Emilie Crouchet Florian Wrensch Catherine Schuster Mirjam B

  • Slides: 25
Download presentation

Современные противовирусные препараты Emilie Crouchet, Florian Wrensch, Catherine Schuster, Mirjam B. Zeisel and Thomas

Современные противовирусные препараты Emilie Crouchet, Florian Wrensch, Catherine Schuster, Mirjam B. Zeisel and Thomas F. Baumert. Host-targeting therapies for hepatitis C virus infection: current developments and future applications. DOI: 10. 1177/1756284

SEA (Similarity Ensemble Approach) Как оценить подобие двух мишеней? A a b B Необходимо

SEA (Similarity Ensemble Approach) Как оценить подобие двух мишеней? A a b B Необходимо ввести метрику химического подобия наборов соединений, активных по отношению к мишеням А и В. rawscore = подобие наборов молекул TC(a, b) - индекс Танимото соединений a и b Keiser MJ, Roth BL, Armbruster BN, Ernsberger P, Irwin JJ, Shoichet BK. Relating protein pharmacology by ligand chemistry. Nat Biotech 25 (2), 197 -206 (2007) Wang Z, Liang L, Yin Z, Lin J. Improving chemical similarity ensemble approach in target prediction. J Cheminform. 2016: 8: 20 (2016)

Прогноз молекулярной мишени действия соединений описание эксперимента организм эксперимента мишень, организм мишени p_value assay

Прогноз молекулярной мишени действия соединений описание эксперимента организм эксперимента мишень, организм мишени p_value assay Ch. EMBL_ID In vitro antiviral activity was evaluated in a plaque reduction assay against influenza A Influenza A virus Neuraminidase Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934(H 1 N 1)) 1. 0354 e-102 CHEMBL 699363 Inhibition of HCV subgenomic RNA replication in Huh 5 -2 cells after 48 hrs by replicon assay Hepatitis C virus NS 5 B protein Hepatitis C virus genotype 1 0. 0 CHEMBL 866685 Antiviral activity against HIV 1 3 B in human MT 4 cells assessed as inhibition of viralinduced cytopathic effect by MTT method Human immunodeficiency virus 1 Human immunodeficiency virus type 1 protease Human immunodeficiency virus 1 4. 2632 e-300 CHEMBL 953182

Прогноз молекулярной мишени действия соединений описание эксперимента организм эксперимента мишень, организм мишени p_value assay

Прогноз молекулярной мишени действия соединений описание эксперимента организм эксперимента мишень, организм мишени p_value assay Ch. EMBL_ID In vitro antiviral activity was evaluated in a plaque reduction assay against influenza A Influenza A virus Neuraminidase Influenza A virus (A/Puerto Rico/8/1934(H 1 N 1)) 1. 0354 e-102 CHEMBL 699363 Inhibition of HCV subgenomic RNA replication in Huh 5 -2 cells after 48 hrs by replicon assay Hepatitis C virus NS 5 B protein Hepatitis C virus genotype 1 0. 0 CHEMBL 866685 Antiviral activity against HIV 1 3 B in human MT 4 cells assessed as inhibition of viralinduced cytopathic effect by MTT method Human immunodeficiency virus 1 Human immunodeficiency virus type 1 protease Human immunodeficiency virus 1 4. 2632 e-300 CHEMBL 953182

анализ прогноза мишеней a posteriori вид вируса эксперимент мишень z e pval Dengue virus

анализ прогноза мишеней a posteriori вид вируса эксперимент мишень z e pval Dengue virus CHEMBL 2044697 Scavenger m. RNA-decapping enzyme Dcp. S CHEMBL 1949488 8. 4 9. 4*10^-3 1. 2*10^-5 CHEMBL 204469: EC 50 = 7. 4 н. М J. Med. Chem. 2012, 55, 7, 3135 -3143 CHEMBL 1949488: IC 50 = 1. 1 н. М