DNAABBAUENDE MIKROORGANISMEN Projektarbeit Nicole Fried und Reto Gianotti

DNA-ABBAUENDE MIKROORGANISMEN Projektarbeit Nicole Fried und Reto Gianotti

INHALTSÜBERSICHT Einleitung / Begrüssung Projektablauf Theorie: Mikroorganismen und DNA-Abbau Resultate Diskussion / Ausblick Fragen

AUFGABENSTELLUNG / PROJEKTABLAUF Fragestellung: Können Mikroorganismen DNA-abbauen und als Nährstoffe nutzen? Literaturrecherche: ØDNA-Abbau ØNachweismethoden ØIdentifizierung der Organismen

PROJEKTABLAUF ØPlattengiessen (DNase Test Agar von Sigma) Agar, 15 g/L DNA, 2 g/L Na. Cl, 5 g/L 20 g/L ØAussuchen und Ausstreichen der Organismen ØHerstellen von Reinkulturen ØTesten auf Dnase-Aktivität Vorschrift von Waller, J. R et al 1985 Tryptose,

THEORIE: DNA-AUFNAHME DNA-Aufnahme Transformation Transduktion Konjugation Aufnahme von DNA Injektion durch Austausch Aus der Umgebung Phagen

DNA-AUFNAHME • Anheften des Pilus. • Anlagerung Proteine und Einzelstrangbruch • Replikation und Transfer. • Bildung zirkulärer DNA • Überspiralisierung mittels Topoisomerasen und Trennung der Zellen

THEORIE: DNA-ABBAU Organismen haben häufig Kontakt mit fremd DNA z. B. Viren können Zellstoffwechsel stören oder zum Zelltod führen Abwehrmechanismus: Restriktionsenzyme ØEndonucleasen ØExonucleasen

THEORIE MIKROORGANISMEN Mikroorganismus Quelle Actinomyceten Bodenproben Pseudomonas Bodenproben E. coli Enterobakterien Klährschlamm Bacillen Bodenproben Hefe Chromobakterien Bodenprobe Unbekannte Organismen Unbekannt Umgebungsluft Unbekannt Klärschlamm

RESULTATE DNASE-AKTIVITÄT Negativ • Actinomyceten • Bacillen • Chromobakterien • Pseudomonaden • Unbekannte Organismen 1 -4

RESULTATE DNASE-AKTIVITÄT Positiv • Sedimentationsplatten DK 1, 2, 3 und 5 • Belebtschlamm 1. 1. 1, 1. 2. 1, 1. 3. 1 Links: 1. 1. 1 Rechts. 1. 2. 1 Oben: 1. 3. 1

RESULTATE IDENTIFIKATION MS-Maldi-TOF • DK 2: Staphylococcus capitis • DK 3: Moraxella sg Moraxella osloensis • Keim 1. 1. 1: Serratia liquefaciens • Keim 1. 3. 1: Aeromonas caviae Die anderen Organismen konnten nicht identifiziert werden.

DISKUSSION / AUSBLICK • Bodenproben negativ • Enterobakterien negativ • Belebtschlamm positiv • Umgebungsluft positiv • Identifizierung: Gram-negative Bakterien API • Mehrere Organismen untersuchen

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