Consulenza genetica La consulenza genetica comunicazione informata ed
- Slides: 188
Consulenza genetica La consulenza genetica è comunicazione informata ed appropriata Per essere informata deve partire dall’individuazione di un difetto genetico in un paziente e dal calcolo del rischio per gli altri componenti della famiglia Per poter essere appropriata deve saper stabilire un rapporto di fiducia e di confidenza senza essere direttiva, cioè non deve indirizzare la famiglia verso un unico obiettivo, ma lasciare libertà di valutazione e di scelta La consulenza genetica può riguardare: 1. la diagnosi di una malattia genetica clinicamente manifesta 2. il rischio riproduttivo di una coppia in epoca preconcezionale 3. la diagnosi prenatale 4. la predizione di una malattia genetica futura 5. la suscettibilità genetica
Consulenza genetica distinguiamo due grandi categorie di patologie genetiche: 1) monoalleliche, dovute alla mutazione di una sola copia del DNA 2) bialleliche, dovute a mutazioni di entrambe le copie del DNA • patologie a penetranza completa (in genere disordini mendeliani) • a penetranza incompleta, o addirittura “circoscritta”. La consulenza genetica cerca di stabilire quali membri della famiglia sono interessati ed eventualmente quali possono essere portatori, e quindi calcolare la probabilità di ogni altra persona nella famiglia (anche non ancora nata) di essere un portatore o di ereditare la malattia
rischio riproduttivo generale per una coppia per cui l’anamnesi personale e familiare abbiano escluso un incremento del rischio rispetto alla popolazione è • 3 -5% in caso di difetti congeniti rilevabili alla nascita (anomalie cromosomiche 0. 65%) • 8 -10% rilevabili entro i 10 anni di età
Durante la mitosi: ciascun cromosoma si duplica • le copie si separano. producendo due copie identiche: i cromatidi fratelli. • ciascuna copia migra in una cellula I cromatidi restano associati mediante il centromero. cromatidi fratelli centromero
LE FASI DELLA MITOSI • Interfase • Profase • Metafase • Anafase • Telofase
meiosi • La meiosi è il processo che porta alla formazione dei gameti • I gameti sono cellule aploidi: hanno la metà dei cromosomi delle cellule diploidi • 23 è il numero di cromosomi dei gameti • 46 è il numero di cromosomi di ogni altra cellula umana • La meiosi consiste in due divisioni cellulari meiosi I (riduzionale) e meiosi II (equazionale) che producono quattro cellule aploidi
meiosi Meiosi I Replicazione del DNA 46 cromosomi 92 Cromatidi / 92 ds. DNA Divisione riduzionale separazione delle coppie di cromosomi 23 cromosomi 46 cromatidi / 46 ds. DNA Meiosi II Separazione dei cromatidi 23 cromosomi 23 cromatidi / 23 ds. DNA
Meiosi I 46 cromosomi 92 Cromatidi / 92 ds. DNA 1. 2. 3. 4. Profase I: ciascun cromosoma si duplica e le due parti restano strettamente associate. Questi sono chiamati cromatidi fratelli. Il crossing -over avviene in questa fase Metafase I: I cromosomi omologhi si allineano al piano equatoriale Anafase I: Le coppie omologhe si separano e i cromatidi fratelli restano uniti Telofase I: le due cellule figlie contengono solo un cromosoma di ciascuna coppia
meiosi I, profase I • Leptotene – i cromosomi si rendono visibili • Zygotene – le coppie di cromosomi omologhi formano le tetradi • Pachitene – crossing over • Diplotene – i cromosomi iniziano a separarsi ma sono tenuti insieme dai chiasmi • Diacinesi – ulteriore accorciamento dei cromosomi omologhi
Meiosi II 23 cromosomi 23 cromatidi / 23 ds. DNA 1. Profase II: il DNA delle due cellule figlie non si replica. 2. Metafase II: i cromosomi si allineano al piano equatoriale 3. Anafase II: I centromeri si dividono e i cromatidi fratelli migrano separatamente a ciascun polo 4. Telofase II: la seconda divisione cellulare è completa. Quattro cellule figlie aploidi (23) sono ottenute
Spermatogonium Oogonium Primary spermatocyte Primary oocyte Secondary spermatocytes Secondary oocyte Gametogenesi Polar Body I 4 spermatids Polar Body II Fertilized Ovum 4 spermatozoa
Oogonium spermatogonio Per tutta la vita Mitosi alla pubertà Primary oocyte spermatocita primario maschio spermatocita Secondario Meiosi in Secondary oocyte 64 gg Polar Body I 4 spermatidi Polar Body II Fertilized Ovum 4 spermatozoi
Periodo fetale Oogonio Mitosis alla nascita o prima Meiosi in progress dopo la nascita Si arresta al diplotene della meiosi I oocita primario dopo la pubertà femmina Meiosi I completa oocita secondario e corpo polare I Si arresta alla metafase II Alla fertilizzazione Meiosi II completa Fertilized Ovum & Polar body II
Cromosomi (corpi colorati) • durante il ciclo cellulare i cromosomi replicano e si formano due cromatidi fratelli tenuti insieme dal centromero • braccio corto = p (petit) • braccio lungo = q (lettera successiva)
citogenetica di routine da linfociti sono rappresentativi di ciascun altra cellula del corpo
citogenetica prenatale • da amniociti • da villi coriali • dovrebbero essere rappresentativi delle cellule del feto • difficili da ottenere
Cromatina (DNA+proteine) • Eucromatina - meno condensata contiene il DNA codificante • Eterocromatina - più condensata non contiene DNA codificante, ma solo DNA non codificante • Telomeri - cappucci all’estremità dei cromosomi che comprendono ripetizioni multiple della sequenza TTAGGG • Centromeri - regioni specializzate di DNA che forniscono il sito di ancoraggio del fuso mitotico
Eucromatina ed eterocromatina
Tecnica Procedura Banding pattern bandeggio G Proteolisi limitata seguita dalla colorazione Giemsa Le bande scure sono ricche in AT Le bande chiare sono ricche in GC bandeggio R denaturazione al calore seguita dalla colrazione con Giemsa Le bande scure sono ricche in GC Le bande chiare sono ricche in AT bandeggio Q digestione enzimatica e colorazione con un colorante fluorescente, cioè la Quinacrina Le bande scure sono ricche in AT Le bande chiare sono ricche in GC bandeggio C denaturazione con idrossido di bario e poi colorazione con Giemsa Le bande scure sono ricche in eterocromatina costitutiva
Colorazione dei cromosomi con coloranti specifici per regioni ricche in AT o in GC
• metacentrici, se il centromero è centrale 1, 2, 3, 16, 17, 18, 19 • submetacentrici, se il centromero non è centrale e non è vicino ad un’estremità 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 20, X, Y • acrocentrici, se il centromero è vicino ad un’estremità 13, 14, 15, 21, 22
CCDS IDs per chromosome Count 1 2, 513 2 1, 548 3 1, 299 4 898 5 1, 028 6 1, 236 7 1, 094 8 807 9 921 10 971 11 1, 509 12 1, 240 13 385 14 749 15 711 16 967 17 1, 370 18 350 19 1, 616 20 672 21 282 22 530 X 967 Y 53 XY 23
Eteromorfismi citogenetici • Variazione pericentromerica del crom. 9 9 qh+ • Inversione 9 inv • Variazione + inversione
Ereditarietà della variazione pericentromerica del cromosoma 1
Le alterazioni cromosomiche sono più frequenti al crescere dell’età materna, mentre le mutazioni puntiformi sono legate al numero di divisioni cellulari che avvengono circa ogni 15 gg nella linea germinale maschile
tritest interpretazione dei risultati anomalia fetale NTD =difetti del tubo neurale* AFP Beta h. CG Alfa-feto proteina Normale Trisomia 21 Trisomia 18 * NTD: anencefalia, spina bifida and encefalocele u. E estriolo non coniugato Normale
Il duotest (double screen) include la valutazione del PAPP-A (Pregnancy Associated Plasma Protein A) e la frazione libera della gonadotropina corionica (free-beta. HCG). Viene effettuato tra la 10 ma e la 13 ma settimana di gravidanza dal siero della gestante Translucenza nucale free-b. HCG PAPP-A Trisomia 21 ++ ++ - Trisomia 13, 18 +++ -- -- S. di Turner ++++ +/- - Triploidia materna +/- --- Triploidia paterna ++++ +/-
Patologia fetale NTD - AFP solo Trisomia 21 - Tritest Trisomia 18 - Tritest Sensibilità 75 -80% spina bifida 95% anencefalia 70% Down sindrome 80% sindrome di Edward
Anomalie ecografiche maggiori
ecografia • “segni minori”
Frequenza di anomalie cromosomiche negli aborti spontanei (39. 8%-40. 9%) • • • trisomie autosomiche 49 -52% Turner (45, X) 15 -19% triploidia (69) 15 -16% tetraploidia (92) 5 -6% altre anomalie 6 -14%
trisomia 21 Down Il 70% delle gravidanze non giunge a termine
1 1 2 2 1 1 2 2 Meiosis 1 error Meiosis 1 1 1 2 + 2 1 Meiosis 2 1 1 SEA 3069 or 1 2 2 1 1 2 1 2 Meiosis 2 error Meiosis 2 1 1 + 2 1 Meiosis 1 or 3 other combinations 1 1 + 1 2 Meiosis 2 1 or other combinations Mitotic error 2 1 1 2 2
origine dell’extra cromosoma 21 MM 2 19. 8% MM 1 68% PM 1 2. 6% PM 2 4. 1% MIT 5. 5% Data from the Antonarakis and Hassold laboratories sea 3109
anomalie cromosomiche riscontrate 13 12 11. 2 p 11. 1 mosaicism 11. 2 2 altre t 3 t 21; 22 21 17 t 21; 21 5 t 15; 21 q 6 t 13; 21 22. 1 15 t 14; 21 925 free T 21 1000 10 1 Numero DSCR Anomalia 11. 1 27 D 21 S 17 22. 2 ETS 2 22. 3 MX 1 HC 21
Ipotesi sulla variabilità del fenotipo di 6 individui diversi in caso di trisomia 21 in presenza di varianti alleliche fenotipo Livello di espressione
40. 000 casi in Italia trisomia 21 Down u Neurologici : – Ritardo mentale 100% – Alzheimer dopo i 35 anni u Ipotonia muscolare 100% u Bassa statura 70% u Testa : – Brachicefalia 75% – Epicanto 60% – brushfield spots iride 55% – lingua protrudente 45% – orecchie displastiche 50% 100%
trisomia 21 Down u Arti corti, mani larghe 65% u Mignolo corto 60% u Solco palmare trasverso 60% u Cuore u u – Difetti cardiaci congeniti 40% – Canale atrioventricolare 16% Anomali gastrointestinali – Atresia/stenosi duodenale 250 x – ano imperforato 50 x – Hirschsprung 300 x Sangue: – Leucemia acuta megacariocitica – Leucemia (ALL e AML) 300 x 10 -20 x
trisomia 18 Edwards • (1/6. 500 nati) • 90% dei casi nondisgiunzione materna • M/F = 1/4 • Giunge a termine solo il 2. 5% dei concepimenti • Di questi il 33% muore nel primo mese, il 50% entro 2 mesi • Oltre 100 anomalie • Peso sotto la norma, difficoltà suzione • Ipotonia • Idrocefalo, epilessia • Malformazioni cardiache • sinclinodattilia, unghie poco sviluppate • piedi a calcagno prominente • Gambe incrociate
trisomia 13 Patau http: //www. livingwithtrisomy 13. org • (1/12. 000 -20. 000 nati) • 90% dei casi nondisgiunzione materna • Giunge a termine solo il 2. 5% dei concepimenti • Di questi il 33% muore nel primo mese, il 50% entro 2 mesi • Peso sotto la norma, difficoltà suzione • Oloprosencefalia, microcefalia • Cecità e sordità • Occhi che possono fondersi • Labiopalatoschisi 80% • epilessia • Malformazioni cardiache • sinclinodattilia • piedi a calcagno prominente
XX o XY • Il sesso maschile è determinato dalla presenza del cromosoma Y • Si sono evoluti meccanismi per compensare la differenza di dosaggio genico del cromosoma X, presente in 2 copie nelle femmine e in 1 copia nei maschi
2 cromosomi X nelle donne, 1 solo negli uomini? 1. 2. il cromosoma X raddoppia l’espressione di tutti i geni contenuti, cioè si produce 2 volte più RNA nelle femmine uno dei due cromosomi X è inattivato casualmente in ciascuna cellula allo stadio di blastocisti
Il Klinefelter? 1. 2. Nel Klinefelter (XXY) uno dei due cromosomi X è inattivato casualmente in ciascuna cellula allo stadio di blastocisti Quindi il dosaggio sarebbe mantenuto
Sindrome di Klinefelter (47, XXY) 1: 900 -1: 600 maschi • Il 50% delle gravidanze giunge a termine • Fenotipo maschile • Caratteristiche principali: • Statura alta – Ipogonadismo, bassi livelli di testosterone, mancata produzione di spermatozoi (azoospermia) e quindi sterilità – Ginecomastia – Sia l’intelligenza sia l’attesa di vita sono quasi normali
Altre forme citogenetiche • Ma ci sono anche Klinefeler 48, XXYY and 48, XXXY in 1 caso su 17, 000 e 1 su 50, 000 mnati maschi • 49, XXXXY in 1 caso su 85, 000 -100, 000 • Ci sono maschi 46, XX in cui avviene una traslocazione di parte di cromosoma Y sul cromosoma X che include la sex determining region (SRY) • mosaici
Le regioni PAR presenti sui cromosomi sessuali contengono geni che non sono inattivati, perché il doppio dosaggio è assicurato comunque PAR 1 ha 24 geni, PAR 2 ha solo 4 geni
Il gene SHOX Short stature HOmeobo. X-containing • Mutazioni o delezioni del gene SHOX nella regione PAR 1 causa ritardo di crescita e bassa statura. • La bassa statura di donne con sindrome di Turner Syndrome (X 0) è il risultato di una sola copia di SHOX (ma anche il quarto metacarpo corto) • La maggiore statura nel Klinefelter (XXY) e nella tripla X (XXX) potrebbe essere il risultato di 3 copie di SHOX
variabilità dei geni del cromosoma X delle regioni PAR, quindi non inattivati 3 copie nel Klinefelter, ma anche nella tripla X Mario Rossi Luca Bianchi Pio Verdi Giulio Rosa Lucio Viola Gianni Neri Livello di espressione
A complicare le cose… • circa il 15 % dei geni umani presenti sull’X sfugge all’inattivazione, mentre nel topo questa è un’evenienza rara (solo 6 geni in tutto) • alcuni sono espressi al 50 -100% altri al 10% • questo fenomeno è quindi incompleto e le donne hanno una elevata eterogeneità nell’espressione di geni dell’X
ipotesi sulla variabilità di ogni singola manifestazione clinica di Klinefelter in presenza di varianti in geni del cromosoma X non inattivati Manifestazione clinica: NO Mario Rossi Luca Bianchi Pio Verdi Giulio Rosa Lucio Viola Gianni Neri Livello di espressione Manifestazione clinica: SI
Quanti Klinefelter? • Prevalenza di XXYs è cresciuta da 1. 09 a 1. 72 per 1000 maschi nati (P=0. 023) • Questo incremento non è dovuto all’aumento dell’età materna • Sono nati 290. 330 maschi in Italia e 31. 573 maschi in Campania nel 2007 • max 300 -500 nuovi Klinefelter ogni anno in Italia (32 -52 in Campania) • XXY è la sola trisomia nota in cui circa il 50% dei casi è causato da una non disgiunzione alla prima divisione meiotica paterna
Trisomia X (47, XXX) 1: 1. 200 • Il 70% delle gravidanze giunge a termine • Errore nella disgiunzione materna e correla con l’età materna • Caratteristiche principali: – Statura alta – Fertilità normale, irregolarità ciclo – Sia l’intelligenza sia l’attesa di vita sono normali
Maschio (47, XYY) 1: 1. 000 maschi • Fenotipo maschile • Caratteristiche principali: – Statura alta – Fertilità normale – Non vi è correlazione con l’età paterna – Sia l’intelligenza sia l’attesa di vita sono perfettamente normali
Monosomia X (45, X 0) Turner Prende il nome dall’endocrinologo Henry Turner che la descrisse nel 1938 La sindrome di Turner (TS) definisce un complesso fenotipo umano femminile, dovuto a completa o parziale assenza del secondo cromosoma sessuale Dipende da un errore nella spermatogenesi nell’ 80% dei casi e non correla con l’età dei genitori Un precedente figlio con TS non aumenta il rischio riproduttivo previsto per una coppia di pari età
Monosomia X (45, X 0) Turner È l’unica monosomia compatibile con la vita, ma il 98% di tutti i feti monosomici TS va incontro ad aborto spontaneo L’incidenza negli aborti è circa il 7 -10%, mentre alla nascita è 1/2500 femmine. Non è chiaro perché il cariotipo 45, X 0 sia letale in utero ed invece compatibile con la sopravvivenza postnatale La vera monosomia del cromosoma X è responsabile del 45% dei casi TS; gli altri hanno mosaicismo (45, X 0/46, XX) e/o un anormale cromosoma X o Y Un basso livello di mosaicismo somatico Turner, inferiore al 2%, è di normale riscontro nella popolazione
Monosomia X (45, X 0) Turner “la menopausa precede il menarca” Le ovaie sono allungate e formate da tessuto stromale privo di follicoli: gli oociti sono spesso andati in apoptosi prima dei 2 anni di vita L’insufficienza ovarica prepuberale porta ad amenorrea primaria, sterilità e carenza di estrogeni In meno del 10% dei casi, la pubertà può verificarsi e sono possibili gravidanze con un aumentato rischio di perdita fetale Anche in rapporto all’eterogeneità del genotipo, il fenotipo si manifesta in modo molto variabile
Monosomia X (45, X 0) Turner 1: 2. 500 • patologie dell’orecchio medio (otite media ricorrente) • Linfedema con rigonfiamento delle mani e dei piedi • pterigio del collo (presenza di pliche cutanee con • aspetto di sfinge) • il quarto metacarpo (anulare) più corto • una mandibola più piccola (micrognazia) • torace largo con aumento degli • spazi intercostali • l’attaccatura bassa delle orecchie e dei capelli • Si possono anche riscontrare cardiopatia sinistra (valvola aortica dicuspide, coartazione aortica), ipertensione e anomalie renali
feto con anomalia cromosomica (mosaicismo) • • trisomie a mosaico 8, 9, 13, 18, 21 crescita in coltura di cellule materne mosaicismo vero (livello III) pseudomosaicismo (livelli II e I)
triploidia Frequenza alla nascita = 1/10. 000 Frequenza negli aborti = 1/14 Cariotipo 69, XXY 57% Cariotipo 69, XXX 40% Cariotipo 69, XYY 3%
Tipo I, corredo sovrannumerario paterno Feto microcefalico o normale Placenta ingrossata Tipo II, corredo sovrannumerario materno Ritardo di crescita Feto con macrocefalia relativa Placenta poco sviluppata Nati vivi Basso peso Asimmetria cranio-facciale e difetti di ossificazione del cranio Microftalmia, ipertelorismo, micrognazia Sindattilia cutanea, piedi torti Anomalie genitali, ipoplasia delle surrenali Cardiopatie
Mosaicismo, quando il cambiamento avviene dopo che si è formato lo zigote 47, XXY/46, XY
Un precedente figlio con anomalie cromosomiche Aumenta il rischio in caso di: • tutte le trisomie non mosaico • riarrangiamenti strutturali • marker cromosomi
Un precedente figlio con anomalie cromosomiche NON aumenta il rischio in caso di: • 47, XYY • triploidia, tetraploidia • sindrome di Turner
Valutazione del rischio riproduttivo nel periodo preconcezionale momento ottimale (ma oltre la metà delle gestazioni insorge inaspettatamente) raccolta dei dati (visita, abitudini, terapie, accertamenti lab) • SCOPO: identificazione dei portatori sani di malattie genetiche – portatori che hanno un rischio riproduttivo a prescindere dal partner – portatori in cui il rischio si manifesta solo nel caso di unione con un partner portatore
portatori che hanno un rischio riproduttivo a prescindere dal partner • donne con mutazioni legate all’X (esempio: Distrofia muscolare di Duchenne)
portatori che hanno un rischio riproduttivo a prescindere dal partner • mutazioni dominanti ad esordio tardivo (corea di Huntington, atassie spinocerebellari) • mutazioni dominanti a penetranza incompleta
portatori in cui il rischio si manifesta solo nel caso di unione con un altro portatore • mutazioni autosomiche recessive – con familiarità (coppia già a rischio) – senza familiarità (valutare la consanguineità)
ogni individuo è portatore sano di almeno 8 malattie genetiche recessive, di cui 3 letali • • fratelli, genitori-figli fratellastri, zii-nipoti cugini diretti (0. 5%) secondi cugini • • 1/4 omozigosi 1/8 omozigosi 1/16 omozigosi 1/64 omozigosi i difetti congeniti hanno un rischio empirico raddoppiato in caso di cugini primi non è utile l’esame cromosomico
portatori di un rischio riproduttivo indipendente dal partner • portatori di una traslocazione cromosomica bilanciata (reciproca) • scambio di materiale genetico tra cromosomi non omologhi • non vi è modificazione della dose genica • frequenza 1/520 nati • fenotipicamente normale traslocazione reciproca
traslocazioni bilanciate • lo scambio di segmenti cromosomici avviene senza perdita di alcuna informazione genetica • nessuna regione cromosomica è assente, ma è solo trasferita su un altro cromosoma • ma un gene di fusione tra due geni altrimenti separati, un evento che è comune nelle cellule maligne traslocazione reciproca
traslocazioni bilanciate (meiosi e fertilizzazione) Segregazione alternata Traslocazione bilanciata Normale Segregazione adiacente 1 Traslocazione Segregazione adiacente 2 Trisomia La formazione di tetravalenti aiuta a capire: solo con la segregazione alternata si formano gameti normali o con traslocazione bilanciata, mentre le segregazioni adiacenti 1 e 2 portano alla traslocazione sbilanciata o alla trisomia
traslocazioni robertsoniane (rob) rob • coinvolgono i cromosomi acrocentrici 13, 14, 15, 21 e 22 • nessuna regione cromosomica è assente, perché questi contengono un braccio corto privo di geni che può risultare perduto con la fusione dei bracci q di due cromosomi acrocentrici • La più frequente traslocazione Robertsoniana è la rob(13 q 14 q) che rappresenta il 75% di tutte le rob • segue poi la rob(14 q 21 q) e la rob(21 q 21 q) • si formano in genere durante la meiosi femminile e comportano infertilità maschile o abortività ripetuta.
Percentuale alla nascita di figli con cariotipo sbilanciato da genitori con traslocazione robertsoniana • • t(13; 14) M=F 1% t(14; 21) F 15% M 2% t(21; 22) F 10% M 5% t(21; 21) M=F 100%
Traslocazione sbilanciata • maggiori sono le dimensioni cromosomiche, minore è la possibilità di una gravidanza a termine • minori sono le dimensioni, maggiore è il rischio di un feto malformato • Sesso del genitore donna>uomo (gli spermatozoi hanno il 7. 5% di difetti contro l’ 1% degli oociti, ma sono selezionati) • Il rischio aumenta se il difetto è stato accertato a partire da un figlio precedente con cariotipo sbilanciato
rischio alla nascita di figli con cariotipo sbilanciato • Se non vi sono stati casi in famiglia e la madre è eterozigote per una traslocazione reciproca il rischio è il 7% • Se non vi sono stati casi in famiglia e il padre è eterozigote per una traslocazione reciproca il rischio è il 3% • Se vi sono stati casi di traslocazioni sbilanciate in famiglia e la madre è eterozigote il rischio è il 14% • Se vi sono stati casi di traslocazioni sbilanciate in famiglia e il padre è eterozigote il rischio è l’ 8%
inversioni • Le inversioni sono rare (meno di 1 caso su 1000) e a volte difficili da mettere in evidenza • Possono essere semplici quando comprendono due punti di rottura su di un singolo cromosoma • Sono pericentriche quando il segmento invertito contiene il centromero (es: 46, XX inv(3)p 25 q 21) • Le inversioni pericentriche dei cromosomi 1, 9, 16 e Y sono eteromorfismi citogenetici di normale riscontro in soggetti sani • Le inversioni sono dette paracentriche se confinate ad uno dei due bracci (es: 46, XX. Inv(11)q 21 q 23) • L’eterozigote per un’inversione è un soggetto normale.
coppia con familiarità per anomalie cromosomiche è indicazione all’esecuzione di un cariotipo fetale e l’estensione dell’indagine ai parenti • traslocazioni X-autosoma – maschi sterili, femmine inattivano la X normale • traslocazioni robertsoniane – non 21 60% cariotipo bilanciato – 21 15% rischio di Down, se è eterozigote la madre 1% se è eterozigote il padre • inversioni – pericentriche varianti dell’ 1, 9, 16 e Y, in altri casi il rischio è 5 -10% – paracentriche, rischi inferiore allo 0. 5%
donna eterozigote per una traslocazione bilanciata X-autosoma
disordine genomico submicroscopico un disordine genomico submicroscopico è una patologia causata da • acquisizione • perdita • alterazione di uno o più geni contigui le cui variazioni di dosaggio possono produrre effetti fenotipici La base molecolare è rappresentata da riarrangiamenti genomici, quali duplicazioni, delezioni, inversioni, senza alterazioni apparenti del cariotipo (<5 Mb)
FISH
Sonde FISH le sonde FISH devono essere mirate, non possono essere utili nell’analisi genomica generale telomero centromero locus intero cromosoma
FISH
dominanza e recessività • in genetica, il carattere (o l’allele) è dominante se l’eterozigote è indistinguibile dall’omozigote • in medicina la malattia è: – dominante: fenotipo clinicamente manifesto con 1 allele mutato – recessiva: fenotipo clinicamente manifesto con 2 alleli mutati (omozigote o eterozigote composto)
La maggior parte dei geni autosomici si trova nella condizione A o C: il dosaggio genico critico è <50%. In tal caso, si osserva un fenotipo patologico solo se entrambi gli alleli sono colpiti I geni autosomici responsabili della patogenesi dei disordini genomici si trovano nella condizione B o D: si osserva un fenotipo già in eterozigosi per aploinsufficienza. Spesso anche un dosaggio genico aumentato >>100% può determinare una patologia
aploinsufficienza • insufficiente quantità di prodotto genico causata da una mutazione in eterozigosi • la mutazione è di tipo allele amorfo o ipomorfo • colpisce geni per i quali il 50% di prodotto genico non è abbastanza per garantirne la funzione • spesso un dosaggio preciso è richiesto ai fattori di trascrizione e alle molecole di segnale espressi nel corso dello sviluppo
In caso di delezioni del cromosoma X nei maschi si osserva direttamente in fenotipo come sindrome da geni contigui In caso di delezioni autosomiche in eterozigosi, molto spesso il dosaggio dimezzato non è causa di malattia. Quando si osserva una sindrome da delezione, è risolutivo trovare la stessa sindrome causata da una mutazione puntiforme in uno solo dei geni. Se questa non si trova, la sindrome esiste solo come somma di più difetti.
ACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTC CGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGC GACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTA GCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCG CACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCT CTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACCGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGAT ATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGAACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGC TCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGC GCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGG CTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCG ATATAGCTCGCGACACAGA TATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCAC ACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATAT ATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGA GACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACA CCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATA TAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGT AGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGACGAGA CGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAG CGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGAC GTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAG ACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCC CTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACACACAGATATATAGCG CTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGATAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCT AGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCT AGCTCCTCTCGACGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTC GCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACC GCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACC GCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGACGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTC GAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGA AACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACACACAGATATATAGCGCTCCCTGA AACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGACGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGAC ACACACAGATATTATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGACGAG ACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATA GCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACA CGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTTATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTA GCTCCTCTCGACGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGAC ACACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCG AGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGC ACACCGCTCGAGATAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCT CGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGACGAGACGTAGGGC TCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCT GAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGACGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACAC GTGCTAGCTCCTCTCGACGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTC ACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACAC AGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCT CTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGA
ACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTC CGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGC GACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTA GCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCG CACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCT CTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACCGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGAT ATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGAACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGC TCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGC GCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGG CTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCG ATATAGCTCGCGACACAGA TATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCAC ACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATAT ATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGA GACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACA CCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATA TAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGT AGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGACGAGA CGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAG CGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACTATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACCGAGACGTAGGGCTCTCGATATA GCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGC TAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCG ACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAG CTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCT AGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACA GCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACA GCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGACGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGAC GTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACA CACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTC CTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACA GATATATAGCGGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGATAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCT CCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACACACAGATATATAGCGCT CCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGACGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGA CCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCT CGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGTAGGGCTCTCGATATAGCT CGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGACGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTC CGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTTAGCTCCTCT CGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATA TATAGCGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGACGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAG ATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACAC CGCTCGAGACCTTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACACACAGATATATAGCGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACAC AGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGACGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATAT AGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTTATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTG AAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGACGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTGACACGTGCTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGACACAGATATATAGCGCTCCCTGAAACAGCTCCGACACAGCTCGCACACCGCTCGAGACCTTAGCTCCTCTCGAGACGTAGGGCTCTCGATATAGCTCGCGA Copy Number Variation 10% of the human genome could vary in copy number 1 2
duplicazioni segmentali • il genoma umano contiene complessivamente il 13, 7% di segmenti duplicati con almeno il 90% di identità di sequenza • il 5, 2% del genoma contiene segmenti duplicati lunghi tra 1 e 10 kb, mentre il 4, 5% tra 10 kb e 20 kb • i cromosomi più colpiti sono l’Y (50, 4%) ed il 22 (11, 9%), ma anche il 7, 9, 10, 15, 16, 17 e X • le duplicazioni segmentali possono essere intracromosomiche o intercromosomiche • con tre localizzazioni differenti: – pericentromeriche (47 Mb, dupliconi originati da altri cromosomi) – subtelomeriche (ciascuna solo 50 -100 kb, orientate) – interstiziali (solo nella specie umana sono disseminate ad una distanza media di 3 Mb)
Malattie autosomiche dominanti Come fanno le delezioni in uno solo dei due alleli a costituire un carattere dominante? 1. il livello dimezzato di prodotto genico è insufficiente a mantenere il fenotipo 2. il difetto eterozigote diviene omozigote a livello delle cellule dei tessuti periferici (LOH) 3. un solo allele è espresso per imprinting dell’altro
principali sindromi da delezione
Sindrome di Di. George
Di. George/velocardiofacciale La sindrome di Di. George del 22 q 11. 2 è la più frequente sindrome da microdelezione, con un incidenza di 1 su 4000— 5000 nati La delezione comprende 3 Mb ed almeno 30 geni
• Migrating neural crest cells make a contribution to the embryonic structures affected in Di. George syndrome. • The cartoon represents a human embryo at 4– 6 weeks gestation. • The migration of neural crest cells from the hindbrain to the branchial arch/pharyngeal pouch system and cardiac outflow tract is indicated by the arrows. • Examples of malformations associated with perturbation of this process are listed and these overlap substantially with those seen in 22 q 11 DS AAA, arch arteries; PDA, persistent ductus arteriosus; IAA, interrupted aortic arch.
Di. George • È caratterizzata da – Anomalie cardiache – T-cell deficit – palatoschisi – anomalie facciali – Ipocalcemia Mutazioni puntiformi del gene TBX 1 possono portare a questi 5 tratti fenotipici, ma non alle difficoltà nell’apprendimento che è invece frequente nella sindrome da delezione
Williams-Beuren • prevalenza alla nascita 1/75001/20. 000, ma può non essere diagnosticata
Williams una delezione tipica
Williams genetica • delezione “de novo” • trasmissione autosomica dominante • delezione di 1. 6 MB da 21 geni contigui in eterozigosi a 7 q 11. 23 – gene dell’elastina – LIM kinase 1 (LIMK 1) – CLIP-115 che lega i microtubuli – Fattori di trascrizione GTF 2 IRD 1 – effetto posizionale su altri geni circostanti la delezione
Williams FISH delezione 7 q 11. 23 nrilevabile mediante FISH ma non cariotipo
Williams comportamento • lieve o medio ritardo mentale (IQ tra 41 e 80) • scarsa capacità di concentrazione • ritardo nell’apprendimento del linguaggio e poi esagerata loquacità • personalità amichevole e affettuosa • danno facilmente confidenza anche a sconosciuti • ansietà, spesso preoccupati per il benessere altrui • ipersensibilità ai suoni • memoria visiva e uditiva spesso fuori dal comune • ricordano persone, luoghi e motivi musicali • predisposizione ad imparare le lingue e la musica
Williams aspetto e segni • Faccia da elfo • Occhi blu (77%) con pattern stellato dell’iride (74%) ma questo vale per i nordeuropei, strabismo (40%) • Naso con la punta bulbosa • bocca larga e guance piene • microdontia e micrognazia • Statura 10 cm in meno del normale • ipercalcemia • stenosi periferica delle arterie polmonari • stenosi aortica sopravalvolare
http: //www. wsf. org/family/photoalbum/wsfphoto. htm Williams foto
Williams foto
Wolf-Hirschhorn genetica • delezione “de novo” di circa 4 MB • le delezioni sono più frequenti nella linea germinale maschile • trasmissione autosomica dominante • Regione critica di 165 kb di molti geni contigui in eterozigosi a 4 p 16. 3
Wolf-Hirschhorn delezione a 4 p 16. 3
Wolf-Hirschhorn • • Scarso accrescimento Ritardo mentale, ipotonia Labbro leporino Conformazione ad elmo di guerriero greco
Sindrome 5 p- (cri du chat) 1: 50. 000 nati • Pianto acuto e flebile • Caratteristiche principali: – Ritardo di crescita – Microcefalia ed ipertelorismo – Ipotonia, diastasi dei retti – Deficit intellettivo e del linguaggio
Imprinting
Imprinting • Nelle cellule germinali primordiali l’imprinting viene cancellato del tutto e il DNA è demetilato • Successivamente nella linea germinale maschile si determina un pattern di imprinting che in alcuni loci è complementare a quello della linea germinale femminile • I cromosomi su cui avviene l’imprinting (7, 11, 15) manterranno questo pattern e lo riprodurranno ad ogni mitosi • Si potranno sempre distinguere l’espressione genica del cromosoma materno e paterno
Disomia uniparentale • Due copie dello stesso cromosoma sono ereditate dallo stesso genitore • Spesso questo avviene attraverso un fenomeno transitorio di trisomia, seguito dalla perdita del cromosoma singolo e mantenimento del cromosoma doppio
Angelman • 70% dei casi delezione della regione cromosomica 15 q 11 -q 13, che è soggetta al fenomeno dell'imprinting del cromosoma paterno • Il gene materno (l'unico espresso) può essere alterato con 4 meccanismi noti: – – delezione disomia uniparentale paterna difetti nell'imprinting mutazioni a carico del gene UBE 3 A (ubiquitin ligasi) • La diagnosi è clinica e il difetto genetico non si identifica nel 20% dei casi
Angelman • "happy puppet syndrome" si può identificare in Cucciolo (Dopey) "addormentato", il più giovane dei nani che non ha mai imparato a parlare • ritardo mentale con assenza del linguaggio, difficoltà nell'equilibrio, eccessivo buon umore
Angelman • L'incidenza è 1/20. 000 nati • crisi epilettiche e comunque alterazioni dell'EEG e microcefalia relativa
Prader-Willi • • • iperfagia>obesità eccessiva assunzione di liquidi reazioni abnormi ai sedativi acromicria, criptorchidismo insensibilità al dolore, lesioni cutanee sbalzi di umore
Prader-Willi 1/15. 000
Nomenclatura delle delezioni • Le delezioni sono designate con la sigla del che segue i numeri dei nucleotidi a monte e a valle della delezione separatida un segno _ – 82_83 del (o 82_83 del. TG) indica una delezione di TG nella sequenza ACTTTGTGCC (dove A è il nucleotide 76) che diventa ACTTTGCC
Cosa sono le distrofie muscolari? • Malattie degenerative progressive • Variazione dello spessore delle miofibrille con forti cambiamenti nella istologia del muscolo • indebolimento e degenerazione del tessuto muscolare in fibroso e adiposo • aree di necrosi con processi infiammatori
Duchenne Becker Emery. Dreifuss facioscapoloomerale cingoli distale oculo- faringea
Distrofia muscolare Duchenne/Becker DMD Duchenne - 1/3, 500 maschi • Insorgenza -- Infanzia - tra 2 e 6 anni • Sintomi – Debolezza generalizzata e danno muscolare prima agli arti e al tronco, polpacci ingrossati • Progressione – Lenta ma inesorabile. Colpisce tutti i muscoli volontari. Sopravvivenza fino a 25 -30 anni BMD Becker - 1/10, 000 maschi • Insorgenza – Adolescenza o dopo • Sintomi – Identici alla DMD ma più attenuati. Vi è coinvolgimento cardiaco significativo • Progressione – Più lenta e più variabile della distrofia di Duchenne con buona aspettativa di vita
Le delezioni intrageniche del gene della distrofina mandano fuori cornice la lettura delle triplette quando gli esoni cancellati contenevano un numero di nucleotidi che non è multiplo esatto di tre (1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, 11 ecc). Questo causa la distrofia di Duchenne.
Le delezioni intrageniche non alterano la cornice di lettura portano alla distrofia muscolare di Becker o ad un apparente buona salute. Forniscono informazioni per preparare delle microdistrofine per la terapia genica
Nomenclatura delle delezioni • Le delezioni sono designate con la sigla del che segue i numeri dei nucleotidi a monte e a valle della delezione separatida un segno _ – 82_83 del (o 82_83 del. TG) indica una delezione di TG nella sequenza ACTTTGTGCC (dove A è il nucleotide 76) che diventa ACTTTGCC
La tecnica del CGH (comparative genomic hybridization) permette l’individuazione di sequenze delete o duplicate nel genoma da testare (red) mediante il confronto con un genoma di riferimento (green). Sono preparate due sonde fluorescenti di colore diverso che ibridano contemporaneamente sui cromosomi. Se in una regione cromosomica prevale il colore (green) relativo al genoma di controllo questo significa che il genoma da testare (red) ha una delezione in quella regione
classificazione funzionale delle mutazioni 1. allele equivalente 2. allele ipomorfo 3. allele amorfo 4. allele ipermorfo 5. allele neomorfo 6. allele antimorfo
1. allele equivalente • variazione che non modificano né la quantità, né la qualità biochimica e funzionale del prodotto genico • il prodotto genico risulta invariato e normalmente localizzato • esempi sono le circa 12, 000 differenze della sequenza del DNA codificante che si osservano nella popolazione umana che non hanno alcuna conseguenza patologica
2. allele ipomorfo • variazione della sequenza del DNA che riduce la quantità di prodotto genico e/o la sua qualità funzionale • tali alleli sono silenti e recessivi e possono agire più come modificatori del fenotipo che come causa diretta di patologia • alleli ipomorfi possono però essere causa di malattia se in emizigosi • esempio: gli alleli ipomorfi del gene della distrofina localizzato sul cromosoma X che determinano quadri di distrofia muscolare di Becker nei maschi in quanto hanno una singola copia del gene
3. allele amorfo • variazione di sequenza del DNA più drastica: corrisponde classicamente alla delezione (cancellazione) della sequenza codificante del gene • un allele amorfo può essere prodotto da altri tipi di mutazione che abbiano la medesima conseguenza di una delezione totale del gene • causa in emizigosi una malattia genetica quando colpisce una funzione genica essenziale (es emofilia, distrofia muscolare di Duchenne, ecc) • l’allele amorfo in eterozigosi in genere è presente in un portatore sano di una malattia autosomica recessiva • può da solo essere causa di malattia se riguarda un gene in cui il 50% del dosaggio (prodotto dall’altro allele non mutato) è insufficiente a mantenere lo stato di salute (aploinsufficienza)
4. allele ipermorfo • ipermorfo (iper= aumentato) è l’allele che determina l’aumentata quantità o funzione di un prodotto genico • l’allele ipermorfo può essere semplice o avere una combinazione di altri effetti come ad esempio, quello di essere presente in una localizzazione impropria o in un tempo sbagliato • è associato di regola ad un tratto genetico dominante, in quanto l’aumentata espressione/funzione non può essere limitata dall’allele non mutato • un esempio è l’aumentata funzione del recettore per l’FGF 3 che causa l’acondroplasia (nanismo dismorfico) che è appunto a trasmissione autosomica dominante
5. allele neomorfo • neomorfo (neo=nuovo) definito come causato da una mutazione che porta ad un prodotto genico nuovo o una funzione nuova • si distingue solo didatticamente dall’allele ipermorfo, in quanto è in pratica una variante che è difficile da distinguere nelle singole condizioni • valgono le stesse considerazioni fatte per l’allele ipermorfo sulla natura dominante della mutazione • in alcune forme di cancro l’allele neomorfo è una chimera di due geni, dovuta ad una traslocazione cromosomica, come il cromosoma di fusione Philadelphia con la comparsa di nuove proteine Bcr-abl in casi di leucemia mieloide cronica
6. allele antimorfo o dominante negativo • antimorfo (anti=contro) definito come causato da una mutazione che porta ad un prodotto genico antagonistico • è il risultato di una mutazione che colpisce un gene il cui prodotto proteico funziona in cooperazione con altre proteine • particolari mutazioni rendono la proteina di disturbo a tutte le altre pur essendo queste ultime perfettamente normali • un esempio è dato dal collageno in cui più geni (e due alleli per ogni gene) contribuiscono alla formazione delle proteine ciascuno producendo una parte delle catene di base: una mutazione in un solo allele produce un effetto negativo complessivo
classificazione strutturale delle mutazioni 1. sostituzioni 2. piccole inserzioni, delezioni o inserzioni + delezioni contemporaneamente (indels) 3. riarrangiamenti genomici a due (delezioni, duplicazioni) o più punti di rottura (traslocazioni, inversioni ecc. ) 4. copy number variations (CNV) a queste quattro classi appartengono in modo indistinguibile tanto le variazioni innocue quanto le mutazioni causative di malattia
mutazioni I dati di sequenziamento totale del genoma provano che almeno 10 -8 sostituzioni geniche per base si verificano nella prole de novo, cioè senza essere ereditate dai genitori tutte le nuove sostituzioni sono in eterozigosi o in emizigosi se si verificano nei cromosomi sessuali maschili le nuove sostituzioni possono produrre varianti private meno dell’ 1% cadono negli esoni codificanti dei geni • mutazioni silenti, quando l’aminoacido non cambia • mutazioni missenso quando un aminoacido è sostituito da un altro aminoacido • mutazioni nonsenso quando un aminoacido è sostituito da un codone prematuro di terminazione • mutazioni nonstop quando al contrario un codone di terminazione è sostituito da un codone di un aminoacido
Numerazione dei nucleotidi Nucleotidi del c. DNA • Il nucleotide +1 è la A dell’ ATG-codone di inizio della traduzione • Il nucleotide che precede al 5' l’ATG-codone di inizio della traduzione è denominato -1; non esiste una base 0 • Il nucleotide che segue al 3' il codone di terminazione è denominato *1
sostituzioni • le sostituzioni sono indicate dal carattere “>”. Ad esempio, 76 A>C indica che in posizione 76 un’adenina è sostituita da una citosina 88+1 G>T (oppure IVS 2+1 G>T) indica che una guanina è sostituita da una timina in posizione +1 dell’introne 2, posizionato tra i nucleotidi 88 e 89 del c. DNA 89 -2 A>C (oppure IVS 2 -2 A>C) indica che un’adenina è sostituita da una citosina in posizione -2 dell’introne 2, posizionato tra i nucleotidi 88 e 89 del c. DNA
mutazioni SNPs teoricamente previste T>A o G , C>G or A G>T o C , A>T or G trasversioni transizioni T>C, C>T, G>A, A>G 46, 000 trasversioni transizioni 12, 000 trasversioni transizioni SEA 3057
Il meccanismo più comune di mutazione NH 2 H 3 C N Cytosine H 3 C N N O O metilazione N O deaminazione 5 -methylcytosine CG CG NH TG CA N O Thymine
mutazioni puntiformi missenso • Le mutazioni missenso sono quelle in cui il cambiamento determina nel prodotto proteico la sostituzione di un aminoacido con un aminoacido differente • Sebbene queste alterazioni generalmente non provochino conseguenze nella funzionalità della proteina (polimorfismi o varianti) , ci sono casi in cui anche una minima alterazione può avere conseguenze gravi
acrocefalosindattilia sindrome di Apert • 1: 65. 000 alla nascita • craniosinostosi, volta cranica a forma conica • ipertensione endocranica • ritardo mentale • ipoplasia della parte centrale della faccia • sindattilia delle dita delle mani e dei piedi • sordità e atrofia ottica
acrocefalosindattilia sindrome di Apert • tutti i pazienti hanno la stessa mutazione Apert (Cys 755 Gly) del gene human fibroblast growth factor receptor 2 (FGFR 2) • la mutazione è in eterozigosi • de novo • cromosoma 10 q 26 • la sindrome è allelica con Crouzon e Pfeiffer
sindrome di Pfeiffer • alcuni pazienti hanno la mutazione Pfeiffer (Cys 342 Arg) del gene human fibroblast growth factor receptor 2 (FGFR 2) • altri la mutazione Pro 252 Arg in FGFR 1 • la mutazione è in eterozigosi • de novo • cromosoma 10 q 26 • la sindrome è allelica con Crouzon e Apert
disostosi cranio facciale sindrome di Crouzon • alcuni pazienti hanno la mutazione (Cys 342 Tyr) del gene human fibroblast growth factor receptor 2 (FGFR 2) • la mutazione è in eterozigosi • de novo • cromosoma 10 q 26 • la sindrome è allelica con Pfeiffer e Apert con alcune mutazioni in comune
acondroplasia • • nanismo dismorfico (1: 35. 000) arti corti e testa sproporzionatamente più grossa fronte prominente e naso appiattito altezza media 130 cm nei maschi 125 cm nelle femmine • La mutazione è in eterozigosi • Gly 380 Arg nel recettore 3 del "fibroblast growth factor" (FGFR 3) a 4 p 16. 3 • autosomico dominante a penetranza completa
acondroplasia • La mutazione conferisce una funzione aumentata al recettore dell'FGF (allele ipermorfo) che è una tirosinchinasi di membrana • In risposta all'FGF il recettore dimerizza e si fosforila trasducendo un segnale con la funzione di rallentare la proliferazione dei condrociti e quindi la crescita ossea • Topi senza il gene FGF 3 R hanno ossa lunghe e vertebre allungate
frequenza relativa di mutazioni de novo che causano acondroplasia i rapporto all’età paterna
numero di divisioni nelle linea germinale maschile
ipocondroplasia • L'ipocondroplasia ha caratteristiche simili all'acondroplasia, ma di gravità minore con un coinvolgimento craniofacciale inferiore. L'altezza può risultare ai limiti della norma e la malattia viene spesso non diagnosticata. • L'ipocondroplasia è meno omogenea: circa il 70% dei casi è dovuto alla sostituzione N 540 K del gene FGFR 3, mentre non si conosce la mutazione nel restante 30%.
mutazioni puntiformi nonsenso • La mutazione nonsenso è quella in cui la modificazione nucleotidica provoca la creazione di un tripletta di stop, che blocca la sintesi della proteina prematuramente. • In questo caso, la funzionalità della proteina dipenderà dalla posizione dello stop.
Mutazioni dei codoni umani (mutazioni independenti nei geni F 8, F 9, L 1 CAM, OTC, BTK)
mutazioni nonsenso UAA UAG UGA Su 731 mutazioni independenti SEA 3063 in 9 patologie del cromosoma X
mutazioni frame-shift • Le mutazioni frame-shift o di slittamento del modulo di lettura consistono nell’inserzione o delezione di un numero di nucleotidi non divisibile per 3 (1, 2, 4, 5, 7, 8, 10, ecc. ) conseguente sfasamento della cornice di lettura delle triplette dell'RNA messaggero. • Questa mutazione determina la traduzione non corretta della proteina a valle della mutazione.
mutazioni eterozigoti di PAX 3 Waardenburg
mutazioni eterozigoti di PAX 3 Waardenburg • sordità (o deficit uditivo di vario livello) bilaterale, • modifiche nella pigmentazione, sia dei capelli (albinismo parziale, in genere piebaldismo) che della pelle, • anomalie nello sviluppo dei tessuti derivati dalla cresta neurale • lateralizzazione del canto mediale • diverso colore degli occhi (eterocromia), di solito uno marrone e l'altro blu
Motivi classici di splicing
Nucleotidi intronici fiancheggianti • inizio dell’introne: il numero dell’ultimo nucleotide dell’esone che precede, il segno + e la posizione nell’introne, ad esempio 77+1 G, 77+2 T, oppure quando il numero dell’esone è noto ed univoco IVS 1+1 G, IVS 1+2 T • fine dell’introne: il numero del primo nucleotide del esone seguente, il segno – e la posizione a monte dell’esone, ad esempio 78 -2 A, 78 -1 G, oppure quando il numero dell’esone è noto ed univoco, IVS 1 -2 A, IVS 1 -2 G
HGMD Mutations in Intron splice sites (5 Jan 07) 2296 Acceptor Splice Site mutations 3498 Donor Splice Site mutations
exon Normal 5’ss 3’ss exon IVS Splicing Abnormalities 5’ss mutation; exon skipping 3’ss mutation; exon skipping 5’ss mutation; use of cryptic 5’ss 3’ss mutation; use of cryptic 3’ss Activation of cryptic 5’ss and use of cryptic 3’ss Activation of cryptic 5’ss Splicing enhancer mutation Lariat structure branchpoint 5’ss 3’ss IVS exon
Progeria Hutchinson-Gilford • invecchiamento precoce • bassa statura, pelle rugosa • calvizie, assenza di tessuto adiposo • aterosclerosi ed infarto
Progeria Hutchinson-Gilford • nuova mutazione in eterozigosi del gene lamina A • la mutazione è in eterozigosi • de novo • cromosoma 1 q 23 • La mutazione non cambia l'aminoacido glicina G 608 G, ma introduce un sito donor di splicing GGT che fa perdere 50 aminoacidi alla proteina • sperimentazione con inibitori di farnesil-trasferasi
Malattie genetiche da mutazione in 1 allele Le mutazioni monoalleliche possono causare disordini a trasmissione dominante o recessiva legata all’X negli uomini • • • Se la malattia a trasmissione dominante è grave in età fertile e pertanto limita o annulla la capacità riproduttiva (bassa fitness), le mutazioni monoalleliche sono nuove e spesso distribuite in modo casuale Se la malattia dominante non è grave in età fertile e non limita in alcun modo la capacità riproduttiva (normale fitness), le mutazioni monoalleliche sono ereditate da un genitore e spesso si tramandano da molte generazioni Se la malattia è recessiva legata all’X ed è letale ha una vita media di tre generazioni, perché le donne trasmettono gli alleli mutati in eterozigosi e gli uomini li eliminano
eredità autosomica dominante a penetranza completa (malattia che non modifica la fitness)
Cos’è una mutazione causativa? Una variazione della sequenza del DNA …. • . . che è trovata solo negli individui affetti • . . che non è mai ritrovata in quelli non affetti • . . che spiega il processo patologico • . . che, quando corretta per tempo, fa recuperare un fenotipo normale
…. che è trovata solo negli individui affetti. . che non è mai ritrovata in quelli non affetti penetranza incompleta che è ritrovata più frequentemente negli individui affetti rispetto ai non affetti…
Malattie genetiche da mutazione in 2 alleli Le mutazioni bialleliche possono causare disordini a trasmissione autosomica recessiva • • • Se la malattia a trasmissione recessiva è grave in età fertile e limita o annulla la capacità riproduttiva (bassa fitness), le mutazioni non si estinguono comunque perché i portatori sani sono 10 -10. 000 volte più numerosi degli affetti Le mutazioni in genere si trasmettono da 100 -1000 generazioni, mentre le nuove mutazioni sono rare Solo se la malattia è biallelica le mutazioni hanno una firma etnica che caratterizza una località di origine e un fondatore comune eterozigote sano
Malattie da 2 alleli • L’alto numero di portatori è un fattore di rischio per l’eterozigosi composta (due mutazioni differente nei due alleli). Questo potrebbe essere causato da una fitness migliore degli eterozigoti nei confronti di un fattore negativo vedi A • La consanguineità è un fattore di rischio per l’omozigosità (due alleli identici) anche se la mutazione è rarissima vedi B
conversione genica
- Cinzia parolini unimore
- Modena analisi consulenza e gestione finanziaria
- Fac simile consulenza tecnica di parte commercialista
- Consulenza di processo
- Cos'è la comunicazione unica
- 4 assioma della comunicazione
- ülinguee
- Comunicazione nei gruppi di lavoro
- Arco di distorsione nella comunicazione
- Schema assiomi della comunicazione
- Comunicazione descrittiva
- Scienze psicosociali della comunicazione
- Comunicazione organizzativa interna
- Comunicazione asincrona
- Regole della comunicazione
- La cronemica
- Comunicazione interna ed esterna
- Strumenti di comunicazione online
- Ostacoli alla comunicazione efficace
- Informatica applicata alla comunicazione multimediale bosco
- Paradigmi della comunicazione
- Gli elementi della comunicazione
- La prossemica cos'è
- Approccio matematico della comunicazione
- Comunicazione simmetrica e asimmetrica
- I sistemi di comunicazione
- Introduzione alla psicologia della comunicazione
- House organ significato
- Assiomi della comunicazione
- Industria culturale e comunicazione di massa
- Autonomia scolastica mappa concettuale
- La comunicazione scritta in albergo
- Informatica applicata alla comunicazione multimediale
- Comunicazione paraverbale
- Christina bosco
- Informatica applicata alla comunicazione multimediale bosco
- Comunicazione formale
- Assiomi della comunicazione esempi
- Comunicazione digitale sincrona
- Organizzazione e marketing per la comunicazione d'impresa
- Informatica applicata alla comunicazione multimediale
- Effetto pigmalione
- Comunicazione disfunzionale esempi
- Watzlawick assiomi
- Elementi della comunicazione verbale
- Definizione di comunicazione
- Comunicazione seriale asincrona
- Comunicare dal latino
- Comunicazione ostensiva
- Jakobson teoria della comunicazione
- Introduzione alla psicologia della comunicazione
- Sociologia della cultura e della comunicazione units
- Comunicazione interna ed esterna
- Assiomi comunicazione
- Comunicazione cciaa titolare effettivo
- Barriere della comunicazione
- Scienze della comunicazione cassino
- La comunicazione come processo sociale
- Comunicazione di vincita erasmus unica
- Genetica diretta e inversa
- Herdabilidade
- Joseph adams genetica
- Triangulo de pascal genetica
- Mendel genetica
- Epistasi duplicata recessiva
- Pulgar de ponero dominante o recesivo
- Cladogenesis
- Hongos mucosos
- Hemofilia arbol genealogico
- Mapa conceitual genética
- Genetica humana
- Tabella chi quadro genetica
- Cromosomas homologos
- Recombinación del adn en la reproducción asexual
- Información genetica
- Genetica avicola
- Deriva genetica
- Variação genética
- Mutante auxotrofo
- Genetica
- Patata amflora modificación genètica
- Variação genética
- Efecto fundador y cuello de botella
- Manipulación genética en plantas
- Genetica
- Genetica medica unife
- Objetivo de la ingeniería genética
- Proceso de polinización
- Cromosomi omologhi
- Esercizi quadrato di punnet con soluzioni
- Quién estudia la genética
- Aplicación de la ingeniería genética
- Flujo de genes
- Herencia biología
- Eterosi
- Deriva genetica
- Edizione genetica francese
- Polialelism
- Zanichelli
- Tipos de dominância genética
- Cruces geneticos
- Genetica
- Genética biologia
- Codominância
- En que fase se da el crecimiento de la celula
- Espermatogénesis
- Entrecruzamiento y recombinación genética
- Simbologia arbol genealogico
- Estudio microarray
- M
- Genetica humana
- Especiación
- Psicologia del desarrollo piaget
- Qué es el flujo de la información genética
- Genética biologia
- O que é genética
- Genetica de poblaciones
- Recombinación genética
- Penetranza genetica
- Immagini sulla genetica
- Filosofia de vida
- Deriva genetica
- Genetica immagini
- Intercinesis
- Dominância incompleta
- Sovradominanza
- Geni e alleli
- Genetica
- Allelic exclusion
- Agentes fisicos
- Variabilidad genetica
- Deriva genetica
- Segunda lei de mendel
- Tipos de valores humanos
- Sindromes hipercineticos
- Traducción de la información genética
- Valerio parisi genetica ed evoluzione
- Diseño de primers degenerados
- Magistrale genetica forense
- La conjugacion
- Pleitropismo
- Aplicación de la ingeniería genética
- Genética y herencia
- Genetica forense
- Recombinação genetica de bacterias
- Transduccion de bacterias