1RE STL BGB SCIENCES ET TECHNOLOGIES DE LABORATOIRE

1ÈRE STL BGB SCIENCES ET TECHNOLOGIES DE LABORATOIRE SPÉCIALITÉ BIOCHIMIE GÉNIE BIOLOGIQUE ANNEE 2010 -2011 LYCÉE GALILÉE - FRANQUEVILLE SAINT-PIERRE Parrainage BIOINFORMATIQUE avec le Laboratoire d’Informatique , Traitement de l’Information et des Systèmes (LITIS), Université de ROUEN

RESTITUTION BIOCHIMIE SUR LA COMPARAISON DE SÉQUENCE D’ADN. SOMMAIRE ü Étude du cancer de la rétine chez une personne malade et une personne saine ü De l’organisme au séquençage d’ADN ü La cellule l’unité de base des êtres vivant ü La microscopie à balayage ü Quelques rappels ü Du séquence d’ADN à la protéine ü Gènes est séquençage d’ADN ü Comparaison d’une séquence d’ADN ü Conclusion

NOUS INTÉRESSERONS AU RÉTINOBLASTOME ( SOIT LE CANCER DE LA RÉTINE ) Enfant malade La rétinoblastome est un cancer apparaissant habituellement avant 5 ans. Ce cancer peut atteindre un ou les deux yeux. Il y a deux signes qui indiquent qu’il y a risque de rétinoblastome: • un reflet blanchâtre de la pupille • un strabisme → À quoi est dû cette pathologie ? → Comment peut-on la déceler ? Nous tâcherons de le savoir, en zoomant dans l’organisme de personne saine et malade. Enfant sain

DE L’ORGANISME AU SÉQUENÇAGE D’ADN. Le corps humain Zoom sur le Si nous tissus nerveux continuons vers une de zoomer … cellule

LA CELLULE EST L’UNITÉ DE BASE DES ÊTRES VIVANTS

MICROSCOPIE ÉLECTRONIQUE À BALAYAGE Un chromosome x Comment ça marche un microscope électronique ? - Même principe que la microscopie optique - Rayon incident constitué d'un faisceau d'électrons au lieu d'un rayon de lumière visible. - Une image réfléchie agrandie jusqu'à 100 000 fois ou plus. Chromosomes au microscope électronique à balayage

TOUT D’ABORD, UN PETIT RAPPEL… Phosphate Adénine Sucre A-C-A-T-C-C-T T-G-T-A-G-G-A

SÉQUENCE ADN VERS LA PROTÉINE Processus de transcription, de l’ADN vers une protéine

GÈNES ET SÉQUENÇAGE D’ADN • DÉFINITION D’UN GÈNE Unité d'hérédité contrôlant un caractère particulier. Cet élément génétique correspondant à un segment d'ADN ou d'ARN (virus), situé à un endroit bien précis sur un chromosome. Chaque région de l'ADN qui produit une molécule d'ARN fonctionnelle est un gène. • DÉFINITION DU SÉQUENÇAGE D’ADN Procédé utilisé pour déterminer l'ordre (la séquence) des acides aminés d'une protéine ou des bases dans les acides nucléiques (ADN et ARN).

COMPARAISON D’UNE SÉQUENCE Sujet sain Sujet malade D’ADN Séquence d’ADN GCTCAGTTGCCGGGGGAGGGCGCGTCCGGTTTTTCTCAGGGGACGTTGAAATT GAGTCGGGAGAGGACGGGGCGTGCCCCGACGTGCGCGTCGTCCTCCCCGGCG GCTGGCTCCCGCCGCGGAAAGGCGTCATGCCGCCCAAAACCCCCCGAAAAACGGCC TGCCGCCGCGGAACCCCCGGCACCGCCGCCCCCTCCTGAGGAGGACCCAG CCGGAGGACCTGCCTCTCGTCAGGCTTGAGTTTGAAGAAACAGAAGAACCTGATTTT AGAAATTAAAGATACCAGATCATGTCAGAGAGCTTGGTTAACTTGGGAGAAA GCTCAGTTGCCGGGGGAGGGCGCGTCCGGTTTTTCTCAGGGGACGTTGAAATTATTTT GAGTCGGGAGAGGACGGGGCGTGCCCCGACGTGCGCGTCGTCCTCCCCGGCGCTCCT GCTGGCTCCCGCCGCGGAAAGGCGTCATGCCGCCCAAAACCCCCCGAAAAACGGCCGCCA TGCCGCCGCGGAACCCCCGGCACCGCCGCCCCCTCCTGAGGAGGACCCAGAGCAG CCGGAGGACCTGCCTCTCGTCAGGCTTGAGTTTGAAGAAACAGAAGAACCTGATTTTACTG AGAAATTAAAGATACCAGATCATGTCAGAGAGCTTGGTTAACTTGGGAGAAAGTTTC Protéine Séquence d’acide aminé K= Lysine N= Asparagine

EN RÉSUMÉ Mutation entre Séquence ADN du sujet SAIN sujet MALADE Entraîn e Séquence ADN du LA SYNTHÈSE D’UNE PROTÉINE AYANT UN ACIDE AMINÉ DIFFÉRENT K(= Lysine ) devient N (= Asparagine ) Protéine anormale Provoque le cancer de la détermine la maladie rétine (Rétinoblastome)

N La bio informatique correspondant essentiellement à de l’analyse de données ( séquence d’ADN ou de séquence peptidique ) avec des logiciels informatiques. Il n’y a donc que peu de manipulations. Tout le travail expérimental en laboratoire est fait préalablement à partir de cellule et d’ADN. Cette expérience nous a permis de connaitre davantage - le fonctionnement de notre organisme. - le métier d’enseignant chercheur. Merci à tous de votre accueil , de vos explications et de votre temps.