ATCACLF LYON 2014 La Cytogntique de lautre ct

ATC/ACLF LYON 2014 La Cytogénétique de l’autre côté de la méditerranée Expérience du Département de Génétique Médicale de l’INH (1992 -2014) Présenté par : A. NATIQ

Fondé en 1932 DGM en 1991

Département de Génétique Médicale Institut National d’Hygiène Professeur Abdelaziz SEFIANI Responsable qualité Secrétariat Génétique Clinique Conseil génétique Dysmorphologie Oncogénétique Laboratoire Cytogénétique Moléculaire Cytogénétique Constitutionnelle Formation et Recherche Génétique Moléculaire Projets de recherche Bases de données Anténatale Postnatale Caryotype constitutionnel Diagnostic moléculaire Caryotype hématologique Epidémiologie moléculaire Enseignement Stages Coopérations

Techniques de cytogénétique maitrisées • Caryotype standard et en haute résolution • Techniques de marquage : RHG GTG Bandes C, NORS…

Bilan cytogénétique constitutionnelle 8234 caryotypes réalisés

Bilan : 1992 -2010

27%

Bilan 2010 -2014 2662 caryotypes réalisés > 30%

ü Augmentation du taux de détection des aberrations chromosomiques de 31% VS 27% Indications de caryotypes bien posés üMise en place de la FISH

HISTOIRE DE LA FISH AU DGM (1) Technique à la provençale q 1ère FISH réalisée au DGM en 2002 q Appareil à PCR = Hybrite q Tampon de dénaturation et hybridation maison q Photomicroscope , film couleur Ektachrome 400 ASA Recherche de la del 22 q 11? ? ?

HISTOIRE DE LA FISH AU DGM (2) ü 2007 : acquisition d’un Cytovision avec un module FISH d’acquisition et d’analyse d’image ü 2010 : technique de routine

BILAN 2010 -2014 30 postnatal 34 DPN 130 194 FISH réalisées Oncohématologique

La pê che e st bonn e !!!

A- FISH en Diagnostic Constitutionnel Postnatal Pour quelles indications? ü Recher un syndrome microdélétionnel connu après orientation clinique ü Caractériser une anomalie chromosomique dépistée sur le caryotype: ® définir le nombre de chromosomes impliqués dans un réarrangement ® préciser l’origine d’un marqueur chromosomique surnuméraire ü Recher une mosaïque ® syndrome de Turner ® Trisomie 21

SYNDROMES MICRODELETIONELS Williams Beuren Syndrome (del 7 q 11. 23) 26 Diagnostic positif / 28 suspicions (90%) 46, XY. ish del(7)(q 11. 23)(ELN-)

SYNDROMES MICRODELETIONELS Syndrome del 22 q 11. 2 • 7 cas diagnostiqués /25 suspicions 46, XY. del(22)(q 11. 2)(TUPLE 1 -)

MICRODELETION SYNDROMES Prader Willi Syndrome ( Paternal del 15 q 11 -q 13) • 4 cas diagnostiqués / 10 suspicions 46, XX. ish del(15)(q 11. 2)(SNRPN-)

SYNDROMES MICRODELETIONELS Angelman syndrome (Maternal del 15 q 11 -q 13 • 1 cas diagnostiqué / 5 suspicions • Microdeletion = 70% 46, XX. ish del(15)(q 11. 2)(UBE 3 A-)

Depuis janvier 2014 mise en place de la Methyl PCR pour le diagnostic du syndrome de PW et AS.

SYNDROMES MICRODELETIONELS Miller Dieker Syndrome (17 p 13. 3) 17 p 13. 3 17 qter 46, XY. ish del 17 p 13. 3

Identification de l’origine d’un marqueur surnuméraire SMC (1) CEP (D 15 Z 1) D 15 S 10/PML 47, XY, +mar. ish idic(15)(D 15 Z 1 ++, D 15 S 10 ++, PML-) de novo

Identification de l’origine d’un marqueur surnuméraire SMC (2) Crises tonico-cloniques, Déficience intellectuelle Retard de langage, Ataxie, rires immotivés. 47, XX, +mar Syndrome d’Angelman par UPD + SMC 15

Identification de l’origine d’un marqueur surnumeraire SMC (3) q Identification d’un SMC der 22 (trisomie partielle du chromosome 22 ) Tuple 1 22 q 13 47, XY, +mar. ish der (22) (TUPLE 1+, BCR-) Locus BCR

Syndrome de l’Homme 46, XX SRY+ CEP X SRY 46, XX, Xp 22. 3(SRY+)

Caractérisation d’une translocation équilibrée t(5; 8)pat q Translocation t(5; 8) équilibrée & réciproque WCP 5 Sonde périmée en 2002 Que dit l’accréditation ? ?

Caractérisation par FISH d’une délétion terminale 10 q chez une patiente avec retard de développement q Age : 3 ans q retard psychomoteur q Dysmorphie faciale: hypertélorisme, épicanthus, strabisme convergent gauche, philtrum long.

46, XX, del(10)(q 25 q 26)?

Tel 10 q Tel 10 p 46, XX, del 10 q 26. ish(10 qterx 1)

B- FISH en diagnostic prénatal Pour quelles indications? Recherche de la trisomie 21 sur amniocytes o Age maternel o Signes d’appel échographiques, biochimiques ou génétiques cohorte de 34 femmes enceintes

Rassurer 29 couples § amniocytes avec deux spots rouges du chromosome 21 Résultats rapides: en 24 heures.

Détecter 4 cas de trisomie 21 Cas N° 1: Cas N° 27: Age: 42 ans Age: 34 Clarté nucale: 5, 5 mm Clarté nucale: non faite Risque estimé par triple test: 1/10 Risque estimé par triple test: 1/200 Cas N° 13: cas N° 31: Age: 38 ans Age: 41 Mère d’enfant trisomique 21 Clarté nucale: 7, 2 mm t(14; 21)mat ( risque de 1/5) § amniocytes avec trois spots rouges spécifiques du chromosome 21

C- CYTOGENETIQUE HEMATO-ONCOLOGIQUE Pour quelles indications ? ® Recherche du gène de fusion bcr/abl: Index mitotique: très faible Qualité des métaphases: médiocre ® suivi de la Maladie Résiduelle (bcr/abl): évaluation du traitement ®Recherche de chimérisme dans les allogreffes

Bilan en Oncohématologie 34 FISH réalisées o 24 FISH pour contrôle : évaluation du traitement o 9 FISH pour Diagnostic: recherche de gène de fusion bcr/abl o 1 FISH pour recherche de chimérisme (allogreffe) nuc ish(BCRx 2)(ABLx 2)[100] nuc ish(BCRx 2)(ABL 1 con. BCRx 1)[100] nuc ish(BCRx 3)(ABL 1 con. BCRx 2)[100]

Recherche de chimérisme - Allogreffe de la moelle osseuse - Sonde CEPX/CEPY 99% de noyaux XX 1% de noyaux XY nuc ish(DXZ 1, DYZ 3)[2]//(DXZ 1 X 2)[198]

RESTE T-IL ENCORE DES CELLULES À HYBRIDER? ? chromosomes Noyau interphasique Cellule buccale Amniocyte D 16 Blastes spermatozoides blastocystes blastomères

Non disponibilité d’une banque de sondes S E T I M I L

Thomas LIEHR Ph. D

Précision de l’origine d’un marqueur chromosomique Identification d’un marqueur chromosomique der 22 WCP 21 LSI 21 46, XX, 22 ph++mat

Chromosome analysis on blood cell suspension (slides) sent in April 2012. Indication : Further clarification of a karyotype 46, XX, der(22) Molecular-cytogenetic report: 46, XX, 22 ph++ mat

Précision de l’origine d’un marqueur chromosomique Fille de 10 ans, retard mental modéré, retard de langage , pas de dysmorphie faciale. caryotype: 47, XX, +mar[12]/46, XX[10]

WAGR SYNDROME ? ?

Délétion interstitielle 20 p Age : 6 ans Non consanguin Souffrance néonatale Retard des acquisitions psychomotrices Fente palatine Légère dysmorphie faciale 46, XY, del(20)(p 12) Délétion 20(p 11 p 12) ? ?

Fruits de collaboration

ns e i l e d s ec n v a a 22 forts très ’ATC ! l 19 4 1 0 2 92 -

MERCI