Die effiziente Literaturrecherche in der Medizin am Beispiel

Die effiziente Literaturrecherche in der Medizin am Beispiel von Medline mit Pub. Med Konserve oder Eigenproduktion Tutorium 50. GMDS-Jahrestagung Freiburg, 11. -15. Sept. 2005 Edith Motschall Institut für Medizinische Biometrie und Medizinische Informatik Stefan-Meier-Str. 26, 79104 Freiburg i. Br. , Tel 0761/203 -6723, motschall@mi. ukl. uni-freiburg. de http: //www. imbi. uni-freiburg. de/biblio

Aufwand schnell … Zweck der Suche Fragestellung … und „gut“?

Retrievalbias: Das Dilemma zwischen Genauigkeit und Vollständigkeit nicht gefunden nicht relevant Vollständigkeit Genauigkeit Precision = ty = gefundene relevante Zitate alle gefundenen Zitate Recall = gefundene relevante Zitate (=Sensitivity) in Datenbank vorhandene relevante Zitate Specifici nicht gefundene nicht relevante Zitate alle nicht relevanten Zitate in der Datenbank

Datenbank-Angebot (Auswahl): - Embase: Elsevier Medline: National Library of Medicine NLM - Science Citation Index Institute of Scientific Information ISI: Besonderheit: cited reference search - Biosis - Psycinfo - etc. Volltext-und Faktendatenbanken (z. B. Cochrane Database Syst Rev. ) Clinical Evidence Cochrane Library ACP Journal Club - Manuelle Suche - Reference checking

Informationsportale und datenbankübergreifende Recherchen www. medpilot. de Einfache Recherche Profi-Recherche www. dimdi. de

Alles in einen Topf ? Vorteil: - gemeinsame Grundfunktionen in einer Suchoberfläche - keine besonderen Datenbankkenntnisse - grobe Schätzung über Anzahl Zitate pro Datenbank Medline Cochrane Library Biosis Nachteil: - datenbankspezifische Suchfunktionen werden nicht genutzt wenig Variationsmöglichkeiten in Bezug auf Precision und Recall

Begriffsverwirrung: Hersteller NLM von National Library of Medicine Datenbanken Medline. . . Medline - Pub. Med - Ovid ? ? ? erhältlich über Datenbankanbieter NLM Ovid Silverplatter DIMDI. . . mit Suchoberflächen Pub. Med Unterschiedliche Software, Suchoberflächen und Syntax bei den einzelnen Anbietern für das Retrieval Smart. Search Classic Search (GRIPS)

Medline-Zitat (Bei Pub. Med: www. pubmed. gov) Me. SH/subheading (=qualifier) * Hauptaspekt des Artikels

Me. SH=Medical Subject Headings Thesaurus (kontrolliertes Vokabular), erstellt von der National Library of Medicine (NLM) - ca. 20. 000 Begriffe (mit Verweisen und Synonymen) - polyhierarchische Struktur („Tree“ structure) Suche nach allen Unterbegriffen in einem Schritt mit „Explode“ (interne OR-Verbindung)

Freitextsuche (textword, keyword) (1) „Wildcards“ : Möglichkeit der „Truncation“: Suche nach Wortstamm mit variabler Endung: 1. Variceal hemorrhage: primary and secondary prophylaxis]. [German] prophyla* 2. Efficacy of prophylactic sclerotherapy for prevention of a first variceal hemorrhage 3. Beta-blockers for the prevention of variceal haemorrhage in patients with cirrhosis Wörtliche Suche: - in allen suchbaren Feldern - oder in ausgewählten Feldern (search fields) Syntax-Beispiel bei Pub. Med: Nur im Titel: Titel + Abstract + Me. SH + u. a. : prophyla*[ti] prophyla*[tiab] prophyla*[tw] Wortstamm mit variabler Endung: „Truncation“ od. „Wildcard“ Beispiel bei Pub. Med: * (nur die ersten 600 Variationen) An Synonyme und verschiedene Schreibweisen denken ! z. B. prevent*[tw]

Freitextsuche (textword, keyword) (2) Wörter dazwischen, variable Reihenfolge: Beta-adrenergic-antagonist drugs in the prevention of gastrointestinal bleeding in patients with cirrhosis and esophageal varices. - Bei Pub. Med: kein spezieller Operator (AND verwenden –> viel irrelevante Zitate) - Bei anderen Anbietern: z. B. Wiley (Cochrane Library): NEAR z. B. varices NEAR bleeding ISI (Web of Science) SAME DIMDI SAME SENT Ovid: adjn Zusätzlich Synonyme und verschiedene Schreibweisen berücksichtigen: (varices OR variceal OR varix) AND (bleed* OR hemorrhag* OR haemorrhag*) Abhilfe: Kontrolliertes Vokabular soll das Problem der sprachlichen Vielfalt lösen, z. B. Suche mit Me. SH: Gastrointestinal Hemorrhage

Vor- und Nachteile der Suche mit Me. SH Vorteile: Nachteile: Synonyme und versch. Schreibweisen werden automatisch berücksichtigt. Uneinheitliche Verschlagwortung (Indexierung) Bei hierarchischem Aufbau Suche nach Ober- und Unterbegriffen in einem Schritt. Inhaltliche Zusammenhänge sind suchbar durch Me. SH/Subheading-Kombination. Bsp. : Gastrointestinal Hemorrhage/prevention & control Artikel durch Fachpersonal verschlagwortet vergebenes Schlagwort ist Gegenstand der Arbeit. Zutreffendes wird nicht gefunden. Aktuelle, noch nicht verschlagwortete Artikel werden nicht gefunden (Komponente Premedline). Für neue Substanzen oder neue medizinische Begriffe existiert noch kein Me. SH.

Kombination von Suchbegriffen (Boole‘sche Operatoren) Me. SH-Terms: Gastrointestinal Hemorrhage Propranolol OR AND Esophageal and Gastric Varices Verschiedene Begriffe zu einem Sachverhalt: Kombination mit OR A N D Vorsicht mit dem Operator NOT ! Unterschiedliche Sachverhalte müssen im Artikel gemeinsam vorkommen: Kombination mit AND Grund: Begriff 1 NOT Begriff 2 schließt auch die Artikel aus, die BEIDE Begriffe enthalten!

Formulierung einer Frage zerlegen im PICO-Format: P Patients, population I Intervention/Faktor (Exposure) C Comparison (Vergleich, Kontrolle, Studiendesign) O Outcome (Zielgröße) (Pat. m. alkoh. Lebercirrhose) (Präventive/therap. Maßnahmen) (z. B. rando) (Ösophagusvarizenblutungen) Nicht alle Komponenten erforderlich je nach Anzahl der Treffer bei den einzelnen Komponenten (z. B. P+I, I+C…)

Limits (weitere Eingrenzungsmöglichkeiten): 4. 1. 2. 3.

History (Suchstrategie in Pub. Med) Suche in Einzelschritten und Kombination der Ergebnisse Limits: Publication Type, Zeitraum, Sprache, human etc.

„Automatic Term Mapping“

Interne Strategie des Subsets systematic[sb]: www. nlm. nih. gov/bsd/pubmed_subsets/sysreviews_strategy. html Strategy last modified February 2005. (("systematic review*" OR "systematic literature review*" OR metaanalysis [pt] OR meta-analysis [ti] OR meta-analyses [ti] OR evidence-based medicine OR (evidence-based AND (guideline [tw] OR guidelines [tw] OR recommendations)) OR (evidenced-based AND (guideline [tw] OR guidelines [tw] OR recommendation*)) OR consensus development conference [pt] OR health planning guidelines OR guideline[pt] OR cochrane database syst rev OR acp journal club OR health technol assess OR evid rep technol assess summ OR evid based dent OR evid based nurs OR evid based ment health OR clin evid) OR ((systematic [tw] OR systematically OR critical [tw] OR (study [tiab] AND selection [tiab]) OR (predetermined OR inclusion AND criteri* [tw]) OR exclusion criteri* OR "main outcome measures" OR "standard of care") AND (survey [tw] OR surveys [tw] OR overview* OR review [tw] OR reviews [tw] OR search* OR handsearch OR analysis [tw] OR critique [tw] OR appraisal OR (reduction AND risk AND (death OR recurrence))) AND (literature [tw] OR articles OR publications [tw] OR publication [tw] OR bibliography [tw] OR bibliographies OR published OR unpublished OR citations OR database OR internet [tw] OR textbooks [tw] OR references OR trials OR meta-analysis [mh] OR (clinical [tw] AND studies) OR treatment outcome)) NOT (case report [ti] OR editorial [pt] OR letter [pt] OR newspaper article [pt]))

Umfang in Pub. Med Aktualität am 1. 9. 05 ~ 15, 8 Mio Zitate Andere Premedline („in process“): bald nach der Publikation, aber noch nicht verschlagwortet nicht mit Me. SH suchbar Oldmedline vor 1966 Pub. Med-Syntax: in process[sb] Premedline Medline: Nach Wochen bis Monaten (je nach Journal) Verschlagwortung mit Me. SH, Publication Type etc. durch NLMPersonal ~ 4. 800 Medline Journals ftp: //nlmpubs. nlm. nih. gov/online/journals/ljiweb. pdf Pub. Med-Syntax: medline[sb]

Literaturbeschaffung (1) - Direkter Link vom Literaturzitat der Datenbank auf den Volltext

Literaturbeschaffung (2) - Dokumentlieferdienst Subito: kostenpflichtig http: //www. subito-doc. de/ Bibliothek, Fernleihe

Konserve oder Eigenproduktion ? Zutaten selber wählen: Für den Einstieg und als erste Orientierung: - Me. SH - Textword - Limits etc. „Kochbücher“: - Online-Hilfen und –Tutorials der Datenbankanbieter - Publikationen, Links (z. B. www. cebm. net/searching. asp) e. Book: Pub. Med Help-Documentation: www. ncbi. nlm. nih. gov/books/bv. fcgi? rid=helppubmed. chapter. pubmedhelp NLM® Training Manuals and Resources www. nlm. nih. gov/pubs/web_based. html www. pubmed. gov Newsletter: NLM Technical Bulletin: www. nlm. nih. gov/pubs/techbull/tb. html