GENMICA Y SU APLICACIN EN BOVINOS DR Remigio
GENÓMICA Y SU APLICACIÓN EN BOVINOS DR. Remigio Espinosa Veracruz, Noviembre 2009
GENOMA CROMOSOMAS ADN LAS PROTEÍNAS FORMAN LA ESTRUCTURA DE LA VIDA Y ACTÚAN EN FORMA COLECTIVA PARA DETERMINAR EL CÉLULA LOS GENES CONTIENEN INSTRUCCIONES PARA PRODUCIR PROTEÍNAS
Usar la información genómica para la selección genética es el sueño que tuvieron los genetistas durante mucho tiempo
El proyecto de secuencia del ganado bovino fue realizado con vacas Hereford y tomo 6 años en analizarse e involucró a mas de 300 científicos de 25 países
ES POSIBLE EN LA GANADERÍA LECHERA POR……. . 3 RAZONES: 1. El banco de datos de genotipo CDDR 2. La información de pruebas de progenie de mas de 50 años 3. La capacidad computacional actual, gran avance tecnológico Reproductive status of Holstein and Jersey cows in the United States H. D. Norman, 1 J. R. Wright, S. M. Hubbard, R. H. Miller, and J. L. Hutchison Animal Improvement Programs Laboratory, Agricultural Research Service, USDA, Beltsville, MD 20705 -2350 20 million breedings during >8 million lactations of >5 million cows in >23, 000 herds. JDS 92: 3517 -3528
¿Que son las evaluaciones Genómicas? • Son evaluados 40, 000 marcadores genéticos (SNPs) single nucleotide polymorphism “SNIP” • Para cada SNP, es estimada la diferencia de la habilidad predicha de transmisión (HPT=PTA) entre los animales con un alelo comparado con otro • La evaluación Genómica combina el efecto de os SNP y se estima con el promedio paterno existente o los PTA de cada animal
Contribuidores al CCDR (Cooperative Dairy DNA Repository) ¡Sólo los 8 centros originales participantes de IA tiene permitido someter machos para genotipo durante los próximos cinco años! – CRI – Select Sires – Alta – Accelerated – Taurus – ABS – Semex
PROGRESO DE LA GENÓMICA • Pruebas de enero 2009, primera vez que se publican toros “genómicos” ”El cambio mas grande de la industria después del semen congelado” -Toros con alto Mérito Neto, nunca antes visto por la industria ¡W ow !
TERMINOLOGÍA GENÉTICA ANTERIOR ü Habilidad predicha de transmisión (PTA) y el promedio de los padres (PA) -PTA- Progenie -PA- Promedio de los padres -Genómica- no requiere datos, pero se adicionan en la prueba üConfiabilidad -La confiabilidad de PA no podía exceder el 50% por el muestreo al azar de genes de cada padre - La genómica puede aumentar el %
GENÓMICA VS. PTA TRADICIONAL üEl genotipo es una fuente de información como los padres, progenie y registros. üEl PTA oficial tendrá un indicador si incluye una contribución genómica (G) üUn genotipo es utilizado para calcular las evaluaciones genómicas para los 29 rasgos üLas evaluaciones genómicas son utilizadas de la misma manera que el PTA tradicional
Vaquillas Hermanas Completas en el hato Genesis Moet Promedio Padres Ta Nombre Toro MN JELL DISON 374 3. 3 1. 5 ** JILL DISON 374 3. 3 1. 5 * JULL DISON 374 3. 3 1. 5 **** DEE BUCKEYE 436 1. 9 2. 1 *** DOTTY BUCKEYE 436 1. 9 2. 1 ***** Vid. Prod. sa Prñ. Fenotipo Hijas
LOS RESULTADOS GENÓMICOS Nombre G-MN Dif. G-VP Dif. G-Tipo Dif JELL 539 165 4. 7 1. 4 1. 1 -0. 4 JULL 510 136 4. 2 0. 9 1. 5 0 JILL 329 -45 3 -0. 3 1 -0. 5 DEE 309 -127 3. 5 1. 6 1. 4 -0. 7 DOTTY 85 -351 -1. 4 -3. 3 1 -1. 1
¡IMPORTANTE! La Genómica ha cambiado los programas tradicionales permitiendo un progreso genético mucho más rápido
ILLUMINA BOVINE SNP 50 GENOTYPING BEADCHIP Hoy cuesta $225 por animal
TOROS CON GENOTIPO ALREDEDOR DEL MUNDO desde Enero 2009 Paises Estados Unidos y Canada Francia Holanda, Nueva Zelanda e Irlanda Alemania Australia Dinamarca, Finlandia, Suecia Animales 22, 344 8, 500 6, 000 4, 500 3, 000 2, 000
ANIMALES CON GENOTIPO(n=25, 393) En Estados Unidos hasta Abril 2009
ANIMALES PREDICTORES RAZA Holstein Jersey Pardo Suizo TOROS 7, 600 1, 807 655 VACAS 2, 711 337 41 Total 10, 311 2, 144 696
El Semental perfecto • En Suiza nos muestran la selección GENÓMICA http: //videoportal. sf. tv/video? id=51 bbae 2 fa 5 f 9 -461 d-8 c 54 -f 832020 cd 866
EFECTO DE LOS SNP PARA PRODUCCIÓN DE LECHE O´Connell, 2008
Beltsville BARC Show Hide Left Navigation Marker Effects Menu : Home : About : Help : Contact Us : En Español : SNP Marker Effects for Holstein or Red & White Marker Effects Brown Swiss Holstein or Red & White Jersey Calculated August 2009
DISEÑO EXPERIMENTAL Holstein, Jersey y Pardo Suizo HOL JER Predictor: Toros nac. <2000 4, 422 1, 149 Vacas con datos 947 212 Total 5, 369 1, 361 Predicho: Toros nac. >2000 2, 035 388 BSW 472 40 512 150 Datos del 2004 utilizados para predecir datos independientes del 2009
PRUEBAS GENÓMICAS Toros jóvenes de E. U. con código NAAB, Abr. 2009 Año de Toros nacimiento muestreados probados 2008* 649 615 Probados Genomicamente % 95 2007* 1548 1172 76 2006 1726 1118 65 2005 1677 1217 73 2004 1655 991 60 * 2007 -2008 conteos incompletos
USOS POTENCIALES PARA LOS PRODUCTORES Identificación posibles reemplazos • Animales genéticamente superiores • Identificación de recesivos indeseables • Verificación de parentesco • Valor añadido a ventas de hembras • Cruzamientos dirigidos, perfil de DNA “complementario”
SELECCIÓN • La selección genómica de hembras jóvenes será una herramienta importantísima para el ganadero. • El servicio de tipificación ya se puede solicitar en algunos países
POSIBILIDADES DE RASGOS NUEVOS NO EVALUADOS • Consumo de alimento • Nivel hormonal • Grado de Inmunidad • Cuidado de pezuñas • Etc
DE EVALUACIÓN GENÓMICA A PRUEBA CON HIJAS Los datos de evaluación genómica se obtuvieron en Enero y las pruebas con hijas son de Abril 2009 56 Toros 40 hijas en promedio, rango de 10 a 91 RASGO Leche Grasa Proteína Vida Productiva DPR Fac. de Parto PTA TIPO $MNV CONF. PROMEDIO -74 -3 -1 -0. 5 0. 0 0 -0. 07 -37 10 CAMBIO MAX MIN 412 9 11 0. 8 0. 7 1. 0 0. 19 41 17 -612 -18 -15 -2. 0 -0. 8 -1. 0 -0. 60 -188 1
El Genoma en el Ganado de Carne
Instituciones y Organismos • USDA 35 MILL DE DÓLARES • Baylor College of Medicine, Houston, Texas • Instituto Nacional de Salud, Dr. Raynard Kington • Instituto de Genética Humana en la Universidad de München, Alemania. • Universidad de Washington, Departamento de Ciencia Animal y Escuela de Ciencias biológicas.
El Cromosoma 14 q El cromosoma 14 (BTA 14) ha sido explorado para distintos locis de rasgos cuantificables (QTL) y genes de importancia económica tanto en ganado de leche como de carne. q En la Universidad de Washington, más de 40 investigadores encontraron cerca de 126 QTL para el genoma del ganado de carne. La mayoría encontrados de la región 15 a la 45 del cromosoma. q Rasgos de importancia económica:
El Cromosoma 14 q Rasgos de importancia económica: üGanancia diaria promedio pre-destete (Pr. WADG) üGanancia diaria promedio post-destete (Po. WADG) üPeso al nacimiento (BW) üPeso de la canal (CW) üEspesor de grasa dorsal (BFT) üMarmoleo (BMS) üPromedio de peso corporal (ABW) üCalidad de canal (EQT) üTasa de crecimiento (GR) üArea del Rib eye (REA)
Smart. Gene para Carne Es un proyecto que proporciona información para la evaluación genética en la industria de carne en Australia, proporciona nuevos EBVs e incrementa la confiabilidad de algunos valores de cruzamiento.
GRACIAS POR SU ATENCIÓN Dr. Remigio Espinosa G. respinosa@reproduccionanimal. com. mx
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