FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI transacting factors fattori

FATTORI DI TRASCRIZIONE NEGLI EUCARIOTI ( trans-acting factors = fattori che agiscono in trans ) Possono essere distinti in: - Fattori generali - Attivatori inducibili

Gli attivatori inducibili legano: elementi di risposta che identificano gruppi di promotori, o enhancer soggetti a controllo coordinato Agente regolatore Modulo Consensus Shock termico Glucocorticoidi Cadmio TPA Siero HSE GRE MRE TRE SRE CNNGCCNNTCCNNG TGGTACAAATGTTCT CGNCCCGGNCNC TGACTCA CCATATTAGG Fattore HSTF Recettore ? AP 1 SRF Grandezza (dalton) 93, 000 94, 000 ? 39, 000 52, 000

Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

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I FATTORI DI TRASCRIZIONE (ATTIVATORI) HANNO UN STRUTTURA “MODULARE” COMPOSTA DA DIFFERENTI DOMINI • legame al DNA • transattivazione • dimerizzazione • legame al ligando

Domini di transattivazione • Domini acidici: es. GAL 4 • Domini ricchi di glutammine: es. Sp 1 • Domini ricchi di proline: es. CTF

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Famiglie di fattori di trascrizione • Dita di zinco (zinc finger) • Omeodominio (elica-giro-elica, HTH) • Elica-ansa-elica (helix loop helix, b. HLH) • Cerniera di leucina (leucine zipper, b. ZIP)

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Terminazione della trascrizione nei procarioti

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Un terminatore intrinseco è costituito da due regioni palindromiche formano una forcina di 7 -20 bp. Lo stelo include una regione ricca in GC ed è seguito da un tratto di U. Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

Terminatori intrinseci (terminazione rho indipendente) . . . A G U UA U G A A A UG CG GC C G G CA C U U A GC A G C G A U A U GC C G C G U A AU A U GC C U U A- OH . . . CCCAGC CCG CC UA AU G A GCGGGCUUU-0 H 3' GGGTCGGGCGGATTACT CGCCCGAAAACT TGTTTT 5' 5' CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTGAACAAAA 3' A UC A U GA CC GC CG CG CG GC. . . C U C CA UUUUUUU -OH AAAAAA A CT TGTTTT 5' 3' GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCG A TT TTTTTT GAACAAAA 3' 5' CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGC AAU C A CG GC CG CG CG GC. . . CCCAUUUU -OH 5' 3' GGGTCGGGCGGATTACTCGCCCGAAAACTTGTTTT CCCAGCCCGCCTAATGAGCGGGCTTTTGAACAAAA 3' 5'

Terminatore rho dipendente Il sito di terminazione è preceduto da una sequenza ricca di C e povera di G Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006

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Antiterminazione

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Attenuazione

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Nei batteri la trascrizione e la traduzione sono accoppiate

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Peptidi "leader" degli operoni "attenuati" codificanti i geni per la sintesi degli amminoacidi

Terminazione negli eucarioti

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La poliadenilazione degli m. RNA eucariotici

CPSF riconosce seq. AAUAAA Cst. F lega GU, stimola CFI, CFII endonucleasi PAP Poli(A) Polimerasi PABP Poly(A) Binding Protein Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006