Enzime n n n n n Ce sunt

  • Slides: 135
Download presentation

Enzime n n n n n Ce sunt enzimele? Nomenclatura enzimelor Caracteristici generale enzimelor

Enzime n n n n n Ce sunt enzimele? Nomenclatura enzimelor Caracteristici generale enzimelor Clasificarea enzimelor Structura enzimelor Specificitatea enzimelor Mecanismul catalizei enzimatice Cinetica enzimatica Cofactori (coenzime, grupari prostetice).

Enzime n n n Definiţie Biocatalizatori proteici care măresc viteza reacţiilor chimice, dar numai

Enzime n n n Definiţie Biocatalizatori proteici care măresc viteza reacţiilor chimice, dar numai pentru reacţiile termodinamic posibile Coordonează toate procesele metabolice Catalizează un număr redus de reacţii, foarte frecvent numai una; se caracterizează printr-o înaltă specificitate Sunt implicate în majoritatea reacţiilor biochimice din celule, fiind importante în diagnostic şi tratament

ai

ai

Enzime Caracteristici Ø Ø Au o To. C si p. H optim de functionare

Enzime Caracteristici Ø Ø Au o To. C si p. H optim de functionare Nu sunt produse sau consumate in timpul unei reactii chimice Nu declanseaza o reactie chimica ci intensifica viteza reactiei chimice Enzimele modifica viteza reactiei dar nu constanta de echilibru a reactiei catalizate.

Enzime Nomenclatura n 2 denumiri: n A. Denumirea recomandată sau comună 1. “- ază

Enzime Nomenclatura n 2 denumiri: n A. Denumirea recomandată sau comună 1. “- ază “ la numele substratului reacţiei Ex. : glucozidază, urează sau 2. la formula care descrie acţiunea desfăşurată Ex. : lactat dehidrogenază, adenilat ciclază n Există enzime care îşi păstrează în continuare formula originală, istorică, neavând legătură cu reacţia catalizată

Enzime n n n B. Denumirea ştiinţifică sau sistematică IUBMB (Uniunea Internaţională de Biochimie

Enzime n n n B. Denumirea ştiinţifică sau sistematică IUBMB (Uniunea Internaţională de Biochimie şi Biologie Moleculară): 6 clase de enzime, fiecare cu mai multe subclase Sufixul “- ază “ este ataşat unei formule descriptive complete a reacţiei chimice catalizate, incluzând denumirea tuturor substraturilor Ex. D-gliceraldehid 3 fosfat: NAD+ oxidoreductaza Denumire prea complexa pt a fi utilizata in practica uzuala

Enzime- clasificare n 1) Oxidoreductazele - enzime ce catalizează reacţiile de oxidoreducere ce au

Enzime- clasificare n 1) Oxidoreductazele - enzime ce catalizează reacţiile de oxidoreducere ce au loc în organismele vii; n Lactat dehidrogenaza n Piruvat Lactat

Enzime- clasificare n n 2) Transferazele - enzime ce catalizează reacţii de transfer ale

Enzime- clasificare n n 2) Transferazele - enzime ce catalizează reacţii de transfer ale unor grupe de atomi (C-, N-, P-) ce pot fi şi grupări funcţionale de la un substrat la altul, fără ca aceste grupări să existe libere în timpul procesului; Serin-hidroximetil transferaza Metilen THF

Enzime- clasificare n n 3) Hidrolazele - enzime ce catalizează scindarea diferitelor legături covalente

Enzime- clasificare n n 3) Hidrolazele - enzime ce catalizează scindarea diferitelor legături covalente din molecula substratului cu participarea moleculelor de apă; + HOH ---- CO 2 + NH 3 ureaza UREE

Enzime- clasificare n n 4) Liazele - catalizează clivarea legăturilor de tip C-C, C

Enzime- clasificare n n 4) Liazele - catalizează clivarea legăturilor de tip C-C, C -S, C-N cu rearanjarea ulterioară a valenţelor; Piruvat decarboxilaza

Enzime- clasificare n n 5)Izomerazele - enzime care catalizează diferite reacţii de izomerizare a

Enzime- clasificare n n 5)Izomerazele - enzime care catalizează diferite reacţii de izomerizare a substratelor;

Enzime- clasificare n n 6)Ligazele sau sintetazele - enzime ce catalizează formarea unor noi

Enzime- clasificare n n 6)Ligazele sau sintetazele - enzime ce catalizează formarea unor noi legături chimice C – C sau C– O, S, N în majoritatea cazurilor utilizându-se energia stocată în legăturile macroergice ale moleculelor de ATP. Piruvat carboxilaza

Enzime

Enzime

Structura enzimelor n n n 2 categorii: 1. formate numai din AA; structură exclusiv

Structura enzimelor n n n 2 categorii: 1. formate numai din AA; structură exclusiv proteică. Ex proteaze, lipaze, ribonucleaze 2. componenta proteică sau APOENZIMA + componenta neproteică sau COFACTOR; majoritatea enzimelor COFACTORI: A. Gruparea prostetică Componenta neproteică legată de apo. E prin legături ferme, stabile, neputându-se desprinde de aceasta. Ex FMN, FAD

Structura enzimelor

Structura enzimelor

Structura enzimelor n COFACTORI: n B. Coenzima n n n Derivat al unei vitamine,

Structura enzimelor n COFACTORI: n B. Coenzima n n n Derivat al unei vitamine, componenta neproteică legată de apo. E prin legături labile Poate trece uşor de la o apo. E la alta NAD+; NADH, H+; NADP+

Structura enzimelor

Structura enzimelor

Structura enzimelor n n n COFACTORI: B. Ionii metalici Sunt necesari pentru activitatea a

Structura enzimelor n n n COFACTORI: B. Ionii metalici Sunt necesari pentru activitatea a numeroase enzime. După modul de legare a şi rolul ionului metalic, enzimele sunt: - metaloenzime ce conţin o cantitate bine definită de ion metalic funcţional, fiind strâns legat de apo. E - enzime metaloactive, a căror activitate creşte în prezenţa ionului metalic, care leagă metalul slab, iar cantitatea acestuia nu este strict delimitată

Structura enzimelor n COFACTORI: Metaloenzime: - Fe-enzime: grup prostetic hem (citocromi, catalaze, peroxidaze); -

Structura enzimelor n COFACTORI: Metaloenzime: - Fe-enzime: grup prostetic hem (citocromi, catalaze, peroxidaze); - Cu-enzime: citocromoxidaza, superoxid-dismutaza, tiroxinhidroxilaza; - Mn-enzime: peptidaza, arginaza, izocitrat-dehidrogenaza; - Co-enzime: cobalamin-enzime; - Se-enzime: glutationperoxidaza

Structura enzimelor

Structura enzimelor

Structura enzimelor n n n Unele enzime necesită pentru a fi active prezenţa coenzimelor,

Structura enzimelor n n n Unele enzime necesită pentru a fi active prezenţa coenzimelor, altele a gruparilor prostetice sau a ionilor metalici In reacţiile catalizate de enzime ce necesită prezenţa coenzimelor, acestea sunt considerate al doilea substrat, fiind numite cosubstrat Modificările pe care le suferă coenzima contrabalansează exact modificările de la nivelul substratului

Cofactori enzimatici

Cofactori enzimatici

Structura enzimelor n Regiunea din enzimă unde se fixează moleculele substratului şi se produc

Structura enzimelor n Regiunea din enzimă unde se fixează moleculele substratului şi se produc reacţiile chimice care transformă aceste molecule se numeşte centru activ.

Centrul activ al enzimelor n O regiune a componentei proteice în care resturile de

Centrul activ al enzimelor n O regiune a componentei proteice în care resturile de AA sunt aranjate astfel încât să permită o interacţiune adecvată cu substratul, numit la modul generic ligand

Centrul activ al enzimelor n n n Complexul ES de la nivelul centrului activ

Centrul activ al enzimelor n n n Complexul ES de la nivelul centrului activ este stabilizat prin: Atracţii electrostatice Legături de hidrogen Interacţiuni hidrofobe După fixarea S la centrul activ al E numeroase resturi laterale AA din vecinătatea ligandului catalizează transformarea acestuia.

Centrul activ al enzimelor n n Centrul activ cuprinde resturi de fixare a S

Centrul activ al enzimelor n n Centrul activ cuprinde resturi de fixare a S cât şi resturi catalitice Centrul activ ocupă o porţiune mică din enzimă şi este o entitate tridimensională Cofactorii joacă un rol important atât în fixarea S cât şi în procesul catalitic S trebuie să aibă o formă potrivită pentru a pătrunde în centrul activ al unei E

Centrul activ al enzimelor n n n 1890 Fisher propune modelul “broască- cheie”: S

Centrul activ al enzimelor n n n 1890 Fisher propune modelul “broască- cheie”: S trebuie să se potrivească perfect la centrul activ pentru a suferi procesul catalitic Fisher

Centrul activ al enzimelor n n n 1958 Koshland susţine că centru activ al

Centrul activ al enzimelor n n n 1958 Koshland susţine că centru activ al enzimei nu este rigid Forma acestuia se modifică în momentul legării S= recunoastere dinamica a S de catre E

Centrul activ al enzimelor S se leagă de E prin forţe relativ slabe; complexul

Centrul activ al enzimelor S se leagă de E prin forţe relativ slabe; complexul ES care se formează trece în produşii de reacţie cu eliberarea E sau poate reface S iniţial

Centrul activ al enzimelor n n n Apare sub forma unei despicături în apo.

Centrul activ al enzimelor n n n Apare sub forma unei despicături în apo. E căptuşită cu AA hidrofobi , apa fiind exclusă în mare parte Conţine şi aa polari esenţiali în procesul de cataliză Pe lângă resturile catalitice aflate în centru activ, care participă direct la transformarea S, apo. E conţine şi aşa-numitele resturi de specificitate, unde sunt prezenti aa cu rol în recunoaşterea S Ex. ribonucleaza scindeaza ARN Centrul activ prezinta: resturi catalitice (His 12 si His 119) si resturi de specificitate: intre aa 31 -41 exista 5 aa bazici care recunosc ARN cu caracter acid

Centrul activ al enzimelor n n n Contine: Ser, Cys, His, Tyr, Lys Enzimele

Centrul activ al enzimelor n n n Contine: Ser, Cys, His, Tyr, Lys Enzimele alosterice contin pe langa centrul activ si centrul alosteric; Aici se fixeaza efectorii alosterici care nu intervin direct in cataliza, dar pot influenta procesul catalitic prin modificarea conformatiei spatiale a enzimei

Centrul activ al enzimelor

Centrul activ al enzimelor

Specificitatea enzimelor n v v Specificitate de substrat: absoluta, relativa si stereochimica specificitate de

Specificitatea enzimelor n v v Specificitate de substrat: absoluta, relativa si stereochimica specificitate de legatura: enzimele recunosc un anumit tip de legatura chimica Esterazele recunosc legaturile de tip esteric Tripsina recunoaste legatura dintre Arg -Lys Trombina recunoaste legatura dintre Arg-Gly Arg Lys

Specificitatea enzimelor n n Alte exemple: Chimotripsina actioneaza asupra legaturilor peptidice la care participa

Specificitatea enzimelor n n Alte exemple: Chimotripsina actioneaza asupra legaturilor peptidice la care participa AA aromatici Carboxipeptidazele scindeaza legatura peptidica cea mai apropiata de capatul C-terminal, daca ultimul AA este aromatic Glicozidazele scindeaza legaturile glicozidice si sunt specifice unei monozaharide particulare: glucozidaza, galactozidaza etc

Specificitatea enzimelor n n n Acetilcolinesteraza hidrolizeaza esterul acidului acetic cu colina Substituirea radicalului

Specificitatea enzimelor n n n Acetilcolinesteraza hidrolizeaza esterul acidului acetic cu colina Substituirea radicalului acetil din S cu alt radical alifatic diminua mult activitatea enzimatica (cu cat radicalul este mai lung Butirilcolina este hidrolizata cu o viteza de 100 ori mare ca acetilcolina

Specificitatea enzimelor n n n 1. Specificitate de substrat relativa Enzimele actioneaza asupra unui

Specificitatea enzimelor n n n 1. Specificitate de substrat relativa Enzimele actioneaza asupra unui grup de substraturi cu structura asemanatoare ADH (alcool dehidrogenaza) transforma toti alcooli cu nr mic de atomi de C

Specificitatea enzimelor n 1. Specificitate de substrat relativa. Alte exemple

Specificitatea enzimelor n 1. Specificitate de substrat relativa. Alte exemple

Specificitatea enzimelor n n n 2. Specificitate de substrat absoluta O enzima actioneaza asupra

Specificitatea enzimelor n n n 2. Specificitate de substrat absoluta O enzima actioneaza asupra unui singur substrat Ureaza, arginaza

Specificitatea enzimelor n 2. Specificitate de substrat absoluta

Specificitatea enzimelor n 2. Specificitate de substrat absoluta

Specificitatea enzimelor n n 3. Stereospecificitate Specificitatea stereochimica. Existenta unor compusi biologici sub forma

Specificitatea enzimelor n n 3. Stereospecificitate Specificitatea stereochimica. Existenta unor compusi biologici sub forma de izomeri determina posibilitatea actiunii selective a unor enzime asupra unuia dintre ei Enzima leaga substratul pe baza complementaritatii intre centrul activ si un fragment din molecula, respectata numai in cazul unuia dintre izomeri Celalalt izomer avand o dispozitie spatiala diferita nu se poate lega de enzima.

Specificitatea enzimelor n Stereospecificitate n Enzimele pot sa determine: transformarea unui anumit izomer geometric

Specificitatea enzimelor n Stereospecificitate n Enzimele pot sa determine: transformarea unui anumit izomer geometric (cis sau trans); n formarea unui anumit izomer geometric sau optic; n transformarea unui substrat apartinand unei anumite serii sterice D sau L. n

Specificitatea enzimelor n Stereospecificitate

Specificitatea enzimelor n Stereospecificitate

Specificitatea enzimelor n n Stereospecificitate Lactat dehidrogenaza (LDH) este o enzima care determina transformarea

Specificitatea enzimelor n n Stereospecificitate Lactat dehidrogenaza (LDH) este o enzima care determina transformarea acidului L-lactic dar nu si pe cea a acidului Dlactic Determina transformarea unui compus optic inactiv, acidul piruvic, intr-un compus optic activ, acidul L-lactic, realizand o sinteza asimetrica L-aminoacid oxidaza care catalizeaza reactiile de dezaminare a L-aminoacizilor si D-aminoacid oxidaza care transforma Daminoacizii;

Specificitatea enzimelor n Succinat dehidrogenaza (SDH) catalizeaza preferential dehidrogenarea acidului succinic cu formarea acidului

Specificitatea enzimelor n Succinat dehidrogenaza (SDH) catalizeaza preferential dehidrogenarea acidului succinic cu formarea acidului fumaric (izomerul trans).

Specificitatea enzimelor n n n Specificitate de actiune Enzimele catalizeaza un anumit tip de

Specificitatea enzimelor n n n Specificitate de actiune Enzimele catalizeaza un anumit tip de reactie, in functie de modul de actiune asupra substratului Acest tip de specificitate sta la baza clasificarii enzimelor si este datorat cofactorului care guverneaza tipul de reactie in care se va angaja substratul.

Specificitatea enzimelor n. De exemplu, un anumit α-aminoacid poate fi substrat pentru mai multe

Specificitatea enzimelor n. De exemplu, un anumit α-aminoacid poate fi substrat pentru mai multe enzime care au cofactori diferiti.

Mecanismul de actiune al enzimelor

Mecanismul de actiune al enzimelor

Mecanismul de actiune al enzimelor n n Intr-o reactie S P, la un moment

Mecanismul de actiune al enzimelor n n Intr-o reactie S P, la un moment dat un anumit numar de molecule de substrat au energia necesara sa atinga o stare reactiva, denumita stare de tranzitie, intermediara intre S si P si instabila Aceasta poate fie sa se transforme in produsul P fie sa reformeze substratul si se situeaza la punctul maxim al diagramei energetice ce caracterizeaza relatia intre S si P

Mecanismul de actiune al enzimelor n n n Reactia se desfasoara cu o viteza

Mecanismul de actiune al enzimelor n n n Reactia se desfasoara cu o viteza proportionala cu concentratia moleculelor de substrat ce au energia necesara pentru a realiza tranzitia Cu cat este mai mare aceasta energie fata de energia medie cu atat sunt mai putine molecule capabile sa realizeze tranzitia si reactia se desfasoara mai greu Bariera de energie dintre energia starii de tranzitie si energia libera medie a lui S se numeste energie de activare.

Mecanismul de actiune al enzimelor

Mecanismul de actiune al enzimelor

Mecanismul de actiune al enzimelor

Mecanismul de actiune al enzimelor

Mecanismul de actiune al enzimelor n n n Enzimele actioneaza prin scaderea energiei de

Mecanismul de actiune al enzimelor n n n Enzimele actioneaza prin scaderea energiei de activare si nu prin cresterea energiei reactantilor, combinandu-se cu substratul astfel incat sa permita trecerea acestuia in starea de tranzitie Complexele formate ES si EP sunt intermediari avand energia punctelor minime in diagrama variatiei energiei dintre S si P Energia de activare este o bariera energetica pentru reactiile chimice, moleculele cu o energie de activare mare fiind mai stabile. Fara aceasta bariera energetica complexele macromoleculare ar reveni spontan la moleculele simple ce le compun si nu ar putea sa existe procesele metabolice si structurile ordonate.

Mecanismul de actiune al enzimelor n n Enzimele nu acţionează toate după un singur

Mecanismul de actiune al enzimelor n n Enzimele nu acţionează toate după un singur mecanism de reacţie universal valabil Dintre numeroasele mecanisme de acţiune propuse, cele mai importante sunt: cataliza acido-bazică, v cataliza covalentă v cataliza prin ioni metalici v cataliza prin distorsiune. v

Mecanismul de actiune al enzimelor n Cataliza prin ioni metalici

Mecanismul de actiune al enzimelor n Cataliza prin ioni metalici

Mecanismul de actiune al enzimelor n n Cataliza acido-bazica Este cel mai frecvent mecanism

Mecanismul de actiune al enzimelor n n Cataliza acido-bazica Este cel mai frecvent mecanism întâlnit în cataliza enzimatică Consta in procese de transfer de protoni intre gruparile acidobazice ale enzimei si cele ale substratului În calitate de catalizatori acido-bazici generali pot funcţiona grupările carboxilice sau aminice libere ale resturilor aminoacizilor acizi sau bazici; gruparea tiol a cisteinei, gruparea imidazol a histidinei şi gruparea hidroxil a tirozinei.

Mecanismul de actiune al enzimelor n n n Cataliza acido-bazica Viteza reactiilor catalizate de

Mecanismul de actiune al enzimelor n n n Cataliza acido-bazica Viteza reactiilor catalizate de acizi sau baze este influentata de doi factori importanti: Taria acizilor sau a bazelor: gruparea imidazol a histidinei are pka=6, actionand ca donor/acceptor la p. H fiziologic Viteza cu care acidul sau baza cedeaza/accepta protoni; si din acest punct de vedere este eficienta His In chimotripsina, aminoacizii Asp 102 si His 57 functioneaza ca grupe cu caracter acid si, respectiv caracter bazic.

Mecanismul de actiune al enzimelor n n Cataliza covalenta Formarea complexului enzimă-substrat presupune formarea

Mecanismul de actiune al enzimelor n n Cataliza covalenta Formarea complexului enzimă-substrat presupune formarea unei legături puternice, de tip covalent (punere in comun a electronilor), între S şi E In acest tip de cataliza, atacul unei grupe electrofile sau nucleofile din situsul activ al enzimei asupra substratului determina atasarea acestuia prin legaturi covalente la enzima. Multe enzime formeaza legaturi covalente cu substratul, labilizandu-l fata de cel in forma nelegata

Mecanismul de actiune al enzimelor n n n Cataliza covalenta Serin proteazele (tripsina, chimotripsina,

Mecanismul de actiune al enzimelor n n n Cataliza covalenta Serin proteazele (tripsina, chimotripsina, trombina) actioneaza dupa acest mecanism. Inainte de a se lega la enzima, substratul adopta o stare de tranzitie caracterizata prin entropie scazuta, pentru care enzima are afinitate mai mare

Enzime care actioneaza prin cataliza covalenta

Enzime care actioneaza prin cataliza covalenta

Mecanismul de actiune al enzimelor n Cataliza prin distorsiune n Se aplică în special

Mecanismul de actiune al enzimelor n Cataliza prin distorsiune n Se aplică în special la enzimele hidrolitice n Accelerarea vitezei de reacţie prin acest mecanism s-ar datora inducerii unei tensiuni în molecula substratului, ceea ce ar determina “activarea” sa.

Mecanismul de actiune al enzimelor n n Se presupune astfel că legarea specifică a

Mecanismul de actiune al enzimelor n n Se presupune astfel că legarea specifică a substratului de molecula enzimei induce apariţia unei tensiuni sau a unei deformări în legătura ce urmează a fi scindată Deformarea survenită permite complexului enzimă-substrat să fie mai reactiv decât substratul singur şi să se transforme mai rapid în produşii de reacţie.

Cinetica enzimatică

Cinetica enzimatică

Cinetica enzimatică n n n p. H-ul Pentru enzimele din organismul uman, p. H-ul

Cinetica enzimatică n n n p. H-ul Pentru enzimele din organismul uman, p. H-ul optim de actiune este p. H-ul normal al mediului in care ele isi manifesta actiunea catalitica Centrul activ al enzimelor contine grupe ionizabile, acide sau bazice, deci modificarea p. H-ului are ca efect modificarea gradului de disociere si, implicit, modificarea vitezei de reactie.

Cinetica enzimatică

Cinetica enzimatică

Cinetica enzimatică n Pentru enzimele din organismul uman p. H-ul optim este intre 59,

Cinetica enzimatică n Pentru enzimele din organismul uman p. H-ul optim este intre 59, dar exista enzime ce actioneaza si in afara acestui interval. De exemplu, pepsina actioneaza la p. H 1, 5 -2, fosfatazele alcaline la p. H 9 -10, iar fosfatazele acide la p. H 4, 5 -5. Pepsina Colinesteraza Tripsina

Cinetica enzimatică n Temperatura Efectul temperaturii asupra activitatii enzimelor este rezultanta actiunii a doi

Cinetica enzimatică n Temperatura Efectul temperaturii asupra activitatii enzimelor este rezultanta actiunii a doi factori opusi, cresterea vitezei de reactie cu temperatura si denaturarea termica a enzimelor n Activitatea oricarei enzime variaza cu temperatura n n n Temperatura optima pentru enzimele din organismul uman este 37 -400 C, la plante 50 -600 C, iar pentru cele din microorganismele din apele termale este 80 -1000 C Determinarea activitatii unei enzime trebuie sa se faca la o temperatura intre 25 -37 C.

Cinetica enzimatică

Cinetica enzimatică

Cinetica enzimatică n n Concentratia substratului In reactiile cu un singur S, mentinand constanta

Cinetica enzimatică n n Concentratia substratului In reactiile cu un singur S, mentinand constanta [E], cresterea [S] determina marirea vitezei de reactie pana cand se atinge o valoare maxima peste care oricat ar creste concentratia substratului viteza reactiei enzimatice ramane nemodificata La concentratii mici de S, viteza de reactie este proportionala cu [S] (reactii de ordin 1) La concentratii mari de S, viteza de reactie devine independenta de concentratia substratului (reactii de ordin 0), enzima saturandu-se cu S.

Cinetica enzimatică n n Concentratia substratului L. Michaelis si M. Menten au propus o

Cinetica enzimatică n n Concentratia substratului L. Michaelis si M. Menten au propus o teorie generala de actiune a enzimelor bazata pe ideea ca enzima si substratul se asociaza reversibil pentru a forma complexul ES. Ecuatia exprima faptul ca viteza unei reactii enzimatice este determinata de concentratia de substrat la acel moment si de constantele Km si vmax. Aspectul curbei descrise de ecuatia Michaelis-Menten este hiperbolic

Cinetica enzimatică

Cinetica enzimatică

Cinetica enzimatică n n n Semnificatia Km si vmax Daca v = vmax/2 ,

Cinetica enzimatică n n n Semnificatia Km si vmax Daca v = vmax/2 , inlocuind in ecuatia Michaelis-Menten se deduce faptul ca Km = [S], deci constanta Michaelis poate fi definita drept concentratia de substrat la care viteza de reactie este jumatate din viteza maxima Constanta Michaelis, Km, este un indice al afinitatii enzimei pentru substrat, variind invers proportional cu aceasta

Cinetica enzimatică Enzime michaeliene n c b n a n Zona “a”- v creste

Cinetica enzimatică Enzime michaeliene n c b n a n Zona “a”- v creste proportional cu [s] Zona “b” – cresterea v cu [s] nu este proportionala Zona “c” – este atins Vmax la [s] infinita

Cinetica enzimatică n n Pentru orice E se poate defini, alaturi de Km si

Cinetica enzimatică n n Pentru orice E se poate defini, alaturi de Km si v max, numarul de turn-over al enzimei, ca fiind numarul de molecule de S convertite in produs de reactie pe molecula de E in unitatea de timp, atunci cand E este saturata cu S Ecuatia Lineweaver-Burk Deoarece reprezentarea ecuatiei Michaelis -Menten este curba a carei interpretare este dificila, s-au realizat reprezentari liniare ale dependentei vitezei de reactie de [S], folosite la interpretarea datelor experimentale: reprezentarea Lineweaver-Burk, reprezentarea Hanes-Woolf, etc.

Cinetica enzimatică Reciproca ecuatiei Michaelis-Menten

Cinetica enzimatică Reciproca ecuatiei Michaelis-Menten

Cinetica enzimatică n n Enzimele alosterice sunt alcatuite din mai multe subunitati curba prezinta

Cinetica enzimatică n n Enzimele alosterice sunt alcatuite din mai multe subunitati curba prezinta un aspect sigmoid

Cinetica enzimatică n n n Influenta efectorilor enzimatici Efectorii enzimatici sunt substante cu structuri

Cinetica enzimatică n n n Influenta efectorilor enzimatici Efectorii enzimatici sunt substante cu structuri chimice variate care aduse in mediul de reactie pot influenta activitatea enzimei care catalizeaza reactia Efectorii enzimatici pot fi activatori sau inhibitori.

Cinetica enzimatică zimogen n Activatorii enzimatici sunt compusi care stimuleaza activitatea enzimelor. Acestia pot

Cinetica enzimatică zimogen n Activatorii enzimatici sunt compusi care stimuleaza activitatea enzimelor. Acestia pot fi: Proteaze activator n n n Activatori ai unor proenzime Forma inactiva a enzimei se numeste proenzima sau zimogen, in care centrul activ al enzimei este mascat Prin eliminarea unei parti din molecula, centrul activ este demascat, enzima devenind activa Clivare S

Proenzime sau zimogeni

Proenzime sau zimogeni

Inhibitorii enzimatici n n n Inhibitorii enzimatici sunt compusi care influenteaza negativ activitatea enzimelor

Inhibitorii enzimatici n n n Inhibitorii enzimatici sunt compusi care influenteaza negativ activitatea enzimelor pe care o pot anula definitiv sau temporar Ei pot afecta situsul catalitic al enzimei sau orice alta regiune a moleculei, astfel influentand legarea substratului de enzima Actiunea inhibitorilor enzimatici este importanta pentru controlul proceselor biochimice, pentru a intelege mecanismele de actiune a unor medicamente, droguri, otravuri, pentru a urmari etape dintr-un proces metabolic.

Inhibitorii enzimatici n n n Inhibitia enzimatica a fost clasificata in moduri diferite: Inhibitie

Inhibitorii enzimatici n n n Inhibitia enzimatica a fost clasificata in moduri diferite: Inhibitie ireversibila, ce se manifesta prin alterarea de durata a structurii enzimei ca urmare a unor legaturi mai puternice. Inhibitie reversibila, fiind determinata de compusii care interactioneaza cu enzima prin interactii necovalente care poate fi: competitiva necompetitiva;

Inhibitorii enzimatici Inhibitie ireversibila n Se formeaza un complex EI stabil, nedisociabil n E

Inhibitorii enzimatici Inhibitie ireversibila n Se formeaza un complex EI stabil, nedisociabil n E + I EI (reactie ireversibila) 1. Inhibitia se accentueaza progresiv pana la inlaturarea completa a activitatii enzimatice si nu poate fi anulata prin indepartarea I 2. se datoreaza unor modificari covalente, permanente ale gruparilor functionale necesare catalizei, transformand E in molecule inactive; 3. la inceput inhibitia este incompleta, dar creste pe masura ce apar modificarile chimice respective n

Inhibitorii enzimatici n n n Inhibitie ireversibila Exemple de inhibitori ireversibili: substantele toxice, acidul

Inhibitorii enzimatici n n n Inhibitie ireversibila Exemple de inhibitori ireversibili: substantele toxice, acidul iodacetic, metalele grele, compusii arsenicali Acestia interactioneaza cu radicalii aa din centru activ al E, esentiali pentru structura si functia acesteia Acidul iodacetic este inhibitor al ribonucleazei la p. H=5, 5; se obtine un produs alchilat al His 119 sau al His 12 si o forma in care ambele histidine sunt alchilate Ionii metalelor grele ca Hg 2+, Pb 2+ sunt I irev pentru E ce contin sulf in centrul activ

Inhibitorii enzimatici

Inhibitorii enzimatici

Inhibitorii enzimatici n n n Inhibitia reversibila 1. Intre E si I se formeaza

Inhibitorii enzimatici n n n Inhibitia reversibila 1. Intre E si I se formeaza un complex EI care poate regenera E n E + I EI Se defineste o constanta de inhibitie, Ki ca fiind constanta de disociere a complexului EI n Ki = [E] x [I]/ [EI] Inhibitia reversibila poate fi: competitiva, uncompetitiva si necompetitiva

Inhibitori competitivi

Inhibitori competitivi

Inhibitori competitivi I competitiv prezinta analogie structurala cu S, avand astfel afinitate pentru situsul

Inhibitori competitivi I competitiv prezinta analogie structurala cu S, avand astfel afinitate pentru situsul catalitic al E Apare o competitie intre E si S pentru ocuparea situsului catalitic. Legatura prin care se leaga I este de aceeasi natura cu cea prin care se leaga S. Reactiile care au loc in acest caz sunt urmatoarele: Ks Ki

Inhibitori competitivi n Este o inhibitie reversibila, deoarece prin cresterea [s] se indeparteaza I

Inhibitori competitivi n Este o inhibitie reversibila, deoarece prin cresterea [s] se indeparteaza I competitiv de la situsul catalitic, legarea I competitiv la E fiind reversibila

Inhibitori competitivi n n n Viteza de reactie atinge Vmax ca si cum I

Inhibitori competitivi n n n Viteza de reactie atinge Vmax ca si cum I nu ar fi prezent, daca se mareste suficient de mult [S] I competitivi cresc panta curbei, deci Km creste, scazand afinitatea E pentru S Adaugarea I competitiv nu modifica Vmax, dar creste mult Km

Inhibitori competitivi n n n Exemple de I competitivi: Succinat dehidrogenaza enzima ce transforma

Inhibitori competitivi n n n Exemple de I competitivi: Succinat dehidrogenaza enzima ce transforma acidul succinic in acid fumaric, este inhibata competitiv de acizii dicarboxilici: acid malonic, acid malic, acid oxalic, asemanatori structural cu substratul acestei enzime; Sulfanilaminda isi exercita actiunea bacteriostatica prin inhibitie competitiva. Sulfanilamida este asemanatoare structural cu acidul p-aminobenzoic, pe care il poate inlocui in timpul sintezei acidului folic de catre bacterii pentru care este factor de crestere. In lipsa acidului folic bacteriile mor.

Inhibitori competitivi n n n In terapia cancerului se utilizeaza analogi structurali ai bazelor

Inhibitori competitivi n n n In terapia cancerului se utilizeaza analogi structurali ai bazelor purinice si pirimidinice, ce inhiba sinteza acizilor nucleici, impiedicand diviziunea celulara care este mult mai rapida la celulele tumorale = antimetaboliti De exemplu, metotrexatul este antagonist FH 2 pentru dihidrofolat reductaza Biosinteza prostaglandinelor este inhibata de anumiti acizi grasi, inhibitori competitivi ai acizilor cu 20 atomi de carbon folositi ca substrat.

Inhibitori competitivi n n Aminele cuaternare inhiba competitiv acetilcolinesteraza, E ce hidrolizeaza Ach Actiunea

Inhibitori competitivi n n Aminele cuaternare inhiba competitiv acetilcolinesteraza, E ce hidrolizeaza Ach Actiunea unor medicamente se datoreaza faptului ca sunt inhibitori competitivi Exemple de I comp

Inhibitori competitivi

Inhibitori competitivi

Inhibiţie uncompetitiva n n n I nu se combina cu E libera si nu

Inhibiţie uncompetitiva n n n I nu se combina cu E libera si nu afecteaza relatia sa cu S I se combina cu complexul ES formand un complex ESI ce nu poate genera P dorit Reducerea [ES] creste afinitatea aparenta e E pt S Inhibitorii uncompetitivi sau anticompetitivi scad Km si Vmax Inhibitia uncompetitiva functioneaza cel mai bine cand [S] este mare, iar I nu tb sa fie asemanator S

Inhibiţie necompetitiva n n Inhibitorul necompetitiv nu se leaga la acelasi situs cu substratul,

Inhibiţie necompetitiva n n Inhibitorul necompetitiv nu se leaga la acelasi situs cu substratul, nu prezinta asemanare structurala cu acesta, deci efectul acestuia nu poate fi inlaturat prin cresterea concentratiei de substrat Inhibitorul necompetitiv interactioneaza cu complexul ES sau si cu complexul ES si cu enzima. Reactiile care au loc in acest caz sunt urmatoarele: ESI nu se poate Scinda pt a Forma P

Inhibiţie necompetitiva Km = ct Vmax scade

Inhibiţie necompetitiva Km = ct Vmax scade

Inhibiţie necompetitiva n n n In cazul inhibitiei necompetitive, I chiar daca nu se

Inhibiţie necompetitiva n n n In cazul inhibitiei necompetitive, I chiar daca nu se leaga la centru activ al E actioneaza asupra acesteia deformand-o incat nu mai poate forma c. ES la viteza normala, iar c. ES format nu se mai descompune cu viteza normala pt a forma P Inhibitia nu poate fi inlaturata prin cresterea [S]

Inhibiţie necompetitiva n n n Tipuri de inhibitori necompetitivi: ioni sau molecule ce actioneaza

Inhibiţie necompetitiva n n n Tipuri de inhibitori necompetitivi: ioni sau molecule ce actioneaza la nivelul cofactorilor: CNCO; pentru citocromi I intervin in lnatul resp. mitoc inhibitori ai grupelor -SH libere ale enzimei: acid iod acetic, pclormercuribenzoat; metale grele: argint, mercur, plumb, ce actioneaza la nivelul grupelor -SH ale enzimei; agenti de chelatare: EDTA.

Efectul inhibitorilor asupra vitezei de reactie

Efectul inhibitorilor asupra vitezei de reactie

Enzime alosterice. Efectori alosterici n n Sunt proteine oligomere alcatuite din mai multe subunitati

Enzime alosterice. Efectori alosterici n n Sunt proteine oligomere alcatuite din mai multe subunitati identice sau diferite, in numar par Reactiile catalizate sunt endergonice si ireversibile; imprima sensul unic al cailor metabolice din care fac parte Intervin in prima etapa a unui lant de reactii, asigurand controlul intensitatii procesului si ireversibilitatea lui Fiecare monomer poseda un centru activ; fixarea S pe una din subunitati influienteaza legarea lui pe celelalte prin fenomenul de cooperativitate

Enzime alosterice. Efectori alosterici n n Pe langa centri activi, monomerii prezinta si centri

Enzime alosterice. Efectori alosterici n n Pe langa centri activi, monomerii prezinta si centri alosterici de care se vor lega efectorii alosterici Efectorii alosterici sunt compusi cu masa moleculara mica, fara analogie cu S si care activeaza reactiile enzimatice (efectori pozitivi) sau le inhiba (efectori negativi) Efectorii alosterici sunt prezenti la locul de actiune al E variind doar concentratia lor E alosterice sunt inhibate de produsul de reactie prin retroinhibitie sau inhibitie feedback

Efectori alosterici

Efectori alosterici

Reglarea activitatii enzimatice

Reglarea activitatii enzimatice

Reglarea activitatii enzimatice

Reglarea activitatii enzimatice

Reglarea activitatii enzimatice n n Enzimele modulate prin fosforilare-defosforilare Trec din forma activa in

Reglarea activitatii enzimatice n n Enzimele modulate prin fosforilare-defosforilare Trec din forma activa in inactiva si invers prin procese de fosforilare-defosforilare la nivelul gruparilor OH ale unui rest de serina, mai rar treonina sau tirozina (nu fac parte din centrul activ) Fosforilarea se realizeaza pe seama ATP, care transfera un singur rest de acid fosforic, cu participarea unor kinaze Trasnformarea inversa are loc prin hidroliza cu participarea unor fosfataze specifice

Reglarea activitatii enzimatice

Reglarea activitatii enzimatice

Reglarea activitatii enzimatice n n n Enzimele modulate prin fosforilare-defosforilare: Glicogenfosforilaza, citratliaza active in

Reglarea activitatii enzimatice n n n Enzimele modulate prin fosforilare-defosforilare: Glicogenfosforilaza, citratliaza active in forma fosforilata si inactive in forma defosforilata Glicogensintetaza, piruvatdehidrogenaza, acetil. Co. Acarboxilaza active in forma defosforilata si inactive in forma fosforilata

Reglarea activitatii enzimatice n n n Proteoliza incompleta: pepsina, chimotripsina, carboxipeptidazele Reglarea activitatii enzimatice

Reglarea activitatii enzimatice n n n Proteoliza incompleta: pepsina, chimotripsina, carboxipeptidazele Reglarea activitatii enzimatice prin activarea zimogenilor sau a proenzimelor la locul de actiune (stomac, intestin subtire) sub actiune aunor factori locali (p. H, enzime) sau autocatalitic Transformarile sunt unidirectionale, neexistand posibilitatea refacerii zimogenului din enzimele active

Reglarea activitatii enzimatice n n Proteoliza incompleta. Importanta: Sinteza E la locul de actiune

Reglarea activitatii enzimatice n n Proteoliza incompleta. Importanta: Sinteza E la locul de actiune ar fi mult mai lenta Sintetizate in forma activa, ele si-ar putea manifesta activitatea imediat, la locul de sinteza, determinand aparitia unor boli grave Transportul lor de la locul de sinteza la locul de actiune in forma activa ar putea avea consecinte grave

Izoenzime

Izoenzime

Izoenzime

Izoenzime

Izoformele lactat dehidrogenazei

Izoformele lactat dehidrogenazei

Izoenzime

Izoenzime

Izoenzime

Izoenzime

Izoenzime

Izoenzime

Izoenzime

Izoenzime