0 Dermatology 2006 SNU Dermatolory Lab Bioinformatics for

유사성 검색 분자유전체의학 김윤경 0 Dermatology 2006 SNU Dermatolory Lab

Bioinformatics for Genomic Medicine CONTENTS • FASTA 알고리즘 • BLAST 알고리즘 • 통계적 유의성 • 다중정렬 • 계통발생분석 (Phylogenetic Analysis) • SA (simulated annealing) • 유전자 알고리즘 1 Dermatology 2006 SNU Dermatolory Lab

Bioinformatics for Genomic Medicine BLAST 알고리즘- program의 종류 BLAST program의 종류 - BLASTP : 단백질 서열간의 비교 - BLASTN : 염기 서열간의 비교 - BLASTX : 입력한 염기서열을 6개의 frame으로 변환 후 단백질 서열 database 와 비교 - TBLASTN : 염기서열 database를 6 frame으로 변환 후 입력한 단백질 서열과 비교 - TBLASTX : 입력한 염기 서열과 염기서열 database를 모두 6 frame으로 변환 후 비교 15 Dermatology 2006 SNU Dermatolory Lab