AFLP Amplified Fragment Length Polymorphism Universidade Federal de

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AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) Universidade Federal de Pelotas Genômica II Profª Fabiana K.

AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism) Universidade Federal de Pelotas Genômica II Profª Fabiana K. Seixas Discentes: Carolina Georg Magalhães Drielly Braite Fernanda E. Valiati Fernanda M. Rodrigues Mariana Brutschin

AFLP �Técnica derivada da PCR utilizada para a definição de marcadores moleculares e detecção

AFLP �Técnica derivada da PCR utilizada para a definição de marcadores moleculares e detecção de polimorfismos; �Revela variabilidade a nível de DNA; �Técnica de DNA fingerprinting.

Princípio Amplificação seletiva por PCR de um subconjunto de fragmentos derivados da digestão total

Princípio Amplificação seletiva por PCR de um subconjunto de fragmentos derivados da digestão total do DNA genômico pelo uso de uma combinação de enzimas de corte raro e de corte frequente que clivam a molécula em sítios específicos.

Metodologia �A técnica é realizada em três etapas: 1. Digestão do DNA pelas enzimas

Metodologia �A técnica é realizada em três etapas: 1. Digestão do DNA pelas enzimas de restrição e a ligação de adaptadores 2: Amplificação � Pré-amplificação � Amplificação seletiva 3: Análise do gel

Metodologia

Metodologia

Metodologia �Combinação de enzimas: Importante para garantir a digestão completa da molécula de DNA,

Metodologia �Combinação de enzimas: Importante para garantir a digestão completa da molécula de DNA, uma vez que uma digestão parcial pode levar à caracterização de falsos polimorfismos. � Enzimas de corte raro: Eco. RI, Ase. I, Hind. III, Apa. I e Pst. I � Enzimas de corte frequente: Mse. I e Taq. I �DNA amostral: Precisa ter alta pureza, o que é essencial para que ocorra a digestão total do DNA genômico, sendo necessário o uso de um excelente método de extração e quantificação do DNA.

Metodologia

Metodologia

Metodologia Pré-amplificação

Metodologia Pré-amplificação

Metodologia s Amplificação seletiva

Metodologia s Amplificação seletiva

Metodologia - Análise final feita através de eletroforese em gel de policrilamida corado com

Metodologia - Análise final feita através de eletroforese em gel de policrilamida corado com nitrato de prata; - Polimorfismo detectado pela presença ou ausência de determinada banda

Aplicações Genética forense Teste de paternidade Diagnóstico de doenças hereditárias Construção de mapas genéticos

Aplicações Genética forense Teste de paternidade Diagnóstico de doenças hereditárias Construção de mapas genéticos

Vantagens �Grande poder de detecção de variabilidade genética; �Não é necessário o conhecimento prévio

Vantagens �Grande poder de detecção de variabilidade genética; �Não é necessário o conhecimento prévio da informação de sequências-alvo ; �Sensível; �Rápido; �Simples.

Obrigada

Obrigada