Fibrosi cistica Calcolo del rischio in situazioni insolite

Fibrosi cistica Calcolo del rischio in situazioni “insolite”

Domande: Intestino iperecogeno: rischio di FC nelle seguenti situazioni - 2 genitori negativi al pannello standard - 1 genitore negativo al pannello standard - 2 genitori negativi per DGGE - 1 genitore negativo per DGGE - feto Hz al pannello standard - feto Hz per DGGE

Domande: IRT (immuno reactive tripsinogen): rischio di FC nelle seguenti situazioni - negativo a pannello standard - Hz per DGGE

Premesse 1. E’ necessario avere i parametri di base 1. Frequenza gene FC (1/50) 2. Detection rate per pannello standard 1. La DR dello stesso pannello può essere differente per “origini” differenti 3. Detection rate per DGGE ( Resta poi insoluto il quesito se mutazioni non identificate con PS o DGGE siano capaci di essere responsabili di alcuni quadri clinici )

Premessa Bisogna conoscere il calcolo delle probabilità. Probabilità di estrarre da un mazzo di carte 1 Asso? 4/40 = 1/10 Probabilità di estrarre da un mazzo di carte 1 carta di denari? 10/40 = 1/4 Probabilità di estrarre da un mazzo di carte 1 di denari? 1/40 = ¼ * 1/10

Bisogna conoscere tutte le alternative e le Probabilità a priori [P(Hi)] per ogni alternativa. La somma di [P(Hi)] deve essere eguale a 1. Si utilizza una (o più) informazione supplementare non inclusa nella probabilità a priori (probabilità condizionale [P(E|Hi)]). Per ciascuna la somma per le varie alternative non deve essere eguale ad 1. In ogni colonna si ottine il prodotto delle probabilità e si ottiene la probabilità congiunta. Si divide quindi ogni probabilità congiunta per la somma si tutte le probabilità congiunte (probabilità finale). La somma delle probabilità finali deve essere eguale a 1.

Es. in una famiglia in cui vi sono due fratelli sani ed uno affetto da FC. Qual è la probabilità per ogni fratello di essere HZ? Aa AA Aa Aa Aa aa Essendo sani, possono solo avere genotipo AA, Aa, cioè 2/3.

In realtà il calcolo che noi facciamo è: Alternativa Oz AA Hz Aa Oz aa P. A priori ¼ ½ ¼ P. Condizionale (no FC) 1 1 0 P. Congiunta ¼ ½ 0 P. Finale ¼/( ¼ + ½ ) ½/( ¼ + ½ ) ¼/¾ ½/¾ 1/3 2/3 (¼+½+¼)=1 (1/3+2/3)=1

Probabilià di FC in caso di intestino iperecogeno ed Hz per mutazione FC (DR = 0. 85) Alternativa FC non FC P. A priori 3/100 97/100 P. Condizionale (1 mutazione) 25. 5/100 3. 4/100 (. 85*. 15)*2 1/25*. 85 P. Congiunta P. Finale 76. 5/10000 76. 5 (76. 5 + 329. 8) 0. 19 329. 8/10000 329. 8 /(76. 5 + 329. 8) 0. 81

1000 feti con EB 3% con FC 97% senza FC 30 feti affetti da FC 970 sani 85% detection rate 72. 2% con 2 Mut. Identif. 21. 7 25. 5% con 1 Mut. identif. 7. 65 2. 25% con 0 Mut. identif. 0. 65 (4% Hz=38. 8) 85% DR 38. 8 * 0. 85 =33 33 Feti con FC ed 1 m = 7. 65/(7. 65+33) = 18. 8%

Probabilià di FC in caso di intestino iperecogeno ed Hz per mutazione FC (DR = 0. 95) Alternativa FC non FC P. A priori 3/100 97/100 P. Condizionale (1 mutazione) 9. 5/100 3. 8/100 (. 95*. 05)*2 1/25*. 95 P. Congiunta 28. 5/10000 368. 6/10000 P. Finale 0. 07 0. 93

Probabilià di FC in caso di intestino iperecogeno ed nessuna mutazione FC (DR = 0. 85) Alternativa FC non FC P. A priori 3/100 97/100 2. 25/100 1 P. Condizionale (1 mutazione) (. 15*. 15) P. Congiunta P. Finale 6. 75/10000 97/100 6. 75/9706. 75 9700/9706. 75 0. 0006 1/1478 0. 9994 1477/1478

Probabilià di FC in caso di intestino iperecogeno ed nessuna mutazione FC (DR = 0. 95) Alternativa FC non FC P. A priori 3/100 97/100 P. Condizionale (1 mutazione) 25/10000 1 (. 05*. 05) P. Congiunta P. Finale 0. 75/10000 97/100 0. 75/9700. 75 9700/9700. 75 0. 00007 1/12974 0. 99993 12973/12974

Probabilità di FC in base al genotipo parentale (DR=. 85) AA AA Aa* Aa . 96 0. 035 0. 005 AA ½ Aa* 0. 0168 ½ AA ½ Aa* 0. 0168 ¼ AA, ½ Aa*, ¼ a*a* ¼ AA, ¼ Aa* 0. 00004 ¼ aa* 0. 00004 ½ AA ½ Aa ¼ AA, ¼ Aa*, ¼ aa* ¼ AA, ¼ Aa, ¼ aa 0. 96 Aa* 0. 035 Aa 0. 005

Probabilità di FC se è identificato Int. Eperecogeno (3/100) e una mutazione (0. 0023) sulla probabilità di essere Hz (1/25) sulla probabilità di non avere FC 0. 03 * 0. 0023 / 0. 0004 0. 03 * 0. 0023/0. 0004 + 0. 97*0. 9977/0. 9996 0. 1725 + 0. 9674 15% -