Biokemi MNXA 1012 HansErik kerlund Proteiner Aminosyror Enklaste

Biokemi MNXA 10/12 Hans-Erik Åkerlund Proteiner

Aminosyror Enklaste Aminogrupp -NH 3+ Karboxylsyragrupp -COOVäte Variabel sidogrupp 20 olika

Primärstruktur Vilka aminosyror och vilken ordning Peptidbindning Aminosyror Dipeptid Kovalent bindning Specialfall av Amidbindning Riktning Amminoterminal / N-terminal Karboxyterminal / C-terminal Stommen N - C

a-helix (Sekundärstruktur)er Vätebindningar Vätebindning

b-veckstruktur (Sekundärstruktur) Utsträckt struktur Vätebindnigar mellan kedjor Antiparalella eller paralella R-grupper upp och ner

Tertiärstruktur Trediminsionell veckning Opolära grupper inne Polära grupper på ytan FA binding protein Lysozym Ferritin

Den hydrofoba effekten Störande molekyler opolära Vattenstruktur

Cysteinbryggor = SS Bryggor = Disulfidbryggor Stabiliserar tertiärstrukturen

Kvartärstruktur Antal och arrangeman av subenheter Ex. Hemoglobin från människa fyra subenheter

Enzymer, Katalys och Kinetik Hastighet Påskyndar reaktioner utan att själv förbrukas. Kan ingå i delreaktioner men återbildas alltid Påverkar inte jämvikten, K lika som utan enzym. Påskyndar att jämvikten ställer in sig Specificitet Reglerbarhet

Varför påskyndas reaktioner? Aktiveringsenergi Enzymer -gör att det krävs mindre aktiveringsenergi. -påverkar inte energiskillnaden mellan substrat och produkt

Enzymkatalyserad reaktion Upvisar mättnad Karaktäristiskt för enzymkatalyserad reaktion.

Michaelis-Menten Avsätt v 0 som funktion av [S] v = Vmax*[S]/(KM+[S])

Ex. Karboanhydras Zn 2+ prostetisk grupp Metalljonkatalys Aktivering av vatten p. Ka=7 (jfrt med 15. 7 för fritt vatten) ca 7 miljoner ggr snabbare än utan katalys

Nukleinsyror: DNA och RNA

Nukleotider som byggstenar Fosfat – Socker -Kvävebas

Sockret R i RNA D i DNA Syre saknas Deoxy

Kvävebaser: Adenin Guanin Cytosin Uracil (i RNA)/Thymin (i DNA)

DNA struktur. 1) polynukleotid, kvävebaser A, G, C, T 2) har polaritet: 5´ o 3´ ändar 3) basparning mellan två antiparella strängar 4) H-bindingar, 2 st mellan A o T, 3 st mellan G o C 3´ 5´ A G C T C G A G 3´ 5´ 5´ 3´ 3´ 5´

DNA dubbelhelix 5´ 3´ 10 nukleotider Stor fåra (major groove) eller Liten fåra (minor groove) Baspar (bp) Mörk färg: fosfodiester o socker (huvudkedja) Ljus färg: basparade kvävebaser 3´ 5´

Cellulära processer Replikation DNA Transkription RNA Translation PROTEIN Process Huvudsaklig funktionell enhet/ enzym Replikation DNA polymeras. (DNA templat, mall) Transkription RNA polymeras. (DNA templat eller ) Translation Ribosom, består av r. RNA, protein. (m. RNA templat)