Biostatistika uvodna razmatranja poslijediplomski studij Medicinska biokemija Farmaceutskobiokemijski

Biostatistika: uvodna razmatranja poslijediplomski studij “Medicinska biokemija” Farmaceutsko-biokemijski fakultet u Zagrebu Prof. dr. sc. Mladen Petrovečki Katedra za medicinsku informatiku Medicinski fakultet, Rijeka Zavod za laboratorijsku dijagnostiku KB Dubrava, Zagreb travanj 2006.

Ovo predavanje. . . u MS Power. Point u 500 KB u na adresi: mi. medri. hr (E-prilozi predavanja)

Program u Med. Calc computer program for statistic in biomedicine u Copyright, 1993 -1996 Medcalc Software Mariakerke, Belgija

Program – postavljanje: u otvoriti mapu “C: MCWin” u preslikavanje svih podataka sa diskete u zadanu mapu u otvoriti mapu u pokrenuti program “Install” u po završetku pokrenuti program “Med. Calc”

Program www. medcalc. be

Nastava u u dan datum vrijeme utorak srijeda četvrtak petak 18. 04. 19. 04. 20. 04. 21. 04. 1500 – 1730 h 1500 – 1830 h ukupno šk. sati 3 P– 4 P 30 15

Raspored Dan Tema u 1. dan uvod, znanstveno istraživanje, Med. Calc, unos podataka u 2. dan prikaz podataka, odnos dvaju obilježja u 3. dan usporedbe prosjeka u 4. dan ROC, multivarijatni postupci

Literatura u B. Petz. Osnovne statističke metode za nematičare. III. dopunjeno izd. Naklada Slap, Jastrebarsko, 1997. (novo izd. ) u B. Dawson-Saunders, R. G. Trapp. Basic & Clinical Biostatistics. Prentice-Hall Int. Inc. , London, 2000. u A. Petrie, C. Sabin. Medical statistics at a glance. Blackwell Science, Oxford, 2000. u D. Ivanković i sur. Osnovne statističke analize za medicinare. Udžbenici i priručnici Medicinskog fakulteta u Sveučilišta u Zagrebu, 1988. u M. Marušić i sur. Uvod u znanstveni rad u medicini. III. obnov. izd. Medicinska naklada, 2004.

Literatura

Ispit u kritička raščlamba statističkih postupaka objavljenog znanstvenog rada – pismeno – poslati 10 dana prije usmene obrane u časopis – citiran u Current Contents u rad: – cjelokupno istraživanje (ne osvrt na drugi objavljeni rad!) – najmanje dva priloga (tablica, slika) – jasan opis statističkih postupaka

Nastavak. . .

? u nesreća… u svaki sreća… puta… desetak puta… u nemoguće… nevjerojatno…

Pregled u metodologija u postupci znanstvenog istraživanja u neznanstveni i znanstveni postupci

Metodologija znanstvenog istraživanja u znanost kao način razmišljanja u znanstveno djelovanje – privremeno tumačenje – hipoteza – zaključak u provjerljivost u postavke TVRDNJA OBRAZLOŽENJE PROVJERA činjenice znanje

Neznanstveni postupci istraživanja u ustrajnost (navika, stav, vjerovanje, inercija) u autoritet u intuicija (očiglednost)

Pokus u pokus – istraživanje / dio istraživanja u planiranje pokusa u maskiranje u randomizacija

Randomizacija u RND (Med. Calc) u funkcija slučajnog broja (uniformna raspodjela) u “RND(x) returns a computer-generated random number: – when x <= 1 then the result is a number between 0 and 1, or – when x > 1 then the result is a number between 1 and x. ” u (usp. funkcija RNDNORM)

Randomizacija u datoteka “FBF kardio” u otvoriti u pokazatelj “slucajan” u definirati tri skupine ispitanika po slučajnosti

Istraživačka logika u deterministički model sustava u probabilistički model sustava u vjerojatnost događaja – p(D) 0 p(D) 1

Uzorak i populacija SPOZNAJA O POPULACIJI populacija mjereno obilježje UZORKOVANJE uzorak PROCJENA statistička obrada podataka SPOZNAJA O UZORKU

Mjerno obilježje u Mjerne ljestvice – NOMINALNA – ORDINALNA – INTERVALNA – OMJERNA

Jednostavni i složeni podaci u visina bolesnika 175 cm u p. H krvi 7, 42 u sistolički tlak 85 mm. Hg u razina glukoze u krvi 5, 14 mmol/L u brojnost CFU-GM u koštanoj srži 65 kolonija/105 stanica s jezgrom u količina citostatika 250 mg/m 2 površine tijela

Uzorak • reprezentativan • mjerljiv • ostvariv • PROBABILISTIČKI • SLUČAJAN • SUSTAVAN • STRATIFICIRAN

Uzorak – zavisnost ZAVISNI NEZAVISNI

Hipoteza u znanstvena u statistička hipoteza

Statistička hipoteza u elementarna tvrdnja u točna (istinita) ili netočna (neistinita) u provjera hipoteze = traženje istine u istina – stvarno, objektivno stanje u probabilistički sustav: istina vjerojatnost u značajno – ono što se ostvaruje na svaki drugi način osim slučajno iskaz vjerojatnosti razina značajnosti

Dokazivanje statističke hipteze CD Kontrolna Ispitanici s Statistika skupina PTSD H p CD 3 39, 0 (15, 1 – 61, 1) 44 (32, 3 – 57, 7) 0, 59 0, 442 CD 4 3, 5 (2, 1 – 5, 8) 10, 3 (6, 5 – 17, 4) 15, 9 0, 018 Razlikuje li se razina CD 4 u ispitanika u istraživanju? Škarpa I et al. Croat Med J 2001; 42: 551 -5.

1. postavljanje hipoteze u nulta – H 0 -hipoteza: razlike nema! – “Nema razlike u razinama CD 4. ” u suprotna – H 1 -hipoteza: razlike ima! – “Razine CD se razlikuju. ” u samo jedna može biti istinita u samo jedna može biti prihvaćena, dok će ona druga biti odbačena

2. Odabir testa u testovi dokazivanja statističkih hipoteza u ovisnost – osobine obilježja - mjerne ljestvice – osobine uzoraka v veličina v povezanost – osobine raspodjele v parametrijski v neparametrijski – broj obilježja - uni/bi/multivarijatni testovi

(nastavak) Ljestvica Nominalna Jedan uzorak binomni test hi-kvadrat Dva uzorka Tri i više uzoraka Ovisni Neovisni Mc. Nemara Cohran Fisher hi-kvadrat/ Ordinalna Kol/Smir. homologni Intervalna Omjerna . . . Wilcoxon Friedman MW p/medijan Moses KW

3. Određivanje razine značajnosti up ua ako se p određuje prije izračunavanja u a – vjerojatnost odbacivanja H 0 kad je ona stvarno točna i istinita u tzv. a-pogrješka (pogrješka I. vrste) u što manja! u uobičajene vrijednosti, npr. p<0, 05

(nastavak) u zašto upravo to: p<0, 05? u POKUS u bacanje novčića: pismo/glava u 2 x isto uzastopce = 0, 5 u 3 x = 0, 25 u 4 x = 0, 125 u 5 x = 0, 0625 u. . .

4. Izračunavanje u matematički račun u primjer: razlikuje li se dob ispitanika između skupina po vrsti operacije (normotermija i hipotermija) u Med. Calc, “FBF Kardio. mc 1”

5. Zaključivanje u mala vrijednost “p” = mala vjerojatnost da ne prihvaćama ono što je istinito u zaključivanje: –p<a – vjerojatnost istinitosti H 0 je mala – odbacujemo (ne prihvaćamo) nultu hipotezu – prihvaćamo alternativnu, H 1 – potvrdimo je, iskažemo, uz p=. . .

(nastavak – zaključak) CD Kontrolna Ispitanici s Statistika skupina PTSD H p CD 3 39, 0 (15, 1 – 61, 1) 44 (32, 3 – 57, 7) 0, 59 0, 442 CD 4 3, 5 (2, 1 – 5, 8) 10, 3 (6, 5 – 17, 4) 15, 9 0, 018 Razlikuje li se razina CD 4 u ispitanika u istraživanju? Škarpa I et al. Croat Med J 2001; 42: 551 -5.

Pogrješke testiranja hipoteze PRAVO STANJE ZAKLJUČENO RAZLIKA POSTOJI (H 1) RAZLIKA NE POSTOJI (H 0) ISPRAVAN ZAKLJUČAK a pogrješka (I. vrste) (H 0 odbac. ) RAZLIKA POSTOJI b pogrješka (II. vrste) ISPRAVAN ZAKLJUČAK (H 0 prihvat. ) RAZLIKE NEMA

Uzorak (nastavak) – veličina u uzorkovanje - Med. Calc (engl. sampling) u primjer: sampling simple mean. . .

WWW… u http: //faculty. vassar. edu/lowry/Vassar. Stats. ht ml u http: //www. statserv. com/ u http: //www. randomizer. org/ u http: //www. bettycjung. net/Statsites. htm u http: //shazam. econ. ubc. ca/flip/ u http: //statpages. org/ u http: //www. stat. psu. edu/~resources/index. htm

Priopćavanje E-pošta: mp@kbd. hr Klinička bolnica Dubrava Zavod za laboratorijsku dijagnostiku Avenija G. Šuška 6, 10000 Zagreb (01 290 3379) Katedra za medicinsku informatiku Medicinski fakultet Sveučilišta u Rijeci Ulica braće Branchetta 20, 51000 Rijeka (051 651 255)