BIOLOGI MOLEKULER DOGMA SENTRAL GENETIK Anwari Adi Nugroho

BIOLOGI MOLEKULER DOGMA SENTRAL GENETIK Anwari Adi Nugroho, S. Pd. , M. Pd.

BIOLOGI MOLEKULER Anwari Adi Nugroho, S. Pd. , M. Pd.

BIOLOGI MOLEKULER REPLIKASI DNA Anwari Adi Nugroho, S. Pd. , M. Pd.

BIOLOGI MOLEKULER Anwari Adi Nugroho, S. Pd. , M. Pd.

BIOLOGI MOLEKULER 1. Proses perbanyakan DNA 2. DNA ------ 2 DNA 3. Replikasi melibatkan suatu mekanisme yang integrated dari beberapa enzim dan protein 4. DNA polimerase I, II dan III dan RNA polimerase Anwari Adi Nugroho, S. Pd. , M. Pd.

BIOLOGI MOLEKULER ATURAN DASAR REPLIKASI 1. Replikasi adalah: suatu proses yang semiconcervative, satu arah 2. Replikasi mempunyai arah: Bermula pada suatu titik pada kromosom, berlangsung ke kedua arah, two growing point or “fork’. Pergerakan kedua fork menjauh menghasilkan suatu bentuk gelembung 3. Replikasi bermula pada suatu titik pada kromosom. Mungkin ada beberapa titik pemula, dan beberapa fork, replikasi secara keseluruhan berlangsung lebih cepat Anwari Adi Nugroho, S. Pd. , M. Pd.

BIOLOGI MOLEKULER 4. Replikasi dari kedua strand berlangsung dengan pemasukan NTP dengan arah 5’-3’ 5. Pada single strand tidak berlangsung secara simultan, dengan satu DNA polimerase. Replikasi secara “short discontinous pulse Animal cell = 1000 nucleotida Prokaryot cell = 1000 – 2000 nucleotida 6. Replikasi pada tingkat “short fragmen” dimulai dengan terbentuknya “short Segmen” dari RNA sebagai primer untuk DNA Anwari Adi Nugroho, S. Pd. , M. Pd.

BIOLOGI MOLEKULER Enzim yang terlibat dalam proses Replikasi No Jenis enzim/protein Fungsi 1 DNA Girase Mengendurkan tegangan pada waktu penguraian heliks kembar 2 Helikase Membuka heliks kembar DNA dengan memutuskan ikatan hidrogen 3 HDP ( Helik Destabilizizing Protein ) Mencegah utasan yang sudah terpisah bergabung lagi 4 DNA Polimerase Katalisis sintesis rantai DNA 5 RNA Primase Meletakkan molekul RNA primer, sebagai pemula sintesis DNA 6 Eksonuklease 5’ - - 3’ Memotong nukleotide dari arah ujung 5’ 7 Eksonuklease 3’ - - 5’ Memotong nukleotide dari araj ujung 3’ 8 DNA ligase Menyambung dua rantai DNA Anwari Adi Nugroho, S. Pd. , M. Pd.

BIOLOGI MOLEKULER 3’ 5’ 1 Helicase separates the double-stranded molecule Synthesis of the leading strand proceeds continuously: 5’ to 3’ 3’ DNA Polymerase III Synthesis of the lagging strand is Discontinuous: also 5’ to 3’ RNA primer Okazaki fragments 2 Primase Synthesizes an RNA primer fragment 3 DNA polymerase III adds nucleotides onto the 3' end of the fragment 4 DNA polymerase I replaces the RNA primer with deoxynucleotides 5 DNA ligase seals the gaps between adjacent fragments 3’ 5’ Anwari Adi Nugroho, S. Pd. , M. Pd.

BIOLOGI MOLEKULER Anwari Adi Nugroho, S. Pd. , M. Pd.

BIOLOGI MOLEKULER Replikasi DNA. Mula-mula, heliks ganda DNA (merah) dibuka menjadi dua untai tunggal oleh enzim helikase (9) dengan bantuan topoisomerase (11) yang mengurangi tegangan untai DNA. Untaian DNA tunggal dilekati oleh protein-protein pengikat untaian tunggal (10) untuk mencegahnya membentuk heliks ganda kembali. Primase (6) membentuk oligonukleotida RNA yang disebut primer (5) dan molekul DNA polimerase (3 & 8) melekat pada seuntai tunggal DNA dan bergerak sepanjang untai tersebut memperpanjang primer, membentuk untaian tunggal DNA baru yang disebut leading strand (2) dan lagging strand (1). DNA polimerase yang membentuk lagging strand harus mensintesis segmen-segmen polinukleotida diskontinu (disebut fragmen Okazaki (7)). Enzim DNA ligase (4) kemudian menyambungkan potongan-potongan lagging strand tersebut. Anwari Adi Nugroho, S. Pd. , M. Pd.