DERIVA GENETICA CASUALE Si consideri una popolazione a

  • Slides: 9
Download presentation
DERIVA GENETICA CASUALE Si consideri una popolazione a effettivo costante (cioè costituita ad ogni

DERIVA GENETICA CASUALE Si consideri una popolazione a effettivo costante (cioè costituita ad ogni generazione da N individui e da 2 N geni) e perfettamente isolata. Si consideri inoltre che i due alleli A 1 e A 2 di un dato gene A abbiano, in questa popolazione rispettivamente, frequenze p e q. La popolazione gametica di questi individui avrà lo stesso frequenze p e q. La formazione di N zigoti corrisponde all’estrazione casuale di 2 N gameti.

DERIVA GENETICA CASUALE L’estrazione dei due tipi di alleli, A 1 e A 2,

DERIVA GENETICA CASUALE L’estrazione dei due tipi di alleli, A 1 e A 2, fino al completamento di un insieme di 2 N alleli, può avvenire in uno dei seguenti (2 N + 1) modi: 2 N alleli A 1 2 N - 1 alleli 2 N - 2 alleli 2 N - 3 alleli ……… 2 N - i alleli ……… i alleli A 1 ……… 3 alleli A 1 2 alleli A 1 1 allele A 1 0 alleli A 1 A 1 e e e 0 alleli A 2; 1 allele A 2; 2 alleli A 2; 3 alleli A 2; ………. i alleli A 2; ………. 2 N - 3 alleli A 2; 2 N - 2 alleli A 2; 2 N - 1 alleli A 2; 2 N alleli A 2

DERIVA GENETICA CASUALE La probabilità di estrarre 2 N alleli che siano tutti A

DERIVA GENETICA CASUALE La probabilità di estrarre 2 N alleli che siano tutti A 1 è p 2 N, come anche La probabilità di estrarre 2 N alleli che siano tutti A 2 è q 2 N. La probabilità di estrarre 2 N - 1 alleli A 1 e un solo allele A 2 è p 2 N-1 q 1. L’allele A 2 però può essere estratto al primo, al secondo, al terzo. . . o all’N-esimo posto, Esempio per N = 3 (2 N =6), le combinazioni 5 A 1 e un A 2 sono: A 2 A 1 A 1 A 1 A 1 A 1 A 1 A 2 A 1 A 1 A 1 A 2 probabilità probabilità = = = p 5 q 1 p 5 q 1 probabilità = 6 p 5 q 1 quindi esistono 2 N sequenze che hanno ognuna p 2 N-1 q 1 probabilità di uscire. In conclusione, la probabilità della sequenza indipendente dalla posizione di A 2 è

DERIVA GENETICA CASUALE La probabilità di estrarre 2 N - 2 alleli A 1

DERIVA GENETICA CASUALE La probabilità di estrarre 2 N - 2 alleli A 1 e 2 alleli A 2 è p 2 N 2 q 2, ma di tali sequenze, se non si considera la posizione di A ve 2 ne sono quindi la probabilità di estrazione di (2 N - 2) alleli A 1 e 2 alleli A 2 è Più in generale, nel caso in cui vengano estratti 2 N - i alleli A 1 e i alleli A 2, la probabilità risulta essere

DERIVA GENETICA CASUALE Naturalmente, la somma di tutte le possibili sequenze sarà uguale a

DERIVA GENETICA CASUALE Naturalmente, la somma di tutte le possibili sequenze sarà uguale a 1 Questa è una distribuzione binomiale di ordine 2 N

Esempio. N = 10; 2 N = 20; fr(A 1) p = 0. 5

Esempio. N = 10; 2 N = 20; fr(A 1) p = 0. 5 fr(A 2) q = 0. 5 i = numero di alleli A 2 Alleli A 1 Alleli A 2 Probabilità della combinazione 20 19 18 -- 0 1 2 -- (0. 5)20 = 0. 000001 20(0. 5)20 = 0. 000019 190 (0. 5)20 = 0. 000181 11 9 = 0. 160179 10 10 = 0. 176197 9 11 = 0. 160179 -2 1 0 -18 19 20 190 (0. 5)20 = 0. 000181 20 (0. 5)20 = 0. 000019 (0. 5)20 = 0. 000001

Esempio. N = 5; 2 N = 10; fr(A 1) p = 0. 7

Esempio. N = 5; 2 N = 10; fr(A 1) p = 0. 7 fr(A 2) q = 0. 3 i = numero di alleli A 2 Alleli A 1 10 9 8 7 6 5 4 3 1 0 Alleli A 2 Probabilità della combinazione Valore della probabilità 0 1 2 3 4 5 6 7 9 10 (0. 7)10 10(0. 7)9(0. 3) 45(0. 7)8(0. 3)2 120(0. 7)7(0. 3)3 210(0. 7)6(0. 3)4 252 (0. 7)5(0. 3)5 210 (0. 7)4(0. 3)6 120 (0. 7)3(0. 3)7 10 (0. 7)9(0. 3)10 0. 02825 0. 12106 0. 23347 0. 26683 0. 20012 0. 10292 0. 03676 0. 00900 0. 00014 0. 00001 0. 38278 0. 35039

Esempio. N = 10; Alleli A 1 20 19 18 17 16 15 14

Esempio. N = 10; Alleli A 1 20 19 18 17 16 15 14 13 12 11 10 9 8 7 6 5 4 3 2 1 0 2 N = 20; Alleli A 2 0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 fr(A 1) p = 0. 7; fr(A 2) q = 0. 3 Probabilità della combinazione (0. 7)20 20(0. 7)19(0. 3) 190(0. 7)18(0. 3)2 1140(0. 7)17(0. 3)3 4845(0. 7)16(0. 3)4 15504(0. 7)15(0. 3)5 38760(0. 7)14(0. 3)6 77520(0. 7)13(0. 3)7 125970(0. 7)12(0. 3)8 167960(0. 7)11(0. 3)9 184756(0. 7)10(0. 3)10 167960(0. 7)9(0. 3)11 125970(0. 7)8(0. 3)12 77520(0. 7)7(0. 3)13 38760(0. 7)6(0. 3)14 15504 (0. 7)5(0. 3)15 4845 (0. 7)4(0. 3)16 1140(0. 7)3(0. 3)17 190(0. 7)2(0. 3)18 20(0. 7)1(0. 3)19 (0. 3)20 Valore della probabilità 0. 00008 0. 00068 0. 00278 0. 00716 0. 13042 0. 17886 0. 19164 0. 16426 0. 11440 0. 00654 0. 00308 0. 00120 0. 00039 0. 00010 0. 00002 0. 00000 0. 31998 0. 28999