BIOLOGA MOLECULAR Alejandrina Vega 192933 Tema 4 2

BIOLOGÍA MOLECULAR Alejandrina Vega 192933

Tema 4. 2. 1 Función de las proteinas que participan en la transcripción

Transcripción en procariotas RNA polimerasa En E. coli tiene un peso aproximado de 465 k. Da. Es una holoenzima formada por varias subunidades proteicas: Dos subunidades a encargadas del ensamblaje del núcleo enzimático, intervienen en el reconocimiento del promotor y en la interacción de la enzima con factores auxiliares. Las subunidades b y b´ que constituyen el centro catalítico. Subuniddad s cuya función recae en el reconocimiento del promotor.

RNA polimerasa

Transcripción en procariotas Rho (r): proteina que se una al RNA en lugares específicos y migra en dirección 5' 3' hasta encontrar el complejo de transcripción detenido en el lugar de la terminación. Posee actividad RNA-DNA helicasa dependiente de ATP, promueve la traslocación de la proteina a lo largo del RNA.

Función del factor Rho

Transcripción en procariotas Existen otras subunidades que operan junto con la RNA polimerasa. Los loci “nus” (N-utilization-substance) que codifica proteínas que forman parte del aparato de transcripción, pero que no se aislan con la RNA polimerasa en su forma usual. Las proteínas Nus A, Nus B y Nus G están relacionadas con la transcripción. Nus E es una proteína ribosómica cuya función no está clara en la terminación.

Factores NUS Nus A es una factor general de transcripción que aumenta la eficiencia de la terminación, probablemente favoreciendo la tendencia de la RNA polimerasa al detenerse en los terminadores quizá estabilizando la estructura de horquilla del RNA. Nus G puede estar relacionada con el ensamblaje general de todos los factores en un complejo con la RNA polimerasa. Nus A se une al núcleo de la RNA polimerasa pero no a la holoenzima.

Transcripción en eucariotas

RNA polimerasa Tres tipos de RNA polimerasas que transcriben grupos de genes diferentes en lugares específicos del núcleo. Estas enzimas son proteínas grandes, que aparecen como agregados de 500 k. Da o más y tienen de forma típica entre 8 y 14 subunidades. Las RNA polimerasas de mitocondrias y cloroplastos son menores y se asemejan más a la RNA polimerasa bacteriana dada la menor complejidad de los genomas de estos organelos.

RNA polimerasa I Se localiza en el nucleolo, transcribe los genes que codifian para los RNA ribosomales. Esta enzima sintetiza un unico transcrito, el RNAr 45 s, precursor del RNAr 18 s, 28, y 5. 8 s. Requiere de 2 factores auxiliares: UBF 1 es un polipéptido que se une a una región rica en G-C tanto en el núcleo del promotor como en UCE. SL 1 está formada por 4 proteínas entre las que se encuentra la TBP (del inglés TATA binding protein), su nombre se debe a que fue descrita en los promotores de tipo II donde esta proteína se une a una secuencia consenso denominada TATA.

RNA polimerasa II Se encuentra en el núcleo, específicamente en el nucleoplasma, sintetizandomoléculas de RNAhn (RNA heterogéneo nuclear), el precursor del RNAm, también sintetiza algunos RNAsn. Tiene 12 subunidades. La subunidad más grande RBP 1, muestra un alto grado de homología con la subunidad b´ de la RNA polimerasa bacteriana. Otra subunidad RPB 2 es estructuralmente similar a la subunidad b bacteriana y otras dos RBP 3 y RBP 11 muestran alguna homologia estructural con las 2 subunidades a bacterianas.

Factores de transcripcion de RNA polimerasa II Factor Numero de subunidades Peso molecular (k. Da) Función TFIID TBPs TAFs 1 TFIIA 3 12, 19, 35 Estabilización de la unión TBP; estabilización de interacciones TAF-DNA; funciones antirrepresoras TFIIB 1 35 Reclutamiento de RNA pol II-TFTIIF, selección del lugar de comienzo de la RNA pol II TFIIF 2 30, 74 Direccionamiento de la pol II al promotor, desestabilización de las interacciones inespecíficas RNA pol II-DNA RNA pol II 12 10 -220 Funciones catalíticas en la síntesis de RNA; reclutamiento de TFIIE 2 34, 57 Reclutamiento de TFIIH, modulación de las actividades helicasa, ATPasa y quinasa de TFIIH, potenciación directa de la fusión del promotor TFIIH 9 35, 89 Fusion del promotor utilizando la actividad helicasa; depuración del promotor por la actividad CTD quinasa 12 38 15 -250 Reconocimiento del centro del promotor TATA; reclutamiento de TFIIB Reconocimiento del centro del promotor (elementos no TATA) ; funciones reguladoras positivas y negativas

RNA polimerasa III Se encuentra en el nucleoplasma del núcleo y es la encargada de la síntesis de los RNA de transferencia (RNAt), el RNAr 5 S y otros pequeños RNA (RNAsn, del inglés smoll nuclear). Utiliza factores transcripcionales: TFIIA: proteína con motivos de dedos de cinc. TFIIB: complejo formado por tres proteína, una TBP y dos proteínas TFIIC: es un gran complejo proteínico de mas de 500 k. Da. más.