Direct repair Photoreactivation Adaptiveinducible repair Excision of damaged
ชนดของการซอมแซมดเอนเอ �Direct repair �Photoreactivation �Adaptive/inducible repair �Excision of damaged region, followed by precise replacement �Base excision repair (BER) �Nucleotide excision repair (NER) �Mismatch repair (MMR) �Double-strand break repair �Homologous recombination repair (HRR) �Non-homologous end joining repair (NHEF) �Damage by pass �SOS repair
Direct repair
photoreactivation � CPD photolyase ม 2 chromophores ททำหนาทดดกลนพลงงานแสง 1. FADH ใหพลงงานในการแยก dimer 2. Methyl-tetrahydrofolate (MTHF) หรอ 8 -hydroxy-5 -deazaflavin (8 HDF) ทำหนาทรวมแสงในตอนแรก กอนสงผานพลงงานให FADH * CPD = a cyclobutane pyrimidine dimer
�พบเอนไซม CPD photolyase ใน bacteria, fungi, plants and many vertebrates แตไมพบในสตวมรก �เอนไซม 6 -4 photolyase (which repair 6 -4 PPs) ในแมลง reptiles และ amphibians แตไมพบใน E. coli, yeast หรอ mammals
Base excision repair (BER)
Nucleotide excision repair (NER) Xeroderma pigmentosum (XP) mutation of 7 XP genes (XP-A to XP-G)
Mismatch repair
การซอมแซม DNA (DNA repair) � Homologous recombination repair (HRR): ซอมแซมดเอนเอทเกดการแตกหกของโครโมโซม (doublestrand break; DSB) หรอการเกดชองวาง (gab) ของสายดเอนเอระหวาง DNA replication recombination repair (crossing over) � DSB inversion, translocation, terminal or interstitial deficiencies phenotypic effects � การกลายเกดจากการถกกระตนดวยรงส X หรอรงสแกรมมา , chemical mutagens หรอยาทใชรกษาโรค (chemotherapy), free radicals
Homologous recombination repair (HRR):
Non-homologous end joining repair (NHEJ)
การซอมแซมดเอนเอของยนทกำลง ถอดรหส �E. coli thymine dimer �Nucleotide excision repair (NER) �Transcription repair coupling factor (TRCF) helicase binding site สำหรบ เอนไซม Uvr. A �Eukaryote กลไกของ DNA repair and transcription ยงไมเปนทกระจาง แตมศกษาการกลายของยน CS-A และ CS-B ซงใหโปรตนทหนาทเหมอน TRCF กอใหเกดโรค Cockayne syndrome (CS) ในคน �Transcription factors TFIIH transcription and nucleotide excision repair
DNA repair and transcription
Translesion DNA polymerases �TLS ใน E. coli extreme condition (high doses of UV light และ mutagens อนๆ ) SOS response replicate over damaged regions harmful survive under condition for extreme environmental stress genetic variability within the bacterial population resistant to the harsh conditions �ดงนน SOS repair จงเปนระบบซอมแซมทกอความเสยหาย
- Slides: 28