Fattori di terminazione procarioti eucarioti RF 1 e
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Fattori di terminazione procarioti eucarioti RF 1 e. RF 1 riconoscimento UAA, UAG RF 2 “ riconoscimento UGA, UAA RF 3 e. RF 3 GTPase RRF rilascio
Terminazione
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006
Eventi post-terminazione
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Struttura della puromicina
Inibitori della traduzione
Translation inhibitors Inhibitor Effect Chloramphenicol inhibits prokaryotic peptidyl transferase Streptomycin inhibits prokaryotic initiation, also induces m. RNA misreading Tetracycline inhibits prok. aminoacyl-t. RNA binding to the ribosome small subunit Erythromycin inhibits prokaryotic translocation through the ribosome large subunit Fusidic acid similar to erythromycin only by preventing EF-G from dissociating from the large subunit Puromycin resembles aa-t. RNA, interferes with peptide transfer resulting premature termination in prok and euk Diptheria toxin catalyzes ADP-ribosylation of and inactivation of e. EF-2 Ricin found in castor beans, catalyzes cleavage of the euk. 28 S r. RNA Cycloheximide inhibits eukaryotic peptidyltransferase
Trasporto e localizzazione degli m. RNA
Trasporto nucleo-citoplasma
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Localizzazione degli m. RNA negli eucarioti
Meccanismi di localizzazione • Trasporto specifico • Degradazione selettiva • Ancoraggio a siti specifici
Trasporto degli m. RNA nell'oocita di Drosophila
Trasporto degli m. RNA nell'oocita di Drosophila
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Il trasporto specifico dipende da sequenze cis-agenti presenti nel 3' UTR dell'm. RNA (zip code) e da fattori trans-agenti
Granuli citoplasmatici contenenti m. RNA
Stabilità degli m. RNA
Degradazione dell'm. RNA nei procarioti
Degradazione dell'm. RNA negli eucarioti
Regolazione della stabilità dell'm. RNA negli eucarioti
Vie di degradazione dell'm. RNA negli eucarioti
Controlli di qualità degli m. RNA (surveillance systems)
NMD (Nonsense Mediated Decay) AUG m. Gppp PTC UAG AAAAAAAA
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Non-sense Mediated Decay (NMD): complesso EJC
Non-sense Mediated Decay (NMD)
Non-Stop Mediated Decay (NSMD)
Ruolo del tm. RNA
Ruolo del tm. RNA
Regolazione della traduzione
Transcriptional control Translational control gene m. RNA protein • Slow • Lasting • Transcription-dependent • Rapid • Short-lived • Transcription-independent
Regolazione della traduzione • generale • specifica
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Regolazione generale della traduzione nei procarioti
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Regolazione della traduzione • generale • specifica
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Regolazione della traduzione mediata da un s. RNA regolatore
Regolazione autogena mediante riboswitch
Riboswitch (metabolita)
Riboswitch (temperatura)
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Regolazione della traduzione autogena nei procarioti
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Regolazione della traduzione delle r -proteine nei procarioti
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