GENETK TANI YNTEMLER Genetik Tan Yntemleri Genetik Tan

  • Slides: 13
Download presentation
GENETİK TANI YÖNTEMLERİ

GENETİK TANI YÖNTEMLERİ

Genetik Tanı Yöntemleri

Genetik Tanı Yöntemleri

Genetik Tanı Yöntemleri

Genetik Tanı Yöntemleri

Genetik Tanı Yöntemleri

Genetik Tanı Yöntemleri

PCR Problemleri

PCR Problemleri

PCR l PCR sonuçlarının iyi çıkması için optimizasyonu gerekir http: //academic. brooklyn. cuny. edu/biology/bio

PCR l PCR sonuçlarının iyi çıkması için optimizasyonu gerekir http: //academic. brooklyn. cuny. edu/biology/bio 4 fv/page/genetic-engin/pcr. html

Örnekler l PCR sorun giderme yolları… t primer spesifikliğini arttırmak t PCR ürün kalitesini

Örnekler l PCR sorun giderme yolları… t primer spesifikliğini arttırmak t PCR ürün kalitesini arttırmak t PCR ürününü arttırmak

l PCR sorun gidermenin kullanılmayacağı yerler… t DNA ekstraksiyonu t recombinant DNA yapmak t

l PCR sorun gidermenin kullanılmayacağı yerler… t DNA ekstraksiyonu t recombinant DNA yapmak t DNA kalitesi

PCR başarısını etkileyen Faktörler l DNA extractionu için kullanılan doku tipi l DNA’nın kalite

PCR başarısını etkileyen Faktörler l DNA extractionu için kullanılan doku tipi l DNA’nın kalite ve kantitesi l Çoğaltılan DNA fragmantının uzunluğu l Primer spesifikliği

PCR Sorun giderme Stratejileri l primer bağlanma sıcaklığını optimize etmek Cycle Temperatures Reasoning 94

PCR Sorun giderme Stratejileri l primer bağlanma sıcaklığını optimize etmek Cycle Temperatures Reasoning 94 o - 55 o - 72 o İyi eşleşme 94 o - 48 o - 68 o zayıf 94 o - 45 o - 65 o “avlama” 94 o - 40 o - 65 o Primer çalışıp çalışmadığını kontrol etmek için?

Sorun giderme l Uzamış annealing zamanı t template DNA’ya tutunması için primerlere daha uzun

Sorun giderme l Uzamış annealing zamanı t template DNA’ya tutunması için primerlere daha uzun süre verme t PCR ürün kalitesini arttırma! t Azalan primer specifikliği artan smear bandlara yolaçar

Sorun giderme l Aşamalı olarak annealing ve extension sicaklığını arttırmak yada azaltmak t Taq

Sorun giderme l Aşamalı olarak annealing ve extension sicaklığını arttırmak yada azaltmak t Taq polymerase optimum extension sicaklığında daha iyi çalışır t Final extension aşaması gerekebilir

Sorun giderme l Diğer parametreler: t Magnesium Chloride (Mg. Cl 2) concentration t DNA

Sorun giderme l Diğer parametreler: t Magnesium Chloride (Mg. Cl 2) concentration t DNA template concentration t d. NTP concentration t Primer concentration