BYOLOJDE ZEL KONULAR BYONFORMATK BYONFORMATK Biyoinformatik teknikler biyolojik
BİYOLOJİDE ÖZEL KONULAR BİYOİNFORMATİK
BİYOİNFORMATİK � Biyoinformatik teknikler biyolojik moleküllerin dizilimlerinin oluşturulması , üç boyutlu yapılarının tasarlanması , verilerinin analizi , depolanması , bilgilerin paylaşıma sunulması için bilgisayar ile otomize edilmiş olarak kullanılmaktadır.
BİYOİNFORMATİK NEDİR ? q The National Institutes of Health’a göre biyoinformatik ; Biyolojik , tıbbi , davranışsal ya da sağlık verilerinin kullanımı genişletmek ve bu verileri elde etmek , depolamak , organize etmek , arşivlemek , analiz etmek ya da görselleştirmek için bilgisayara dayalı araçlar ve yaklaşımların araştırılması , geliştirilmesi ve uygulanmasıdır.
BİYOİNFORMATİK NEDİR ? § Yale Üniversitesinden Luscombe ve ark. tarafından biyoinformatik ; Biyolojiyi moleküller açısından kavramsallaştıran ve uygulamalı matematik , bilgisayar bilimi ve istatistik gibi alanlardan türeyen informatik tekniklere uygulayan bir bilim dalı olarak tanımlanmaktadır.
BİYOİNFORMATİK NEDİR ? � Wikipedia’ da belirtildiğine göre ; Biyomoleküllerle ilgili bilgiyi analiz etmek için bilişim tekniklerinin uygulandığı biyoinformatik , moleküler biyoloji ile sıkı bir disiplin üzerine kurulmuştur ve yapısal genomikten gen ekspresyonu çalışmalarına kadar geniş bir alanı kapsamaktadır. Nükleotid ve aminoasit dizilerini , protein yapılarını kapsayan , çeşitli türlerde verilerin analizi ve yorumlanmasını içeren biyoinformatik , son yıllarda disiplinlerarası bir bilim dalı olarak tanınmaktadır.
BİYOİNFORMATİK DALLARI ü ü ü Moleküler Biyoloji Numerlik Analiz Genetik Matematik Proteomik Genomik Biyofizik İstatistik Evrim Veri yönetimi Algoritma
BİYOİNFORMATİĞİN AMAÇLARI 1. 2. 3. Bilimsel verileri organize etmek , Verilerin analiz edilmesine yardımcı olacak araçlar ve kaynaklar geliştirmek , Biyolojik çalışma sonuçlarını yorumlamak ve bilgiyi analiz etmek için geliştirilen araçları kullanmak ,
BİYOİNFORMATİĞİN TARİHÇESİ � Biyoinformatik biliminin gelişimi , bilgisayarların yerel ağ sistemi olarak kullanılması ve biyoteknolojideki gen ve protein verilerinin birikmesiyle başlamıştır. Bu bilim dalının başlangıcı , DNA ve protein dizi analizinin otomize edilebildiği ve biyoteknolojiyle uğraşan araştırmacıların genler ve proteinlerle ilgili büyük miktarlarda ve çok çeşitli veriler elde etmeye başladığı tarihler olan 1970 ‘ lere dayanmaktadır.
BİYOİNFORMATİĞİN TARİHÇESİ � Bu disiplin , bilgisayarların kullanıcılar tarafından veri saklama ve erişimi için çok popüler olduğu dönem olan 1980 ‘ lerin ortalarında gelişmeye devam etmiştir. Aynı dönemde bilgisayarlardan bilgiye erişim , yönetim ve depolama için çeşitli araçlar ve geliştirilmiştir
� Moleküler biyolojide elde edilen bilgilerin hızla artması , veri bankalarının daha uygun bir şekilde kullanılması ihtiyacını ortaya çıkarmıştır. Bu anlamda geliştirilen pek çok yeni teknik , biyoinformatiğin daha fazla gelişmesine neden olmuştur.
� Biyoinformatik alanı için bir devrim niteliğinde olan bu çalışmalar , yeni yazılımların ve paket programların geliştirlmesine neden olmuştur. Geliştirilen yazılımların ve paket programlarının , biyolojik simülasyon modellemeleri ile moleküler yapıları ve grafikleri analiz etmeyi , DNA –protein dizilerini karşılaştırmayı kolaylaştırması biyoinformatik biliminin temelini oluşturmuştur.
BİYOİNFORMATİĞİN BAŞLICA ÇALIŞMA ALANLARI 1. 2. 3. 4. 5. 6. Genler ve proteinler için sekans analizi araştırmaları , Gen ekspresyonu analizi araştırmaları , Protein ekspresyonu analizi çalışmaları , Protein yapılarının tahmin edilmesi araştırmaları , Protein Docking ( Doklama ) , Karşılaştırmalı genomik araştırmalar ,
BİYOİNFORMATİĞİN BAŞLICA ÇALIŞMA ALANLARI 7. Evrim araştırmaları , 8. Genom anlamlandırılması , 9. Regülasyon analizi 10. Kanserde mutasyon analizi araştırmaları , 11. Biyolojik sistemlerin modellemesi
BİYOLOJİK VERİ BANKASI NEDİR ? � Moleküler biyoloji , biyoinformatik , biyomoleküller , moleküler evrim ve genetik alanında her gün yüzlerce çalışmanın sonucu yayınlamaktadır. Elde edilen muazzam ve karmaşık bilginin organize edilmesi , genetik devrim olarak adlandırdığımız şu dönemde , önemli bir çalışma alanı olarak ortaya çıkmıştır. Böylece , bilgisayar uygulamalarının biyoloji alanında kullanılması kaçınılmaz hale gelmiş ve veri bankaları oluşturulmaya başlanmıştır. Biyolojik verilerin farklı dosya biçimlerinde , farklı veri depolama yaklaşımlarıyla çok sayıda veri kaynaklarında depolanarak , sanal ortamlar şeklinde araştırmacılar tarafından kullanılması sağlanmaktadır.
SORULAR 1. Biyoinformatiğin amaçları nedir ? 2. Biyoinformatik nedir ?
SORULAR (. . . ) Biyoinformatik biliminin gelişimi , bilgisayarların yerel ağ sistemi olarak kullanılması ve biyoteknolojideki gen ve protein verilerinin birikmesiyle başlamıştır. (. . . ) Bilimsel verileri organize etmek , biyoinformatiğin amaçlarından birisidir. (. . . ) Biyoinformatik disiplinlerarası bir bilim dalı değildir. (. . . ) Modern biyolojide araştırmacılar için büyük kolaylıklar sağlayan ve oldukça geniş bir bilim dalıdır. (. . . ) Evrim, genomik, genetik, matematik biyoinformatiğin dallarından değildir.
SORULAR � � � Biyomoleküllerle ilgili bilgiyi analiz etmek için bilişim tekniklerinin uygulanmasına. . . denir. . . , biyoinformatik , biyomoleküler , moleküler evrim ve genetik alanında her gün yüzlerce çalışmanın sonucu yayınlanmaktadır. . . , Biyoinformatik araçlar , özellikle filogenetik analizler ve popülasyon çalışmalarında kullanılmaktadır.
SORULAR � � . . . Bu çalışma alanı proteinlerin üç boyutlu yapılarının , biyoinformatikte kullanılan araçlar üzerinden , modelleme çalışmalarıdır. Biyoinformatiğin , . . . gibi vb. ana dalları vardır.
EĞİTİM FAKÜLTESİ FEN BİLGİSİ ÖĞRETMENLİĞİ ESENGÜL ÇOLAK SINIF : 4 / B NO : 141104744
- Slides: 19