Estado nativo N Compactacin ptima Grupos polares en
- Slides: 43
Estado nativo (N) • • Compactación óptima Grupos polares en el exterior Mínima superficie expuesta Anisotropía y baja periodicidad Organización jerárquica de la estructura Flexibilidad óptima Conformación única y cooperativa Mínimo energético
Estado desplegado (U) • Expansión máxima (5 -10 veces el volumen de N) Máxima superficie expuesta al solvente • No existen interacciones preferenciales entre residuos • Infinitas conformaciones • Estado ideal, modelo teórico que describe aproximadamente el comportamiento de muchas proteínas en condiciones fuertemente desnaturalizantes
Estados parcialmente plegados (I) • • • Grupo heterogéneo de conformaciones no nativas Estructura residual secundaria, nativa o no nativa Sin estructura terciaria Tendencia a la agregación Existen como: Precursores cinéticos de N En trazas en equilibrio con N En ausencia de cofactores específicos Resultado de vías muertas del plegamiento
¿Qué relación existe entre N, I y U? • En soluciones fisiológicas N es absolutamente mayoritario • En presencia de urea o cloruro de guanidinio concentrados (agentes caotrópicos), N se desestabiliza y aparecen I y U • Los agentes caotrópicos solubilizan las cadenas laterales haciendo más favorable la interacción con el agua
No se observará I en el equilibrio
Se observará N, I y U en equilibrio
Equilibrium unfolding of IFABP
Nishimura et al J. Mol. Biol. (2005) 351, 383– 392 quenching Met-Trp en la proteína salvaje y no en las mutantes
elipticidad (miligrados) Temperatura (grados centígrados)
IA-2 ec
Differential Scanning Calorimetry (DSC)
4 -10 kcal/mol 0 -200 kcal/mol 100 -400 kcal/mol Los efectos entalpicos y entrópicos contribuyen con fuerza parecida. Además son marcadamente dependientes de la temperatura
¿Cuáles son las contribuciones entrópicas? • La diferencia enorme entre el número de conformaciones permitidas a U y N • El ordenamiento de las moléculas de agua sobre la superficie accesible S=R´ln(w)
¿Cuáles son las contribuciones entálpicas? • Interacciones de van der Waals • Puentes de hidrógeno • Puentes salinos
Átomos en una esfera de radio 5 A centrada en cada átomo (no se incluyen el átomo central ni los unidos covalentemente a él) ESBL
Salvo muy escasas excepciones no existen puentes de hidrógeno sin satisfacer en el interior proteico. Todos son intramoleculares. Son muy pocos los puentes salinos encontrados en el interior proteico. En general desestabilizan a la estructura nativa.
Teoría clásica del efecto hidrofóbico N Entropía conformacional Entropía del solvente Entalpía U
Modelo actual N Entropía conformacional Entropía del solvente Entalpía de solvatación Entalpía del solvente U
H Cp, u ¶H = Cp ¶T U N Cp, n T S C p, u T¶S = Cp ¶T U Cp, n N ln. T G H T S
DG(80ºC)=160 -168=-8 kcal/mol DG(28ºC)=4. 8 -0=4. 8 kcal/mol DG(-20ºC)=-139 -(-132)=-7 kcal/mol
Ermacora Thanks Alberto Podjarny
- Polares y no polares
- Protena similar
- Nada contra o estado
- Todos los osos polares son zurdos
- Moléculas polares
- Velocidade em coordenadas polares
- Coordenadas polares
- Union covalente ejemplos
- Masas polares alternador
- Transformacion de coordenadas polares a rectangulares
- Moleculas polares
- Dot resposta
- Moléculas polares e apolares exemplos
- Aminoacidos que forman puentes de hidrogeno
- Wolfram alpha longitud de arco
- Coordenadas polares integral
- Aminoacidos polares sin carga
- Suma de vectores polares
- Ligações polares
- Estado actual estado deseado
- Site:slidetodoc.com
- El color amarillo
- Grupos nominales 4 primaria
- Resuelve la siguiente actividad
- Nobreza clero e povo
- Elementos de transição e representativos
- Farmacos antiarritmicos clase 1
- Nomenclatura iupac
- Grupos de guilda
- Reunião de oração criativa
- Desventajas de la comunicación interpersonal
- Compostam
- Imagenes de grupos primarios
- H7br nomenclatura
- Cuales son los compuestos hidrogenados
- Reflexões para pequenos grupos
- Generacion nexters
- Diretório de grupos de pesquisa
- Rocha que faz efervescência com o ácido
- Grupos cónicos
- Prioridad de grupos funcionales en quimica organica
- Grupos funcionales de cetona
- J donald phillips
- Alfaro-kellogg