Aminosavak peptidek fehrjk Aminosavak Az emberi szervezet fehrji
Aminosavak, peptidek, fehérjék
Aminosavak • Az emberi szervezet fehérjéi gyakorlatilag 20 L, -aminosavból képződnek. • A variációs lehetőségek és a változatos molekulatömegek bőven elégségesek a természetben előforduló 1012 fehérjeféleség megvalósulásához.
Szerkezetük • aminocsoport (a prolin kivételével) • karboxilcsoport • R- oldalláncban különböznek egymástól (→eltérő a méretük, töltésük, fizikokémiai tulajdonságaik)
Az aminosavak csoportosítása (+) (-) (+) bázikus savas töltés-nélküli poláros apoláros hidrofob R (+) (-)
Néhány aminosav térszerkezete Alanin izoleucin aszpartát fenilalanin szerin glutamin lizin
Az aminosavak elektrokémiai tulajdonságai • Neutrális vizes oldatban aminoés karboxilcsoportok ionizált állapotban vannak (ikerion). (a –COOH csoportok disszociációja visszaszorul, az –NH 2 csoport protont vesz fel) (a –COOH csoportok disszociációja teljes)
Az aminosavak optikai sajátsága • A glicin kivételével aszimmetriás C-atomot tartalmaznak, optikailag aktív molekulák. • A fehérjéket L-konfigurációjú aminosavak alkotják. (A szubsztituensek az óramutató járásával ellentétes irányban követik egymást)
Az aminosavak fényelése • Az aromás gyűrűt tartalmazó aminosavak (fenil-alanin, tirozin, triptofán) ultraibolya tartományban fényelést mutatnak. • A Lambert-Beer törvény szerint a fényelés mértéke alkalmas a koncentráció meghatározására: E (A)= Lg I 0/I= * ℓ = * c * ℓ A
Aminosavak legfontosabb reakciói • Legfontosabb a ninhidrinreakció : → • A konjugált kettőskötésrendszer miatt ibolyáskék színű végtermék keletkezik (kivéve a prolint, mely sárgás színű). • A lizin -aminocsoportja ninhidrinnel nem reagál.
A peptidek • Az amino- és karboxilcsoport biológiai szempontból legfontosabb reakciója az, hogy vízkilépéssel peptidkötést alakítanak ki. A peptidkötés jellemzői • mezoméria (A szén és nitrogén közötti kötés az egyszeres és kétszeres kovalens kötés közötti erősségű)→ a kötés merev → szabad rotáció nem lehetséges. • Energetikailag a transz izoméria a kedvezőbb.
Biológiailag fontos, nem fehérjefelépítő aminosavak és származékaik • Hidroxi- prolin, hidroxi- lizin – kötőszövet fehérjéiben (kollagén) Posztszintetikusan jönnek létre. • -alanin –ko. A-ban (az aminocsoport a -C atomhoz kapcsolódik) • -aminovajsav (GABA) (glutaminszármazék) – neurotranszmitter • dopamin (tirozin származék) – neurotranszmitter • tiroxin (tirozin származék) – pajzsmirigy jód tartalmú hormonja • hisztamin (hisztidin származék) – az allergiás reakciók mediátora
Biológiai jelentőségű peptidek • • glutation peptidhormonok ACTH (Adrenokortikotrop hormon) parathormon (mellékpajzsmirigy), kalcitonin (pajzsmirigy) • -endorfin • inzulin
Glutation • (Tripeptid, melyben a glutaminsav aminocsoportja vesz részt a peptidkötésben) • A redoxirendszerekben fontos. -
Peptidhormonok • Az oxitocint (neve: gyors szülés) és vazopresszint a hipotalamusz termeli és a hipofízis hátulsó lebenye tárolja. • Az oxitocin simaizomösszehúzó hatású, míg a vazopresszin a vízháztartás szabályozásában játszik fontos szerepet.
• ACTH (Adrenokortikotrop hormon) A hipofízis elülső lebenye termeli és a mellékvesekéregre hat. • parathormon (mellékpajzsmirigy), kalcitonin (pajzsmirigy) • A hipofízis által termelt lipotropin származéka a endorfin, amely fájdalomcsillapító hatású. Az enkefalinokkal együtt a morfinhoz hasonló a hatásuk. • Az inzulin a szénhidrátanyagcsere szabályozásában fontos hormon, melyet a hasnyálmirigy Langerhansszigetei termelnek.
A fehérjék csoportosítása Biológiai aktivitás alapján • Enzimek (pepszin, glükóz-foszfát-izomeráz) • Védőfehérjék(immunglobulinok) • Transzportfehérjék (hemoglobin, mioglobin, transzferrin (vas szállítás) szérumalbumin(zsírsavak)) • Tartalékfehérjék (ovalbumin (tojásfehérje) kazein (tejfehérje) ferritin (vas) gliadin (búza) zein (kukorica) ) • Hormonok (inzulin, ACTH) • Szerkezeti fehérjék (kollagén, elasztin, keratin) • Kontraktilis fehérjék (aktin, miozin) • Toxinok (kígyómérgek, diftériatoxin) a sejthártya lipidjeinek bontásával hemolízist idéznek elő.
A fehérjeszerkezet különböző szintjei • • A. elsődleges (primer) szerkezet B. másodlagos (szekunder) szerkezet C. harmadlagos szerkezet D. negyedleges szerkezet
Elsődleges (primer) szerkezet • • • Az elsődleges (primer) szerkezetet az aminosavak kapcsolódási sorrendje határozza meg, de következtetni lehet belőle a további szerkezeti szintekre. Az inzulin volt az első fehérje, amelynek az aminosavszekvenciája ismertté vált (Sanger) Két polipeptidláncból áll: A-lánc 21, B-lánc 30 aminosavat tartalmaz. A két láncot két diszulfid híd kapcsolja össze, és az A-láncban található még egy diszulfid híd. Inaktív előalakban termelődik (proinzulin), és a lánc közepéről egy kb. 30 tagú polipeptidrészlet kihasadásával jön létre. A proinzulinnak is van egy előfutára, a pre-proinzulin, mely egy 19 aminosavból álló szignálpeptidet tartalmaz az N-terminális végen.
• Az elsődleges szerkezet alapvető jelentőségét bizonyítja a sarlósejtes anémia, mely Afrika közép-nyugati részén fordul elő. A betegségben szenvedők vörösvértestjei sarló alakúak. A vörösvértestekben a hemoglobin kristályosodásra hajlamos, melynek következtében az oxigénszállító funkció csökken. A sarló alakú vörösvértestek aggregálódnak és trombotikus tüneteket okoznak. • A két hemoglobin két -lánca mindössze egyetlen aminosavban különbözik. • A normális hemoglobinban (HLA) levő glutaminsav (savas aminosav) helyett valin (neutrális aminosav) található, aminek következtében a Hb. S oldékonysága csökken.
• Az azonos funkciót betöltő fehérjékben levő aminosav-sorrendből a rokonságra is lehet következtetni. (Pl. citokróm-c törzsfa) • Megállapították, hogy az aminosavcserék száma és a fajok fejlődésében mutatkozó fejlődéstörténeti, időbeli távolság között egyenes arányosság van.
A fehérjék másodlagos szerkezete (szekunder struktúra) • Röntgendiffrakciós vizsgálatok azt mutatják, hogy a fehérjékben periodikusan rendezett szerkezetek találhatók. Ennek két fajtája az hélix és a -redőzött lemez. • Egy fehérjében nemcsak -hélix vagy -redő fordulhat elő, hanem ezek más szabályos ( turn(görbület)) vagy szabálytalan struktúrákkal (random coil) keveredhetnek.
Az -hélix • Az -hélix úgy alakul ki, hogy a peptidsíkok a N-C -C=0 -kötések, mint tengelyek körül olyan szöggel fordulnak el, hogy egy hidrogénkötések által stabilizált helikális alakzat jön létre. A hidrogénkötések két, egymástól 4 peptidkötés-távolságra lévő amid N-atomja és a karbonil oxigén atomja között alakulnak ki. • A hidrogénhidak a hélix hossztengelyével majdnem párhuzamosak. Egy csavarmenet magassága 0, 54 nm, mely 3, 6 aminosavrészt alkot és a csavar jobb menetes (az óramutató járásával megegyező). Az R oldalláncok a hélix külső felszínén helyezkednek el. Néhány aminosav (pl. prolin) nem hélixképző.
-redőzött lemez • -redőzött lemezben ( -pleated sheet) az egymást követő peptidsíkok kinyújtott, ún. cikkcakk szerkezetet alakítanak ki. • A peptidkötések úgy kerülnek közel egymáshoz, hogy két polipeptidlánc egymás mellett helyezkedik el, vagy egy polipeptidlánc különböző szakaszai kerülnek egymás közelségébe. /paralel- antiparalel/ • A hidrogénhidak a hossztengelyre merőlegesen helyezkednek el. A glutaminsav megtöri a -szerkezetet. Animáció ( -redő)
A fehérjék harmadlagos szerkezete • A szekunder szerkezeti egységeket is tartalmazó polipeptidláncban további kölcsönhatások révén egymástól távol eső aminosavak egymáshoz közel kerülhetnek→ 3 dimenziós, globuláris formát alakíthatnak ki. • A fehérjék ezen három dimenziós, specifikus funkcióra alkalmas alakját natív konformációnak nevezzük. • A szerkezet stabilizálásában a következő nem kovalens kötések vesznek részt: 1. Hidrogénkötések 2. Elektrosztatikus kötések (ionos kötések, sókötés, sóhíd) 3. Apoláros kölcsönhatások • Ezeket kiegészíti még egy kovalens kötés (diszulfidhidak).
• A fehérjék a hidroxil-, amino-, karboxil csoportjaik révén nagy mennyiségű vizet képesek megkötni hidrogénkötések kialakításával. • Vizes fázisban a fehérjék nagy része globuláris formába tekeredik fel (folding), a poláros oldalláncok befelé orientálódnak. • A fehérjék ionos karaktere (+ és – töltések száma) p. H függő. • Amikor a + és – töltések száma megegyezik, a hidrátburok szétesik, a fehérje oldékonysága minimumra csökken. • Azt a p. H értéket, ahol ez bekövetkezik izoelektromos pontnak nevezzük (IP). • Egy láncból felépülő fehérjén belül különböző funkciókat ellátó nagyobb struktúrelemek (domének) képződhetnek.
A fehérjék negyedleges szerkezete (kvaterner struktúra) • Több globuláris fehérje kapcsolódik össze /dimer, tetramer, stb. / → alegységek („subunit”) • Ha azonos szerkezetű fehérjék kapcsolódnak össze homomernek, ha különböző szerkezetűek, heteromernek nevezzük. Animáció
• Röntgendiffrakciós vizsgálattal először a mioglobin térszerkezetét J. C. Kendrew állapította meg. Moltömege 16. 900, mely kb. 1 hemoglobin alegységnek felel meg, 152 aminosavat tartalmaz. • A hemoglobin 4 alegységből áll (tetramer): a 2 ( 1, 2) alegység 141, a 2 ( 1 , 2) alegység 146 aminosavból épül fel.
• Felépítésük: HEM (4 pirrol gyűrűből álló porfirinváz) melynek közepén Fe van. A vas négy koordinációs kötéssel a pirrol gyűrűhöz, kettővel a globin 1 -1 hisztidil- oldallánchoz kötődik. (E 7 és F 8) →Lehetővé teszi, hogy a vas két vegyértékű (Fe 2+) állapotban maradjon. • Az egyik His a proximális (F 8 helyzetű), másik a disztális His (E 7 helyzetű). Az előzővel a Fe szoros, utóbbival laza kapcsolatot alakít ki.
• Az O 2 kötődéskor a Tyr oldallánc elmozdul és a Fe behúzódik a hem síkjába
A mioglobin és hemoglobin oxigén telítési görbéje. • A mioglobin már alacsony O 2 nyomáson képes az O 2 -t felvenni → telítési görbéje hiperbola. /csak egy alegységből áll/ • A hemoglobin O 2 telítési görbéje szigmoid (S alakú). /4 alegységből áll, és az alegységek között pozitív kooperativitás van: Az első alegység térszerkezete az O 2 kötés után megváltozik, ez kedvez a második alegység O 2 megkötésének/
- Slides: 31