Epstein-Barrvirus (EBV) l Poxvirus Variola, Vaccinia, Molluscum

”Parasiter” Malaria (Plasmodium spp) l Entamoeba histolytica l l Giardia intestinalis l Toxoplasma gondii l Acanthamoeba

Masksjukdomar 1 l Nematoder Springmask (Enterobius vermicularis) (rundmaskar) Spolmask (Ascaris lumbricoides) Hund/kattspolmask (Toxocara) Piskmask (Trichuris trichiura) Hakmask (Ancylostoma duodenale / Necator americanus) Blodfilaria (Wucheria bancrofti / Brugia malayi) Loa-loa Onchocerca volvulus Dracunculus medinensis

Masksjukdomar 2 l Cestoder Taenia saginata (Nötbandmask) (bandmaskar)Taenia solium (Svinbandmask) Diphyllobotrium latum (Fiskbinnikemask) Hymenoleis nana (Dvärgbinnikemask) Echinococcus l Trematoder Schistosoma (flundror) Lever/lungflundror (Chlonorchis sinensis - kinesisk levermask, Fasciola hepatica - leverflundra, Paragominus vestermani lungflundra, m 6 fl).

PRIONER l Annorlunda smittprincip ”proteiner som kan förökas utan arvsmassa” l Svårt att destruera. Tål hög temperatur. l ”Galna ko-sjukan”, Scrapie hos får Creutzfeldt-Jakobs-liknande hos människa Kuru