EPGENETK MEKANZMALAR Prof Dr Asuman Sungurolu Ankara niversitesi
- Slides: 15
EPİGENETİK MEKANİZMALAR Prof. Dr. Asuman Sunguroğlu Ankara Üniversitesi Tıp Fakültesi Tıbbi Biyoloji Anabilim Dalı
EPİGENETİK : Primer DNA dizisinde değişiklik olmaksızın, kromatin yapıda gerçekleşen mitoz ve/veya mayoz ile kalıtılabilen gen ekspresyon değişimlerini ifade eder. “Epi” Yunanca’da üzerinde, ilaveten anlamına gelir Epigenesis-----Embriyolojik gelişme ve farklılaşma
Genetics and Epigenetics Nature”s Pen and Pencil set Genom bir insanı diğerinden ayırırken, epigenom veya epigenetik informasyon bir hücre tipini diğerinden ayırır
Epigenetik değişimler DNA metilasyonu Nukleozom yeniden düzenlenmesi RNA interferans Histon modifikasyonları Metilasyon Asetilasyon Fosforilasyon Ubikitinasyon
DNA metilasyonu Genomik imprinting X kromozom inaktivasyonu Retrotranspozon sessizleştirilmesi Sentromer formasyonu
DNA metilasyonu Mobil elemanlara (Endoparasitik DNA) karşı koruma sağlar Junk DNA susturulması-genomik kararlılık ile ilişkilidir İstenmeyen doku spesifik transkripsiyonel aktivite önlenir DNMT knockout -kromozomal yer değiştirmeler DNMT knockout – transpozonlarda reaktivasyon Cp. G kriterleri: >500 bp, GC miktarı >%55
DNA Metilasyonu Sitozine CH 3 grubunun ilavesi ile 5 -metil sitozin oluşur Genomda CG dinükleotidlerinin %70”i metiledir DNA Metil Transferazlar (DNMT) Genin sessizleştirilmesini sağlar SAM (S-Adenozil-L Methionin) = Universal metil grup vericisidir
DNA metilasyonu DNA metiltransferazlar(DNMT 1, DNMT 3 A ve DNMT 3 B) tarafından gerçekleştirilir, DNMT 3 A ve DNMT 3 B erken gelişim döneminde de novo metilasyondan sorumlu iken DNMT 1 hücre bölünmesi sırasında yeni sentezlenen zincire metilasyon modelinin aktarılmasından sorumludur.
DNA Metilasyonu DNA metilasyon paterni hücreden hücreye kalıtılabilir
Histon modifikasyonları Histon proteinlerinin bazik amino terminal uçları nükleozomdan dışarıya çıkıntılar yapar ve posttranslasyonel modifikasyonlar gözlenir Histon asetil transferazlar(HAT) tarafından asetil grubu eklenir Histon metil transferazlar(HMT) tarafından metil grubu ilave edilir.
Histonların lizin amino asitlerinden metilasyonu
Histon modifikasyonları Histon kuyruklarına (-) yüklü asetil gruplarının eklenmesi ile (+) yüklü histon proteinlerinin kısmi (+) yükü azalacağından (-) yüklü DNA’dan uzaklaşır Deasetilasyon ile DNA kompakt yapısını alır ve sessizleşir
Histon modifikasyonları K(Lizin)4 den metilasyon gen aktivasyonu K 9, K 27 metilasyon gen susturulması ile ilişkilidir
Kromatin yeniden modellenmesi Watson, 2004