Codice genetico Degenerato Non ambiguo Universale con eccezioni
Codice genetico • Degenerato • Non ambiguo • Universale (con eccezioni)
Il codice genetico è universale • Eccezioni: UAA, UAG = Gln in Tetrahymena UGA = Trp in Mycoplasma
Codice Genetico dei mitocondri di mammifero Seconda Posizione UUU Phe UCU UUC UCC Ser UUA Leu UCA UUG UCG A G UAU Tyr UGU Cys UAC UGC UAA Stop UGA Stop Trp UAG UGG Trp U C A G C CUU CCU CAU CGU His CUC Leu CCC Pro CAC CGC Arg CUA CCA CAA Gln CGA CUG CCG CAG CGG U C A G A AUU Ile AUC AUA AUG Met ACU ACC Thr ACA ACG AAU Asn AGU Ser AAC AGC AAA Lys AGA Stop Arg AAG AGG U C A G G GUU GUC Val GUA GUG GCU GCC Ala GCA GCG GAU Asp GGU GAC GGC Gly GAA Glu GGA GAG GGG U C A G U Prima Posizione C Terza Posizione U
Variazioni nel codice genetico dei mitocondri Organismo Codone Significato nel Significato mitocondrio usuale Comune Mammifero UGA AG AG triptofano terminazione terminaz. arginina Mammifero Drosophila Lievito AUA AUA Met (inizio) Met (Inizio) Met (allung. ) isoleucina Lievito Drosophila CUA AGA treonina serina leucina arginina
Uso del Codice in E. coli e in H. sapiens Terza Posizione Prima Posizione Seconda Posizione
Componenti e regolatori del flusso d'informazione genetica • DNA, m. RNA • polimerasi • t. RNA e ribosomi • proteine regolatrici
L’RNA è l’intermediario tra il DNA e le proteine Autoradiografa di una cellula esposta a uridina radioattiva per 15 min e successivamente a uridina non radioattiva per 80 min
Definizioni: • genoma • trascrittoma • proteoma
Dimensioni di genomi
Composizione del genoma eucariotico
Paradosso del valore C • Eccesso di DNA rispetto alla complessità • Variazioni di valore C per complessità simili
Struttura del genoma eucariotico • Sequenze ripetute • Altri DNA non codificanti • Introni • DNA codificante
Composizione del genoma umano
Sequenze ripetute nel genoma umano • Uniche (1 -10 volte) circa 40% • Mediamente ripetute (da centinaia a migliaia di volte) 40 -50% • Altamente ripetute (da decine di migliaia a milioni di volte) 5 -10% Maggior parte dei geni in tandem intersperse Geni reiterati (r. RNA, 5 S RNA, t. RNA, Istoni etc. ) Alcune sequenze regolative Alcune sequenze a funzione speciale (centromeri, origini, etc. ) DNA satelliti, sequenze semplici
geni per: r. RNA (300) t. RNA (1300) 5 S RNA (2000) istoni (20) sequenze ripetute intersperse sequenza Alu: 300 nt (x 1. 000) sequenze semplici o satelliti: 2 -10 nt (x 2 -100 copie in tandem x 1 -100 blocchi interspersi)
Il DNA non ripetitivo è solo una parte del genoma
Composizione del genoma • Le proporzioni relative delle componenti del DNA variano nei diversi genomi eucariotici • Il contenuto assoluto di DNA non ripetitivo aumenta con le dimensioni del genoma, ma raggiunge un plateau a circa 2 x 109 bp.
La percentuale di DNA non ripetitivo tende a diminuire con l'aumentare della grandezza del genoma
Relazione tra DNA e m. RNA: procarioti Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006
Relazione tra DNA e m. RNA: eucarioti
Gene per il collagene 1 a 2 di pollo
Definizioni • Esoni: maturo sequenze rappresentate nell'RNA • Introni: sequenze rimosse dal trascritto primario
Lewin, IL GENE VIII, Zanichelli editore S. p. A. Copyright © 2006
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