BIOLOGI DASAR MODUL 1 STRUKTUR DNA STRUKTUR DNA
BIOLOGI DASAR MODUL 1 STRUKTUR DNA
STRUKTUR DNA • DNA terbentuk dari NUKLEOTIDA • Double strand, komplementer, arah pembacaan yg berlawanan • Satu NUKLEOTIDA terdiri dari fosfat, deoksiribose dan basa DNA. • Basa DNA : Adenin (A) Timin (T) Guanin (G) Cytosin (C) • G = C dan A = T gula
DGTP Basa DNA 5’ 1’ 4’ Fosfat 3’ 2’ 2’-deoksiribose
DATP
DCTP 5’ 3’
Gambar DNA dilihat dengan mikroskop elektron
GC : 3 ikatan hidrogen AT : 2 ikatan hidrogen
Urutan 5’-3’ CAG
Pembacaan 5’ 3’ Double heliks putar kanan
Double helix DNA Putar kanan
Perubahan DNA dari double strand menjadi single strand Denaturasi Renaturasi
Pengaruh temperatur pada single/ double strand DNA
Dogma Central Crick & Watson Transkripsi Replikasi Reverse Transkripsi Translasi
REPLIKASI DNA • Teori Konservative • Teori Semikonservative • Teori Dispersive SYNTHESIS DNA • Replikasi semikonservative (untuk perbanyakan DNA) • Unscheduled DNA Synthesis (untuk perbaikan DNA)
REPLIKASI KONSERVATIF Induk menghasilkan 1 anak, induk dan anak BERBEDA
REPLIKASI SEMIKONSERVATIF Induk pisah menjadi 2, masing 2 pisahan membentuk anak induk dan anak SAMA
REPLIKASI DISPERSIF Induk menghasilkan anak yang berselang seling dengan induk, induk dan anak SAMA
SINTESIS DNA Enzim yang berperan membuka double heliks DNA 1. Helicase : membuka double heliks 2. SSBP (Single Strand Binding Protein) : menjaga single strand agar tidak ter-anneal lagi. SSBP Helicase
TERBENTUKNYA FRAGMEN OKASAKI Arah sintesis berlawanan dengan arah membuka DNA 3’ 5’ Fragmen OKASAKI
Penyambungan Fragment OKASAKI Dihubungkan dengan enzim ligase
SYNTHESIS DNA • Replikasi semikonservative (untuk perbanyakan DNA) • Unscheduled DNA Synthesis (untuk perbaikan DNA) -Endonuklease : memotong bagian DNA yg rusak -Eksonuklease : menghancurkan bagian DNA yg rusak (+ 10 nukleotida) -Polimerase : mensintesis DNA baru berdasarkan cetakan (template) strand yg lain. -Ligase : menyambung ujung DNA yang telah disintesis
BIOLOGI DASAR MODUL 2 BIOSINTESIS PROTEIN
Biosintesis Protein Transkripsi DNA ke RNA - RNA polimerase mengurai untai DNA secara transien (sekejap) - Hanya satu strand DNA yang ditranskrip - m. RNA disintesis dari DNA template (strand anti sense). - Transkripsi RNA adalah proses conservative sedang replikasi DNA adalah proses semiconservative
- Adenin (A) pada template akan membentuk ikatan dengan urasil (U) - Cytsosin ( C )akan membentuk ikatan dengan Guanin ( G ) dan sebaliknya -Urutan pembentukannya dari 5’ --> 3’ pada leading strand - Transkripsi dimulai dari pembentukan kompleks yang stabil antara RNA polimerase dan kontrol sekuen (promoter) -Sintesis m. RNA dikatalisa oleh RNA polimerase -Sintesis m. RNA dihentikan oleh Transcription terminators. - Ada 2 transcription terminator yaitu rho-dependent dan rho independent terminator. - Pada saat m. RNA akan melepaskan diri dari DNA rho bergerak sepanjang RNA dari 5’ menuju 3’ terminal
BIOLOGI DASAR MODUL 3 MUTASI
MUTASI 1. Mutasi DNA a. Point Mutation - Transisi (bs. purin diganti bs. Purin A G) (bs. pirimidin diganti pirimidin T C) - Transversi (bs. Purin diganti bs. pirimidin dan sebaliknya A T/C, C G/A)
b. Insersi dan delesi Insersi : penambahan pasangan basa DNA Delesi : penghilangan pasangan basa DNA c. Inversi Penghilangan bagian dari heliks DNA diikuti dengan insersi pada posisi yang sama tetapi urutannya terbalik (C: G menjadi G: C) ( A: T menjadi T: A)
2. Mutasi pada tingkat GEN a. Silent Mutation Merubah kodon tetapi tidak merubah asam amino (genotip berbeda, fenotipnya sama) TTA --> leu berubah menjadi TTG --> leu b. Missense mutation Merubah kode asam amino GGA --> gly berubah menjadi AGA --> arg
c. Nonsense mutation Merubah kodon menjadi kodon terminasi maka sintesis asam amino terhenti TTA --> leu berubah menjadi TGA--> stop d. Frameshift mutation Insersi atau delesi sehingga perubahan pembacaan total insersi G GGA GCT CTA TTA --> GGG AGC TCT ATT A gly ala leu gly ser ileu
3. MUTASI PADA TINGKAT KROMOSOM a. Delesi : Hilangnya suatu fragmen DNA dalam satu kromosom b. Insersi : Bertambahnya suatu fragmen DNA dalam suatu kromosom c. Duplikasi : fragmen DNA/gen yang diperbanyak menjadi 2 atau lebih baik dalam satu kromosom atau pada kromosom lain. D. Translokasi : berpindahnya suatu fragmen DNA dari suatu tempat pada kromosom ke tempat lain. E. Inversi : sepasang fragmen DNA atau gen yang bertukar tempat dalam kromosom.
4. Mutasi pada tingkat organisme a. Lethal mutation Mutasi yang menyebabkan kematian sel atau organisme b. Auxotrophic mutant Mutan yang kehilangan kemampuan mensintesis protein tertentu. Contoh E. Coli yang tidak dapat mensintesis triptopan. Kebalikannya = Prototroph
C. Conditional-lethal mutant mutan yang dapat hidup pada kondisi tertentu saja misalnya suhu kurang dari 30 o. C. Lethal, auxotroph dan conditional-lethal mutant dapat merupakan produk gen termutasi yang tidak terinaktifasi total, mungkin penurunan fungsi atau justru penaikan fungsi Mutan dapat kembali menjadi wild-type melalui second site reversion.
BIOLOGI DASAR MODUL 4 PEMBELAHAN SEL
MITOSIS
Sekian
- Slides: 70